Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl26_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex4in4                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl26_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 2:09:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 5                                                    
26 - 2 Copies: 10                                                    
27                                                      
28 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
29 - Negative control sample well: 2                                                    
30                                                      
31 Delta Ct variance: 0.2146                                                    
32                                                      
33                                                      
34 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
35 10-716 4 29.9006 28.3520 1.5486     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.00 1 0.51 0.10 2 2 29.6388 28.2137 1.4251 0.17 1.00 0.50 0.92 1.09 0.17
36 10-716 16 29.3770 28.0754 1.3016         26                                
37 10-717 28 28.5056 28.2217 0.2840     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 2.33 2 0.78 0.15 2 2 28.2701 28.0645 0.2056 0.11 -0.22 1.17 2.21 2.46 0.25
38 10-717 40 28.0346 27.9074 0.1272         26                                
39 10-722T 52 29.5599 28.3713 1.1886     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.29 1 < 0.50 0.41 2 2 29.5526 28.4876 1.0650 0.17 0.64 0.64 1.18 1.40 0.22
40 10-722T 64 29.5453 28.6039 0.9414         26                                
41 10-726 76 32.8351 32.4351 0.4000     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.65 2 < 0.50 0.45 2 2 32.7744 32.0714 0.7030 0.43 0.27 0.83 1.34 2.04 0.70
42 10-726 88 32.7138 31.7078 1.0060         26                                
43 10-730 100 28.8950 28.4572 0.4378     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 2.03 2 0.89 0.08 2 2 28.7197 28.3143 0.4054 0.05 -0.02 1.02 1.99 2.08 0.09
44 10-730 112 28.5444 28.1715 0.3730         26                                
45 10-731 124 27.8910 27.6373 0.2537     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 2.38 2 0.77 0.29 2 2 28.2321 28.0524 0.1798 0.10 -0.25 1.19 2.26 2.50 0.24
46 10-731 136 28.5733 28.4674 0.1059         26                                
47 10-732 148 28.6298 28.1458 0.4841     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 2.28 2 0.83 0.21 2 2 28.5741 28.3363 0.2378 0.35 -0.19 1.14 1.92 2.71 0.78
48 10-732 160 28.5184 28.5268 -0.0084         26                                
49 10-733 172 27.9476 27.4374 0.5102     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 2.09 2 0.85 0.15 2 2 27.7501 27.3816 0.3685 0.20 -0.06 1.04 1.89 2.30 0.41
50 10-733 184 27.5525 27.3257 0.2268         26                                
51 10-734 196 34.2385 32.4238 1.8147     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.13 1 < 0.50 0.13 2 2 33.8116 32.5560 1.2555 0.79 0.83 0.56 0.77 1.66 0.90
52 10-734 208 33.3846 32.6883 0.6963         26                                
53 10-735 220 31.0883 31.1943 -0.1059     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 2.16 2 0.77 0.16 2 2 31.4270 31.1120 0.3150 0.60 -0.11 1.08 1.62 2.90 1.28
54 10-735 232 31.7657 31.0298 0.7359         26                                
55 10-738 244 30.8020 29.3422 1.4597     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.07 1 < 0.50 0.11 2 2 30.6313 29.2985 1.3328 0.18 0.90 0.53 0.98 1.17 0.19
56 10-738 256 30.4607 29.2548 1.2059         26                                
57 10-739 268 30.9008 30.1423 0.7586     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.54 2 < 0.50 0.62 2 2 29.9378 29.1345 0.8033 0.06 0.37 0.77 1.50 1.59 0.10
58 10-739 280 28.9747 28.1268 0.8480         26                                
59 10-747 292 30.9204 29.9654 0.9550     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.90 2 0.71 0.17 2 2 30.2491 29.7464 0.5027 0.64 0.07 0.95 1.39 2.60 1.21
60 10-747 304 29.5778 29.5275 0.0503         26                                
61 10-748 316 29.0039 28.4101 0.5938     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 1.50 1 < 0.50 1.20 2 2 29.2671 28.4220 0.8451 0.36 0.42 0.75 1.26 1.78 0.52
62 10-748 328 29.5303 28.4338 1.0965         26                                
63 DNActrl 364 24.0929 23.6412 0.4517     MAP2K4ex4in4 RNase P 26 2.00 2 0.82 0.09 2 2 23.9834 23.5547 0.4288 0.03 0.00 1.00 1.97 2.03 0.06
64 DNActrl 376 23.8739 23.4681 0.4059         26                                
65 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex4in4 RNase P 26         2                    
66 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC     26