Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120911_1000_2ndset_pl24_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120911_1000_2ndset_pl24_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/11/12 3:09:59 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 2                                                    
28 - 1 Copy: 3                                                    
29 - 2 Copies: 6                                                    
30 - 3 Copies: 4                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 4                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-651T 7 35.8857 33.9035 1.9822 x VICET PSMD3ex1in1 RNase P 24         2                    
39 10-651T 19 36.0946 34.2795 1.8152 x VICET     24                                
40 10-654 31 32.0651 30.0293 2.0358     PSMD3ex1in1 RNase P 24 1.49 1     2 2 31.4591 29.7701 1.6890 0.49 0.42 0.75 1.17 1.90 0.72
41 10-654 43 30.8531 29.5108 1.3423         24                                
42 10-655 55 32.9811 32.5665 0.4146     PSMD3ex1in1 RNase P 24 2.55 3     2 2 33.2945 32.3751 0.9194 0.71 -0.35 1.27 1.79 3.61 1.82
43 10-655 67 33.6080 32.1837 1.4242         24                                
44 10-656 79 35.9946 35.5967 0.3980 x VICET PSMD3ex1in1 RNase P 24         2                    
45 10-656 91 36.6181 34.1708 2.4474 x VICET     24                                
46 10-659 103 29.7239 28.8672 0.8567     PSMD3ex1in1 RNase P 24 2.90 3     2 2 29.3368 28.6035 0.7333 0.17 -0.53 1.45 2.66 3.15 0.50
47 10-659 115 28.9498 28.3398 0.6099         24                                
48 10-660 127 30.1124 28.8272 1.2852     PSMD3ex1in1 RNase P 24 1.79 2     2 2 30.1741 28.7494 1.4247 0.20 0.16 0.90 1.63 1.98 0.35
49 10-660 139 30.2357 28.6715 1.5642         24                                
50 10-662 151 30.1587 28.9161 1.2426     PSMD3ex1in1 RNase P 24 2.07 2     2 2 30.1704 28.9553 1.2152 0.04 -0.05 1.04 2.03 2.11 0.08
51 10-662 163 30.1822 28.9944 1.1878         24                                
52 10-667 175 27.9308 27.3543 0.5765     PSMD3ex1in1 RNase P 24 3.07 3     2 2 27.9665 27.3160 0.6505 0.10 -0.62 1.53 2.91 3.23 0.31
53 10-667 187 28.0022 27.2778 0.7245         24                                
54 10-675 199 28.7347 27.5219 1.2127     PSMD3ex1in1 RNase P 24 2.35 2     2 2 28.4565 27.4248 1.0318 0.26 -0.24 1.18 2.08 2.67 0.59
55 10-675 211 28.1784 27.3276 0.8508         24                                
56 10-677 223 29.4348 28.3836 1.0512     PSMD3ex1in1 RNase P 24 2.20 2     2 2 29.1863 28.0552 1.1311 0.11 -0.14 1.10 2.08 2.32 0.24
57 10-677 235 28.9378 27.7267 1.2110         24                                
58 10-679 247 29.4759 27.5938 1.8821     PSMD3ex1in1 RNase P 24 1.62 2     2 2 29.3767 27.8071 1.5697 0.44 0.30 0.81 1.31 2.01 0.71
59 10-679 259 29.2775 28.0203 1.2572         24                                
60 10-680 271 31.0961 29.0385 2.0575     PSMD3ex1in1 RNase P 24 1.32 1     2 2 30.6080 28.7468 1.8613 0.28 0.59 0.66 1.16 1.52 0.36
61 10-680 283 30.1200 28.4550 1.6650         24                                
62 10-686 295 31.6800 29.1488 2.5312     PSMD3ex1in1 RNase P 24 0.91 1     2 2 31.7982 29.3963 2.4019 0.18 1.13 0.46 0.83 1.00 0.16
63 10-686 307 31.9164 29.6439 2.2725         24                                
64 10-687 319 27.9786 27.0703 0.9083     PSMD3ex1in1 RNase P 24 2.77 3     2 2 27.7317 26.9356 0.7961 0.16 -0.47 1.39 2.56 3.00 0.43
65 10-687 331 27.4848 26.8009 0.6839         24                                
66 DNActrl 367 25.5815 24.2386 1.3429     PSMD3ex1in1 RNase P 24 2.00 2     2 2 25.5062 24.2390 1.2672 0.11 0.00 1.00 1.90 2.11 0.21
67 DNActrl 379 25.4309 24.2394 1.1915         24                                
68 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3ex1in1 RNase P 24         2                    
69 NTC 355 undetermined undetermined undetermined x NTC     24