Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120831_1000_2ndset_pl1_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120831_1000_2ndset_pl1_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 8/31/12 10:46:15 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 14                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 0 Copy: 2                                                    
29 - 1 Copy: 6                                                    
30 - 2 Copies: 3                                                    
31 - 4 Copies: 1                                                    
32                                                      
33 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-001 7 undetermined 36.5529 undetermined x VICET PSMD3ex1in1 RNase P 1         2                    
40 10-001 19 undetermined 33.9343 undetermined x VICET     1                                
41 10-004 31 31.2181 29.5560 1.6622     PSMD3ex1in1 RNase P 1 1.15 1     2 2 30.4598 28.7078 1.7520 0.13 0.80 0.58 1.08 1.22 0.14
42 10-004 43 29.7016 27.8596 1.8419         1                                
43 10-008 55 25.8410 24.4145 1.4265     PSMD3ex1in1 RNase P 1 1.40 1     2 2 25.8990 24.4264 1.4726 0.07 0.52 0.70 1.35 1.44 0.09
44 10-008 67 25.9570 24.4383 1.5187         1                                
45 10-009b 79 30.1830 29.2967 0.8863     PSMD3ex1in1 RNase P 1 1.90 2     2 2 29.8867 28.8576 1.0290 0.20 0.08 0.95 1.72 2.10 0.38
46 10-009b 91 29.5904 28.4186 1.1718         1                                
47 10-010 103 31.5355 29.6372 1.8983     PSMD3ex1in1 RNase P 1 1.03 1     2 2 31.3512 29.4343 1.9169 0.03 0.96 0.51 1.01 1.04 0.03
48 10-010 115 31.1669 29.2313 1.9356         1                                
49 10-012 127 29.6376 27.8957 1.7420     PSMD3ex1in1 RNase P 1 1.18 1     2 2 29.4282 27.7105 1.7177 0.03 0.76 0.59 1.16 1.20 0.04
50 10-012 139 29.2187 27.5253 1.6935         1                                
51 10-015 151 27.3751 27.2603 0.1148     PSMD3ex1in1 RNase P 1 4.14 4     2 2 27.1246 27.2193 -0.0948 0.30 -1.05 2.07 3.58 4.78 1.21
52 10-015 163 26.8740 27.1784 -0.3044         1                                
53 10-016 175 27.6244 26.8986 0.7258     PSMD3ex1in1 RNase P 1 2.25 2     2 2 27.5060 26.7242 0.7818 0.08 -0.17 1.13 2.17 2.34 0.18
54 10-016 187 27.3875 26.5497 0.8378         1                                
55 10-017 199 32.1397 28.7838 3.3559     PSMD3ex1in1 RNase P 1 0.46 0     2 2 31.5824 28.5078 3.0746 0.40 2.12 0.23 0.38 0.56 0.18
56 10-017 211 31.0252 28.2318 2.7933         1                                
57 10-020 223 29.8476 27.6535 2.1941     PSMD3ex1in1 RNase P 1 0.85 1     2 2 29.9278 27.7460 2.1818 0.02 1.23 0.43 0.85 0.86 0.01
58 10-020 235 30.0081 27.8385 2.1696         1                                
59 10-022T 247 33.3999 30.5716 2.8282     PSMD3ex1in1 RNase P 1 0.46 0     2 2 33.4599 30.3763 3.0836 0.36 2.13 0.23 0.38 0.55 0.16
60 10-022T 259 33.5199 30.1809 3.3390         1                                
61 10-024 271 29.9623 28.1357 1.8266     PSMD3ex1in1 RNase P 1 0.93 1     2 2 29.8886 27.8340 2.0546 0.32 1.10 0.47 0.80 1.09 0.30
62 10-024 283 29.8148 27.5322 2.2826         1                                
63 DNActrl 319 25.5576 24.6484 0.9092     PSMD3ex1in1 RNase P 1 2.00 2     6 6 25.3879 24.4339 0.9540 0.24 0.00 1.00 1.57 2.49 0.92
64 DNActrl 331 25.4811 24.1768 1.3043         1                                
65 DNActrl 343 25.2649 24.4140 0.8510         1                                
66 DNActrl 355 25.6425 24.4641 1.1784         1                                
67 DNActrl 367 25.3818 24.5388 0.8430         1                                
68 DNActrl 379 24.9994 24.3611 0.6383         1                                
69 NTC 295 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3ex1in1 RNase P 1         2                    
70 NTC 307 undetermined undetermined undetermined x NTC     1