Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120913_1000_2ndset_pl28_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex4in4                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120913_1000_2ndset_pl28_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/13/12 11:28:32 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 12                                                    
26 - 2 Copies: 3                                                    
27                                                      
28 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
29 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
30 - Negative control sample well: 2                                                    
31                                                      
32 Delta Ct variance: 0.4147                                                    
33                                                      
34                                                      
35 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
36 10-784 4 30.9005 28.6776 2.2229     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.57 1 0.98 0.52 2 2 30.4445 28.4907 1.9538 0.38 1.82 0.28 0.47 0.68 0.21
37 10-784 16 29.9885 28.3037 1.6847         28                                
38 10-785 28 33.2272 31.2815 1.9457     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.91 1 0.79 0.07 2 2 32.3238 31.0555 1.2683 0.96 1.14 0.45 0.57 1.46 0.89
39 10-785 40 31.4204 30.8295 0.5909         28                                
40 10-786 52 30.0494 29.1104 0.9390     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 1.20 1 < 0.50 0.50 2 2 30.1541 29.2859 0.8682 0.10 0.74 0.60 1.14 1.26 0.12
41 10-786 64 30.2589 29.4614 0.7974         28                                
42 10-789 76 35.2580 33.2225 2.0355 x VICET MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.59 1 0.96 0.22 2 1 34.8055 32.9033 1.9022 0.00 1.77 0.29 0.59 0.59 0.00
43 10-789 88 34.8055 32.9033 1.9022         28                                
44 10-791 100 31.4818 29.6260 1.8559     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.61 1 0.96 0.16 2 2 31.2575 29.4230 1.8345 0.03 1.70 0.31 0.61 0.62 0.02
45 10-791 112 31.0331 29.2200 1.8131         28                                
46 10-792 124 29.3617 28.2299 1.1319     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.98 1 0.73 0.06 2 2 29.4220 28.2591 1.1629 0.04 1.03 0.49 0.96 1.00 0.04
47 10-792 136 29.4822 28.2883 1.1939         28                                
48 10-793 148 29.7326 29.0900 0.6426     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 1.57 2 < 0.50 0.05 2 2 29.7386 29.2598 0.4788 0.23 0.35 0.79 1.40 1.76 0.36
49 10-793 160 29.7446 29.4297 0.3149         28                                
50 10-795a 172 29.5280 28.7234 0.8046     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 1.09 1 0.53 0.28 2 2 29.4659 28.4640 1.0019 0.28 0.87 0.55 0.95 1.25 0.30
51 10-795a 184 29.4039 28.2047 1.1992         28                                
52 10-797 196 30.5491 30.0158 0.5333     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 1.56 2 < 0.50 0.03 2 2 30.6364 30.1485 0.4879 0.06 0.36 0.78 1.51 1.61 0.10
53 10-797 208 30.7238 30.2812 0.4425         28                                
54 10-800 220 29.1903 28.6847 0.5057     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 1.21 1 < 0.50 0.40 2 2 29.3386 28.4861 0.8525 0.49 0.72 0.61 0.95 1.54 0.59
55 10-800 232 29.4869 28.2876 1.1992         28                                
56 10-803 244 30.9381 29.7702 1.1679     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 1.09 1 0.64 0.27 2 2 31.1676 30.1577 1.0099 0.22 0.88 0.54 0.98 1.21 0.24
57 10-803 256 31.3971 30.5452 0.8519         28                                
58 10-805 268 32.3118 29.8252 2.4866     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.53 1 0.99 0.54 2 2 31.9031 29.8441 2.0590 0.60 1.93 0.26 0.39 0.71 0.32
59 10-805 280 31.4945 29.8630 1.6315         28                                
60 10-807 292 30.8721 29.6875 1.1846     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.80 1 0.87 0.04 2 2 31.3035 29.8546 1.4489 0.37 1.32 0.40 0.67 0.96 0.30
61 10-807 304 31.7349 30.0218 1.7131         28                                
62 10-808 316 32.3479 30.6048 1.7431     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 0.80 1 0.91 0.06 2 2 32.2782 30.8274 1.4508 0.41 1.32 0.40 0.65 0.98 0.33
63 10-808 328 32.2084 31.0499 1.1585         28                                
64 DNActrl 364 23.9706 23.8246 0.1460     MAP2K4ex4in4 RNase P 28 2.00 2 < 0.50 0.00 2 2 23.9381 23.8061 0.1320 0.02 0.00 1.00 1.98 2.02 0.04
65 DNActrl 376 23.9055 23.7877 0.1179         28                                
66 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex4in4 RNase P 28         2                    
67 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC     28