Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120904_1000_2ndset_pl7_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120904_1000_2ndset_pl7_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/4/12 12:01:44 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 8                                                    
26 - 2 Copies: 4                                                    
27 - 4 Copies: 1                                                    
28 - 5 Copies: 1                                                    
29 > 10 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34 Delta Ct variance: 0.2866                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-156 7 28.2456 26.9884 1.2572     PSMD3ex1in1 RNase P 7 1.98 2 < 0.50 0.08 2 2 28.2378 26.9252 1.3126 0.08 0.01 0.99 1.91 2.06 0.15
39 10-156 19 28.2299 26.8619 1.3680         7                                
40 10-157 31 26.9615 29.1284 -2.1669     PSMD3ex1in1 RNase P 7 19.84 20 < 0.50 0.34 2 2 26.9779 28.9885 -2.0105 0.22 -3.31 9.92 17.80 22.11 4.31
41 10-157 43 26.9944 28.8485 -1.8541         7                                
42 10-159 55 29.1417 27.1459 1.9958     PSMD3ex1in1 RNase P 7 1.45 1 < 0.50 0.39 2 2 29.2986 27.5375 1.7611 0.33 0.46 0.73 1.23 1.71 0.47
43 10-159 67 29.4554 27.9291 1.5263         7                                
44 10-161 79 28.4670 28.2774 0.1896     PSMD3ex1in1 RNase P 7 3.89 4 < 0.50 0.25 2 2 28.6058 28.2645 0.3413 0.21 -0.96 1.94 3.50 4.32 0.82
45 10-161 91 28.7445 28.2516 0.4929         7                                
46 10-162 103 30.6020 28.6681 1.9339     PSMD3ex1in1 RNase P 7 0.76 1 0.95 0.16 2 2 31.8418 29.1417 2.7001 1.08 1.40 0.38 0.45 1.29 0.84
47 10-162 115 33.0816 29.6153 3.4664         7                                
48 10-165 127 30.0305 27.5113 2.5193     PSMD3ex1in1 RNase P 7 0.94 1 0.90 0.08 2 2 29.8935 27.5077 2.3858 0.19 1.09 0.47 0.86 1.03 0.17
49 10-165 139 29.7565 27.5042 2.2523         7                                
50 10-171 151 29.6332 27.4894 2.1438     PSMD3ex1in1 RNase P 7 1.01 1 0.85 0.05 2 2 30.1295 27.8469 2.2827 0.20 0.98 0.51 0.92 1.11 0.20
51 10-171 163 30.6259 28.2043 2.4215         7                                
52 10-172 175 28.1368 27.1540 0.9828     PSMD3ex1in1 RNase P 7 2.27 2 < 0.50 0.04 2 2 28.7486 27.6294 1.1192 0.19 -0.18 1.13 2.06 2.49 0.43
53 10-172 187 29.3604 28.1047 1.2557         7                                
54 10-175T 199 29.7370 27.9645 1.7726     PSMD3ex1in1 RNase P 7 1.18 1 0.59 0.08 2 2 30.3095 28.2443 2.0652 0.41 0.77 0.59 0.96 1.44 0.48
55 10-175T 211 30.8820 28.5242 2.3578         7                                
56 10-176 223 31.3667 28.3448 3.0219     PSMD3ex1in1 RNase P 7 0.73 1 0.95 0.37 2 2 31.6148 28.8618 2.7530 0.38 1.45 0.37 0.61 0.88 0.27
57 10-176 235 31.8628 29.3787 2.4840         7                                
58 10-181 247 28.7661 26.4277 2.3384     PSMD3ex1in1 RNase P 7 1.20 1 0.59 0.10 2 2 28.4683 26.4340 2.0344 0.43 0.73 0.60 0.97 1.48 0.51
59 10-181 259 28.1706 26.4402 1.7304         7                                
60 10-183 271 27.6563 27.0601 0.5962     PSMD3ex1in1 RNase P 7 2.38 2 < 0.50 0.05 2 2 28.5676 27.5171 1.0505 0.64 -0.25 1.19 1.74 3.26 1.52
61 10-183 283 29.4789 27.9742 1.5047         7                                
62 10-184 295 29.5178 27.6686 1.8492     PSMD3ex1in1 RNase P 7 1.30 1 0.55 0.22 2 2 29.7754 27.8511 1.9242 0.11 0.62 0.65 1.23 1.37 0.13
63 10-184 307 30.0329 28.0337 1.9992         7                                
64 10-185 319 28.0231 28.2089 -0.1857     PSMD3ex1in1 RNase P 7 5.15 5 < 0.50 0.15 2 2 28.1760 28.2401 -0.0642 0.17 -1.36 2.57 4.73 5.60 0.87
65 10-185 331 28.3288 28.2714 0.0574         7                                
66 DNActrl 367 26.1887 24.8929 1.2957     PSMD3ex1in1 RNase P 7 2.00 2 < 0.50 0.08 2 2 26.2649 24.9651 1.2998 0.01 0.00 1.00 1.99 2.01 0.01
67 DNActrl 379 26.3411 25.0372 1.3039         7                                
68 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3ex1in1 RNase P 7         2                    
69 NTC 355 undetermined undetermined undetermined x NTC     7