Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120906_1000_2ndset_pl15_01_2.txt                                                    
5 Target name: PSMD3ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120906_1000_2ndset_pl15_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/6/12 3:38:38 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 1 Copy: 8                                                    
27 - 2 Copies: 3                                                    
28 - 3 Copies: 1                                                    
29 - 5 Copies: 1                                                    
30 - 7 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
33 - Undetermined VIC Ct: 2                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36 Delta Ct variance: 0.4075                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-346 7 26.5898 28.3425 -1.7527     PSMD3ex1in1 RNase P 15 7.21 7 < 0.50 0.14 2 2 27.9999 29.1285 -1.1286 0.88 -1.85 3.60 4.68 11.11 6.43
41 10-346 19 29.4100 29.9146 -0.5046         15                                
42 10-347 31 27.5203 26.6176 0.9028     PSMD3ex1in1 RNase P 15 1.77 2 < 0.50 0.05 2 2 27.9705 27.0736 0.8969 0.01 0.18 0.88 1.76 1.78 0.01
43 10-347 43 28.4208 27.5297 0.8911         15                                
44 10-348 55 28.3700 27.8929 0.4770     PSMD3ex1in1 RNase P 15 2.72 3 < 0.50 0.11 2 2 29.3151 29.0395 0.2755 0.28 -0.45 1.36 2.37 3.13 0.76
45 10-348 67 30.2601 30.1861 0.0740         15                                
46 10-349 79 27.9943 27.6332 0.3611     PSMD3ex1in1 RNase P 15 2.29 2 < 0.50 0.01 2 2 28.8396 28.3138 0.5259 0.23 -0.19 1.14 2.04 2.57 0.52
47 10-349 91 29.6849 28.9943 0.6906         15                                
48 10-353 103 35.5687 undetermined undetermined x NOVIC PSMD3ex1in1 RNase P 15         2                    
49 10-353 115 undetermined undetermined undetermined x NOVIC     15                                
50 10-356 127 30.5971 29.6537 0.9433     PSMD3ex1in1 RNase P 15 0.94 1 0.73 0.06 2 2 31.7283 29.9236 1.8047 1.22 1.08 0.47 0.52 1.71 1.19
51 10-356 139 32.8595 30.1935 2.6660         15                                
52 10-357 151 29.7679 29.0678 0.7001     PSMD3ex1in1 RNase P 15 1.38 1 < 0.50 0.21 2 2 31.4511 30.2003 1.2508 0.78 0.53 0.69 0.95 2.03 1.08
53 10-357 163 33.1343 31.3328 1.8015         15                                
54 10-359 175 33.7487 30.6061 3.1426     PSMD3ex1in1 RNase P 15 0.52 1 0.97 0.92 2 2 34.3547 31.6782 2.6765 0.66 1.96 0.26 0.37 0.71 0.34
55 10-359 187 34.9606 32.7503 2.2103         15                                
56 10-360 199 25.7150 26.8130 -1.0980     PSMD3ex1in1 RNase P 15 4.51 5 < 0.50 0.13 2 2 26.8849 27.3383 -0.4534 0.91 -1.17 2.26 2.89 7.05 4.17
57 10-360 211 28.0548 27.8636 0.1912         15                                
58 10-361 223 29.0076 27.0442 1.9634     PSMD3ex1in1 RNase P 15 0.72 1 0.89 0.17 2 2 29.9312 27.7311 2.2001 0.33 1.48 0.36 0.61 0.85 0.24
59 10-361 235 30.8548 28.4180 2.4368         15                                
60 10-363 247 32.5936 31.4711 1.1226     PSMD3ex1in1 RNase P 15 1.35 1 0.54 0.16 2 2 33.0725 31.7895 1.2830 0.23 0.56 0.68 1.21 1.51 0.30
61 10-363 259 33.5513 32.1079 1.4434         15                                
62 10-364 271 27.8317 25.7856 2.0462     PSMD3ex1in1 RNase P 15 1.03 1 0.69 0.06 2 2 28.4913 26.8099 1.6814 0.52 0.96 0.51 0.80 1.32 0.53
63 10-364 283 29.1509 27.8343 1.3166         15                                
64 10-369 295 33.2118 31.8125 1.3993     PSMD3ex1in1 RNase P 15 1.42 1 < 0.50 0.34 2 2 33.3118 32.0964 1.2154 0.26 0.49 0.71 1.25 1.61 0.36
65 10-369 307 33.4119 32.3803 1.0316         15                                
66 10-374 319 29.8051 28.4457 1.3595     PSMD3ex1in1 RNase P 15 1.17 1 < 0.50 0.16 2 2 29.8596 28.3692 1.4904 0.19 0.77 0.59 1.07 1.28 0.21
67 10-374 331 29.9141 28.2927 1.6214         15                                
68 DNActrl 367 26.2940 25.2755 1.0185     PSMD3ex1in1 RNase P 15 2.00 2 < 0.50 0.04 2 2 25.9286 25.2080 0.7206 0.42 0.00 1.00 1.63 2.46 0.83
69 DNActrl 379 25.5632 25.1406 0.4226         15                                
70 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3ex1in1 RNase P 15         2                    
71 NTC 355 undetermined undetermined undetermined x NTC     15