Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120905_1000_2ndset_pl11_01_2.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex4in4                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120905_1000_2ndset_pl11_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/5/12 1:49:11 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 1 Copy: 4                                                    
28 - 2 Copies: 6                                                    
29 - 3 Copies: 4                                                    
30 - 4 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35                                                      
36 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
37 10-260 4 28.9867 28.9333 0.0534     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 2.95 3     2 2 28.4421 28.3231 0.1189 0.09 -0.56 1.48 2.82 3.09 0.27
38 10-260 16 27.8974 27.7129 0.1845         11                                
39 10-264 28 32.0244 30.4165 1.6079     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 1.82 2     2 2 31.2878 30.4678 0.8200 1.11 0.14 0.91 1.05 3.14 2.08
40 10-264 40 30.5512 30.5191 0.0321         11                                
41 10-266 52 30.3858 29.5329 0.8529     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 1.97 2     2 2 30.0816 29.3778 0.7037 0.21 0.02 0.98 1.78 2.18 0.41
42 10-266 64 29.7773 29.2227 0.5546         11                                
43 10-267 76 29.1403 29.7061 -0.5658     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 3.53 4     2 2 29.3270 29.4674 -0.1404 0.60 -0.82 1.77 2.63 4.75 2.11
44 10-267 88 29.5136 29.2287 0.2849         11                                
45 10-268 100 30.2206 30.0875 0.1331     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 2.90 3     2 2 30.0737 29.9264 0.1473 0.02 -0.53 1.45 2.87 2.92 0.06
46 10-268 112 29.9268 29.7654 0.1615         11                                
47 10-270 124 30.5332 30.0002 0.5331     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 2.37 2     2 2 29.6468 29.2096 0.4372 0.14 -0.24 1.18 2.22 2.53 0.32
48 10-270 136 28.7603 28.4190 0.3412         11                                
49 10-272T 148 28.1603 28.1378 0.0225     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 2.89 3     2 2 28.3228 28.1726 0.1502 0.18 -0.53 1.44 2.64 3.16 0.51
50 10-272T 160 28.4853 28.2074 0.2778         11                                
51 10-273 172 29.6461 30.2054 -0.5593     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 3.26 3     2 2 30.0321 30.0571 -0.0250 0.76 -0.71 1.63 2.25 4.72 2.47
52 10-273 184 30.4182 29.9088 0.5093         11                                
53 10-275 196 31.1375 30.4904 0.6470     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 1.67 2     2 2 31.0483 30.1056 0.9427 0.42 0.26 0.83 1.36 2.05 0.69
54 10-275 208 30.9591 29.7208 1.2384         11                                
55 10-276 220 29.8464 28.6633 1.1831     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 1.27 1     2 2 30.1553 28.8189 1.3364 0.22 0.66 0.63 1.14 1.41 0.27
56 10-276 232 30.4643 28.9746 1.4897         11                                
57 10-277 244 30.3418 29.1138 1.2280     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 1.35 1     2 2 29.8535 28.6030 1.2505 0.03 0.57 0.67 1.33 1.37 0.04
58 10-277 256 29.3652 28.0921 1.2731         11                                
59 10-280 268 33.8484 32.0488 1.7996     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 1.59 2     2 2 32.8842 31.8713 1.0129 1.11 0.33 0.79 0.92 2.74 1.82
60 10-280 280 31.9200 31.6939 0.2261         11                                
61 10-281T 292 30.8489 29.5959 1.2530     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 1.40 1     2 2 31.0063 29.8151 1.1911 0.09 0.51 0.70 1.35 1.47 0.12
62 10-281T 304 31.1637 30.0344 1.1293         11                                
63 10-282 316 31.4554 29.5300 1.9254     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 0.94 1     2 2 30.4384 28.6637 1.7747 0.21 1.09 0.47 0.84 1.04 0.20
64 10-282 328 29.4215 27.7974 1.6241         11                                
65 DNActrl 364 26.0238 25.2294 0.7945     MAP2K4ex4in4 RNase P 11 2.00 2     2 2 25.2866 24.6057 0.6809 0.16 0.00 1.00 1.85 2.16 0.32
66 DNActrl 376 24.5494 23.9821 0.5673         11                                
67 NTC 340 36.7090 undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex4in4 RNase P 11         2                    
68 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC     11