Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl26_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl26_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 2:09:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 2                                                    
26 - 2 Copies: 12                                                    
27 - 4 Copies: 1                                                    
28                                                      
29 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
30 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
31 - Negative control sample well: 2                                                    
32                                                      
33 Delta Ct variance: 0.1938                                                    
34                                                      
35                                                      
36 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
37 10-716 7 31.0106 28.9161 2.0945     PSMD3ex1in1 RNase P 26 1.16 1 < 0.50 0.27 2 2 30.9086 28.8827 2.0259 0.10 0.79 0.58 1.11 1.22 0.11
38 10-716 19 30.8067 28.8493 1.9573         26                                
39 10-717 31 30.1613 28.6793 1.4820     PSMD3ex1in1 RNase P 26 1.79 2 0.91 0.11 2 2 29.8283 28.4259 1.4024 0.11 0.16 0.89 1.69 1.89 0.20
40 10-717 43 29.4952 28.1724 1.3228         26                                
41 10-722T 55 30.0329 28.8740 1.1589     PSMD3ex1in1 RNase P 26 2.07 2 0.90 0.16 2 2 30.2205 29.0286 1.1919 0.05 -0.05 1.03 2.02 2.12 0.09
42 10-722T 67 30.4081 29.1832 1.2249         26                                
43 10-726 79 34.0890 33.1094 0.9797 x VICET PSMD3ex1in1 RNase P 26 1.68 2 0.66 0.18 2 1 33.7991 32.3089 1.4902 0.00 0.25 0.84 1.68 1.68 0.00
44 10-726 91 33.7991 32.3089 1.4902         26                                
45 10-730 103 30.0117 28.9290 1.0827     PSMD3ex1in1 RNase P 26 2.27 2 0.75 0.25 2 2 29.9118 28.8566 1.0553 0.04 -0.18 1.14 2.23 2.32 0.09
46 10-730 115 29.8120 28.7842 1.0278         26                                
47 10-731 127 30.3225 28.7939 1.5286     PSMD3ex1in1 RNase P 26 1.77 2 0.89 0.14 2 2 30.2408 28.8272 1.4136 0.16 0.17 0.89 1.64 1.92 0.28
48 10-731 139 30.1591 28.8605 1.2985         26                                
49 10-732 151 29.3955 28.4296 0.9659     PSMD3ex1in1 RNase P 26 2.02 2 0.92 0.09 2 2 29.6518 28.4301 1.2217 0.36 -0.02 1.01 1.70 2.42 0.72
50 10-732 163 29.9081 28.4305 1.4775         26                                
51 10-733 175 29.2588 27.8245 1.4343     PSMD3ex1in1 RNase P 26 1.57 2 0.80 0.29 2 2 29.2139 27.6215 1.5924 0.22 0.35 0.78 1.40 1.75 0.34
52 10-733 187 29.1690 27.4185 1.7505         26                                
53 10-734 199 33.8547 32.7302 1.1244     PSMD3ex1in1 RNase P 26 2.32 2 0.81 0.38 2 2 33.8002 32.7726 1.0276 0.14 -0.21 1.16 2.17 2.48 0.31
54 10-734 211 33.7457 32.8149 0.9308         26                                
55 10-735 223 33.3335 31.2447 2.0889     PSMD3ex1in1 RNase P 26 1.80 2 0.81 0.17 2 2 33.0108 31.6208 1.3900 0.99 0.15 0.90 1.11 2.92 1.81
56 10-735 235 32.6881 31.9969 0.6912         26                                
57 10-738 247 30.8257 29.6153 1.2104     PSMD3ex1in1 RNase P 26 2.41 2 0.73 0.46 2 2 30.6033 29.6299 0.9734 0.34 -0.27 1.20 2.04 2.83 0.79
58 10-738 259 30.3808 29.6446 0.7363         26                                
59 10-739 271 32.6382 30.2208 2.4174     PSMD3ex1in1 RNase P 26 0.94 1 0.65 0.00 2 2 31.7186 29.3826 2.3360 0.12 1.10 0.47 0.88 0.99 0.11
60 10-739 283 30.7990 28.5444 2.2546         26                                
61 10-747 295 30.1181 30.0225 0.0956     PSMD3ex1in1 RNase P 26 4.16 4 < 0.50 0.02 2 2 30.1934 30.0115 0.1819 0.12 -1.06 2.08 3.92 4.42 0.50
62 10-747 307 30.2687 30.0004 0.2683         26                                
63 10-748 319 30.5165 29.0045 1.5119     PSMD3ex1in1 RNase P 26 1.75 2 0.90 0.16 2 2 30.2634 28.8347 1.4286 0.12 0.19 0.88 1.66 1.86 0.20
64 10-748 331 30.0103 28.6649 1.3454         26                                
65 DNActrl 367 25.2744 23.8949 1.3796     PSMD3ex1in1 RNase P 26 2.00 2 0.96 0.07 2 2 25.0499 23.8104 1.2396 0.20 0.00 1.00 1.82 2.20 0.39
66 DNActrl 379 24.8254 23.7259 1.0995         26                                
67 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3ex1in1 RNase P 26         2                    
68 NTC 355 undetermined undetermined undetermined x NTC     26