Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/RARAexin3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/RARAexin3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120716_1000_pl24_01.txt                                                    
5 Target name: RARA ex3in3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120716_1000_pl24_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 7/16/12 1:33:30 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 1 Copy: 9                                                    
27 - 2 Copies: 4                                                    
28 - 3 Copies: 1                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
31 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34 Delta Ct variance: 0.2996                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-662 9 32.9890 29.7574 3.2316     RARA ex3in3 RNase P   1.05 1 0.94 0.03 2 2 32.4691 29.3885 3.0806 0.21 0.94 0.52 0.94 1.16 0.22
39 10-662 21 31.9492 29.0196 2.9296                                          
40 10-667 33 29.9557 27.3958 2.5599     RARA ex3in3 RNase P   1.72 2 < 0.50 0.13 2 2 29.6232 27.2596 2.3635 0.28 0.22 0.86 1.50 1.97 0.47
41 10-667 45 29.2906 27.1235 2.1672                                          
42 10-675 57 29.5933 27.2506 2.3427     RARA ex3in3 RNase P   1.72 2 < 0.50 0.24 2 2 29.8401 27.4796 2.3605 0.03 0.22 0.86 1.70 1.74 0.04
43 10-675 69 30.0869 27.7087 2.3782                                          
44 10-677 81 31.0473 28.4211 2.6263     RARA ex3in3 RNase P   1.34 1 < 0.50 0.48 2 2 31.0980 28.3741 2.7239 0.14 0.58 0.67 1.25 1.43 0.18
45 10-677 93 31.1487 28.3271 2.8216                                          
46 10-679 105 30.6616 27.7259 2.9357     RARA ex3in3 RNase P   1.09 1 0.92 0.05 2 2 30.8519 27.8301 3.0218 0.12 0.88 0.54 1.03 1.16 0.13
47 10-679 117 31.0422 27.9343 3.1078                                          
48 10-680 129 32.4879 28.9300 3.5579     RARA ex3in3 RNase P   0.71 1 > 0.99 0.92 2 2 32.6222 28.9807 3.6415 0.12 1.50 0.35 0.67 0.75 0.08
49 10-680 141 32.7565 29.0314 3.7251                                          
50 10-686 153 32.6580 29.5754 3.0826     RARA ex3in3 RNase P   0.88 1 0.99 0.15 2 2 33.1735 29.8359 3.3376 0.36 1.19 0.44 0.73 1.04 0.31
51 10-686 165 33.6891 30.0964 3.5927                                          
52 10-687 177 29.6510 27.5132 2.1378     RARA ex3in3 RNase P   1.93 2 0.57 0.04 2 2 29.6652 27.4711 2.1941 0.08 0.05 0.97 1.86 2.01 0.15
53 10-687 189 29.6794 27.4290 2.2504                                          
54 10-689 201 31.0447 28.2565 2.7882     RARA ex3in3 RNase P   1.47 1 < 0.50 1.00 2 2 30.9867 28.3930 2.5937 0.28 0.45 0.73 1.28 1.68 0.40
55 10-689 213 30.9288 28.5296 2.3992                                          
56 10-691 225 31.8345 28.8440 2.9905     RARA ex3in3 RNase P   1.21 1 0.78 0.15 2 2 31.8469 28.9755 2.8714 0.17 0.73 0.60 1.11 1.31 0.20
57 10-691 237 31.8593 29.1070 2.7523                                          
58 10-694 249 37.3272 34.0376 3.2896 x VICET RARA ex3in3 RNase P           2                    
59 10-694 261 38.1528 35.1148 3.0381 x VICET                                      
60 10-695 273 34.5746 31.1497 3.4249     RARA ex3in3 RNase P   0.80 1 0.99 0.46 2 2 34.2597 30.7863 3.4734 0.07 1.33 0.40 0.77 0.82 0.05
61 10-695 285 33.9448 30.4229 3.5219                                          
62 10-696 297 33.2278 32.1968 1.0310     RARA ex3in3 RNase P   3.02 3 < 0.50 0.07 2 2 33.5942 32.0442 1.5501 0.73 -0.59 1.51 2.11 4.33 2.22
63 10-696 309 33.9607 31.8915 2.0691                                          
64 10-698 321 34.1413 30.7593 3.3820     RARA ex3in3 RNase P   0.83 1 0.99 0.21 2 2 34.2423 30.8243 3.4179 0.05 1.27 0.41 0.81 0.85 0.04
65 10-698 333 34.3432 30.8894 3.4538                                          
66 DNActrl 369 26.7193 24.5634 2.1559     RARA ex3in3 RNase P   2.00 2 0.61 0.07 2 2 26.5172 24.3722 2.1450 0.02 0.00 1.00 1.98 2.02 0.03
67 DNActrl 381 26.3151 24.1809 2.1342                                          
68 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC RARA ex3in3 RNase P           2                    
69 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC