Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120905_1000_2ndset_pl10_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex4in4                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120905_1000_2ndset_pl10_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/5/12 11:57:09 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 3                                                    
26 - 2 Copies: 9                                                    
27 - 3 Copies: 3                                                    
28                                                      
29 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
30 - Negative control sample well: 2                                                    
31                                                      
32 Delta Ct variance: 0.2284                                                    
33                                                      
34                                                      
35 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
36 10-239 4 30.4532 29.7137 0.7396     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 1.75 2 0.73 0.08 2 2 29.9061 29.3735 0.5327 0.29 0.19 0.87 1.52 2.02 0.50
37 10-239 16 29.3590 29.0333 0.3258         10                                
38 10-240 28 29.3675 28.4410 0.9266     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 1.64 2 0.63 0.19 2 2 28.7548 28.1268 0.6281 0.42 0.29 0.82 1.33 2.01 0.68
39 10-240 40 28.1422 27.8126 0.3296         10                                
40 10-241 52 28.7692 28.9599 -0.1907     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 2.64 3 < 0.50 0.08 2 2 29.1846 29.2476 -0.0630 0.18 -0.40 1.32 2.42 2.89 0.47
41 10-241 64 29.6000 29.5352 0.0648         10                                
42 10-245 76 29.0221 28.7281 0.2940     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 2.43 2 < 0.50 0.33 2 2 28.5289 28.4708 0.0581 0.33 -0.28 1.22 2.06 2.86 0.80
43 10-245 88 28.0357 28.2134 -0.1777         10                                
44 10-246 100 29.3795 28.4746 0.9049     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 1.47 1 < 0.50 1.48 2 2 29.3137 28.5279 0.7858 0.17 0.45 0.73 1.35 1.59 0.24
45 10-246 112 29.2480 28.5812 0.6668         10                                
46 10-249 124 28.4091 27.2329 1.1763     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 0.99 1 < 0.50 0.07 2 2 28.5371 27.1854 1.3517 0.25 1.01 0.50 0.88 1.12 0.24
47 10-249 136 28.6650 27.1379 1.5271         10                                
48 10-251 148 29.8736 29.0563 0.8173     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 1.77 2 0.74 0.08 2 2 29.7147 29.1977 0.5170 0.42 0.18 0.88 1.44 2.18 0.74
49 10-251 160 29.5558 29.3392 0.2166         10                                
50 10-252 172 27.6264 26.8934 0.7330     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 1.52 2 0.63 0.35 2 2 27.6994 26.9607 0.7387 0.01 0.40 0.76 1.51 1.52 0.01
51 10-252 184 27.7724 27.0280 0.7443         10                                
52 10-254 196 26.7449 26.9054 -0.1605     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 3.33 3 < 0.50 0.10 2 2 26.3668 26.7611 -0.3943 0.33 -0.73 1.66 2.83 3.91 1.08
53 10-254 208 25.9886 26.6167 -0.6281         10                                
54 10-255 220 27.8696 27.9955 -0.1259     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 1.98 2 0.54 0.09 2 2 28.4773 28.1232 0.3541 0.68 0.01 0.99 1.42 2.76 1.34
55 10-255 232 29.0850 28.2509 0.8341         10                                
56 10-256 244 28.8891 28.3930 0.4962     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 1.75 2 0.71 0.09 2 2 28.9686 28.4336 0.5350 0.05 0.20 0.87 1.70 1.79 0.09
57 10-256 256 29.0481 28.4743 0.5738         10                                
58 10-257 268 28.2580 27.7166 0.5414     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 2.19 2 < 0.50 0.12 2 2 27.7145 27.5033 0.2112 0.47 -0.13 1.09 1.74 2.75 1.01
59 10-257 280 27.1709 27.2899 -0.1190         10                                
60 10-258 292 28.2482 26.5694 1.6788     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 0.96 1 < 0.50 0.10 2 2 27.9763 26.5797 1.3966 0.40 1.06 0.48 0.79 1.17 0.38
61 10-258 304 27.7044 26.5901 1.1143         10                                
62 10-259 316 28.9608 29.0705 -0.1097     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 2.57 3 < 0.50 0.14 2 2 28.8630 28.8865 -0.0235 0.12 -0.36 1.29 2.42 2.73 0.31
63 10-259 328 28.7651 28.7025 0.0626         10                                
64 DNActrl 364 24.5359 24.1697 0.3662     MAP2K4ex4in4 RNase P 10 2.00 2 0.61 0.10 2 2 24.4131 24.0732 0.3399 0.04 0.00 1.00 1.96 2.04 0.07
65 DNActrl 376 24.2904 23.9767 0.3137         10                                
66 NTC 340 39.7906 undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex4in4 RNase P 10         2                    
67 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC     10