Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120906_1000_2ndset_pl13_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex4in4                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120906_1000_2ndset_pl13                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/6/12 11:51:14 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 0 Copy: 2                                                    
27 - 1 Copy: 9                                                    
28 - 2 Copies: 3                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
31 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34 Delta Ct variance: 0.3205                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-302 4 32.5952 30.1360 2.4592     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.50 0     2 2 32.0724 29.8483 2.2240 0.33 2.01 0.25 0.42 0.58 0.16
39 10-302 16 31.5495 29.5606 1.9889         13                                
40 10-306T 28 32.5211 30.3724 2.1487     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.74 1 0.90 0.12 2 2 31.9073 30.2559 1.6515 0.70 1.44 0.37 0.52 1.04 0.52
41 10-306T 40 31.2936 30.1394 1.1543         13                                
42 10-307 52 31.4879 29.1990 2.2889     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.70 1 0.91 0.15 2 2 31.1905 29.4555 1.7349 0.78 1.52 0.35 0.47 1.02 0.55
43 10-307 64 30.8930 29.7121 1.1809         13                                
44 10-308 76 31.0106 29.5094 1.5011     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.62 1 0.97 0.38 2 2 31.2292 29.3217 1.9075 0.57 1.69 0.31 0.47 0.82 0.35
45 10-308 88 31.4478 29.1340 2.3139         13                                
46 10-309 100 30.9290 29.3246 1.6044     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.90 1 0.75 0.08 2 2 30.5866 29.2255 1.3611 0.34 1.15 0.45 0.76 1.07 0.31
47 10-309 112 30.2441 29.1263 1.1178         13                                
48 10-310 124 31.9150 31.0869 0.8281     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 2.11 2 < 0.50 0.05 2 2 30.8482 30.7135 0.1347 0.98 -0.08 1.06 1.31 3.42 2.11
49 10-310 136 29.7814 30.3401 -0.5587         13                                
50 10-311 148 29.7041 28.4856 1.2185     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 1.29 1 < 0.50 0.92 2 2 29.4320 28.5873 0.8447 0.53 0.63 0.65 1.00 1.67 0.68
51 10-311 160 29.1599 28.6889 0.4709         13                                
52 10-313 172 30.6896 29.8432 0.8464     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 1.52 2 < 0.50 0.13 2 2 30.0227 29.4164 0.6063 0.34 0.39 0.76 1.29 1.80 0.51
53 10-313 184 29.3558 28.9896 0.3662         13                                
54 10-314 196 34.1189 30.9643 3.1546     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.47 0     2 2 32.0811 29.7637 2.3174 1.18 2.10 0.23 0.26 0.83 0.57
55 10-314 208 30.0434 28.5631 1.4803         13                                
56 10-316 220 29.5427 28.0851 1.4576     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.84 1 0.81 0.09 2 2 29.3707 27.9098 1.4609 0.00 1.25 0.42 0.84 0.84 0.00
57 10-316 232 29.1986 27.7344 1.4642         13                                
58 10-321 244 29.9745 28.9054 1.0691     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.89 1 0.68 0.09 2 2 29.8721 28.4852 1.3869 0.45 1.17 0.44 0.71 1.11 0.39
59 10-321 256 29.7698 28.0651 1.7047         13                                
60 10-322 268 30.5155 28.9423 1.5732     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 0.71 1 0.90 0.22 2 2 30.5524 28.8493 1.7031 0.18 1.49 0.36 0.65 0.78 0.13
61 10-322 280 30.5892 28.7562 1.8330         13                                
62 10-323 292 undetermined 36.0235 undetermined x VICET MAP2K4ex4in4 RNase P 13         2                    
63 10-323 304 undetermined 38.6635 undetermined x VICET     13                                
64 10-324 316 29.9014 29.0921 0.8094     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 1.09 1 < 0.50 0.24 2 2 29.9430 28.8495 1.0935 0.40 0.88 0.54 0.89 1.32 0.43
65 10-324 328 29.9846 28.6069 1.3777         13                                
66 DNActrl 364 24.7804 24.4735 0.3070     MAP2K4ex4in4 RNase P 13 2.00 2 < 0.50 0.05 2 2 24.6310 24.4178 0.2132 0.13 0.00 1.00 1.87 2.13 0.26
67 DNActrl 376 24.4816 24.3621 0.1194         13                                
68 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex4in4 RNase P 13         2                    
69 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC     13