Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120904_1000_2ndset_pl7_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex4in4                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120904_1000_2ndset_pl7_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/4/12 12:01:44 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 10                                                    
26 - 2 Copies: 4                                                    
27 - 3 Copies: 1                                                    
28                                                      
29 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
30 - Negative control sample well: 2                                                    
31                                                      
32 Delta Ct variance: 0.3879                                                    
33                                                      
34                                                      
35 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
36 10-156 4 29.6349 26.8696 2.7654     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 0.60 1 0.97 0.31 2 2 28.6102 26.3421 2.2681 0.70 1.74 0.30 0.42 0.85 0.42
37 10-156 16 27.5855 25.8146 1.7709         7                                
38 10-157 28 29.3307 28.6094 0.7213     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 2.64 3 < 0.50 0.15 2 2 28.7416 28.6090 0.1325 0.83 -0.40 1.32 1.75 3.96 2.21
39 10-157 40 28.1524 28.6087 -0.4563         7                                
40 10-159 52 27.8675 26.8040 1.0635     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 1.45 1 < 0.50 0.80 2 2 27.8899 26.8984 0.9915 0.10 0.46 0.73 1.38 1.53 0.15
41 10-159 64 27.9124 26.9928 0.9195         7                                
42 10-161 76 28.7661 28.1910 0.5751     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 2.27 2 < 0.50 0.03 2 2 28.2854 27.9394 0.3460 0.32 -0.18 1.14 1.94 2.66 0.72
43 10-161 88 27.8046 27.6877 0.1169         7                                
44 10-162 100 29.4599 28.6112 0.8487     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 1.39 1 < 0.50 0.65 2 2 29.9823 28.9266 1.0557 0.29 0.53 0.69 1.20 1.60 0.40
45 10-162 112 30.5048 29.2420 1.2628         7                                
46 10-165 124 29.3196 27.3310 1.9886     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 0.95 1 0.80 0.06 2 2 28.6160 27.0058 1.6102 0.54 1.08 0.47 0.73 1.23 0.50
47 10-165 136 27.9123 26.6807 1.2317         7                                
48 10-171 148 29.5111 27.4699 2.0412     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 0.72 1 0.94 0.22 2 2 29.2577 27.2468 2.0109 0.04 1.48 0.36 0.70 0.73 0.03
49 10-171 160 29.0043 27.0238 1.9805         7                                
50 10-172 172 27.7170 27.0396 0.6774     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 1.94 2 < 0.50 0.05 2 2 27.6263 27.0527 0.5736 0.15 0.04 0.97 1.81 2.09 0.28
51 10-172 184 27.5356 27.0658 0.4698         7                                
52 10-175T 196 29.6701 27.5241 2.1459     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 0.77 1 0.91 0.11 2 2 29.2333 27.3176 1.9157 0.33 1.39 0.38 0.65 0.90 0.25
53 10-175T 208 28.7965 27.1111 1.6854         7                                
54 10-176 220 30.4661 28.5070 1.9591     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 0.96 1 0.70 0.07 2 2 30.2270 28.6404 1.5866 0.53 1.06 0.48 0.74 1.25 0.50
55 10-176 232 29.9879 28.7739 1.2140         7                                
56 10-181 244 28.5485 26.4827 2.0659     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 1.01 1 0.60 0.07 2 2 27.7121 26.1998 1.5122 0.78 0.98 0.51 0.69 1.49 0.80
57 10-181 256 26.8756 25.9170 0.9586         7                                
58 10-183 268 27.8776 27.2567 0.6209     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 2.10 2 < 0.50 0.05 2 2 27.8622 27.4023 0.4599 0.23 -0.07 1.05 1.88 2.35 0.47
59 10-183 280 27.8468 27.5479 0.2989         7                                
60 10-184 292 30.2280 27.6284 2.5996     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 0.59 1 0.97 0.50 2 2 29.7744 27.4868 2.2876 0.44 1.76 0.30 0.48 0.73 0.26
61 10-184 304 29.3208 27.3453 1.9755         7                                
62 10-185 316 30.0544 28.0438 2.0106     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 0.97 1 0.75 0.06 2 2 29.5041 27.9311 1.5729 0.62 1.04 0.49 0.72 1.32 0.60
63 10-185 328 28.9537 27.8185 1.1352         7                                
64 DNActrl 364 24.9379 24.3121 0.6258     MAP2K4ex4in4 RNase P 7 2.00 2 < 0.50 0.03 2 2 24.8241 24.2937 0.5305 0.13 0.00 1.00 1.87 2.14 0.26
65 DNActrl 376 24.7104 24.2753 0.4351         7                                
66 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex4in4 RNase P 7         2                    
67 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC     7