Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/RARAexin3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/RARAexin3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120718_1000_pl30_01.txt                                                    
5 Target name: RARA ex3in3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120718_1000_pl30_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 7/18/12 5:13:25 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 3                                                    
26 - 2 Copies: 8                                                    
27 - 3 Copies: 2                                                    
28 - 4 Copies: 1                                                    
29 > 10 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34 Delta Ct variance: 0.2066                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-852 9 33.2631 29.9375 3.3255     RARA ex3in3 RNase P   0.91 1 0.74 0.09 2 2 32.8975 29.4817 3.4159 0.13 1.14 0.45 0.85 0.97 0.11
39 10-852 21 32.5320 29.0258 3.5062                                          
40 10-853 33 28.9229 26.7142 2.2087     RARA ex3in3 RNase P   2.10 2 0.68 0.08 2 2 28.9741 26.7682 2.2059 0.00 -0.07 1.05 2.10 2.11 0.01
41 10-853 45 29.0252 26.8221 2.2031                                          
42 10-855 57 30.2024 27.5314 2.6710     RARA ex3in3 RNase P   1.18 1 < 0.50 0.12 2 2 30.6562 27.6128 3.0433 0.53 0.77 0.59 0.91 1.52 0.61
43 10-855 69 31.1100 27.6943 3.4157                                          
44 10-856 81 32.5442 30.3350 2.2092     RARA ex3in3 RNase P   1.87 2 0.79 0.13 2 2 32.5622 30.1888 2.3734 0.23 0.10 0.94 1.67 2.10 0.43
45 10-856 93 32.5802 30.0426 2.5376                                          
46 10-857 105 30.3419 27.8251 2.5168     RARA ex3in3 RNase P   1.26 1 < 0.50 0.36 2 2 30.9791 28.0387 2.9405 0.60 0.66 0.63 0.94 1.69 0.75
47 10-857 117 31.6164 28.2523 3.3641                                          
48 10-861 129 29.1859 26.9233 2.2626     RARA ex3in3 RNase P   1.99 2 0.78 0.07 2 2 29.0371 26.7492 2.2879 0.04 0.01 0.99 1.95 2.02 0.07
49 10-861 141 28.8883 26.5750 2.3132                                          
50 10-865 153 30.6759 28.6315 2.0444     RARA ex3in3 RNase P   1.66 2 0.52 0.21 2 2 31.5866 29.0432 2.5434 0.71 0.27 0.83 1.18 2.35 1.17
51 10-865 165 32.4972 29.4549 3.0423                                          
52 10-867 177 28.3152 26.4595 1.8558     RARA ex3in3 RNase P   2.39 2 < 0.50 0.27 2 2 28.5580 26.5371 2.0209 0.23 -0.26 1.19 2.13 2.68 0.55
53 10-867 189 28.8008 26.6148 2.1861                                          
54 10-868 201 28.6710 29.5474 -0.8763     RARA ex3in3 RNase P   16.68 17 < 0.50 0.09 2 2 28.7432 29.5264 -0.7832 0.13 -3.06 8.34 15.64 17.80 2.16
55 10-868 213 28.8154 29.5054 -0.6901                                          
56 10-870 225 27.9997 26.0828 1.9169     RARA ex3in3 RNase P   2.50 3 < 0.50 0.24 2 2 28.1383 26.1846 1.9537 0.05 -0.32 1.25 2.44 2.57 0.13
57 10-870 237 28.2768 26.2863 1.9905                                          
58 10-871 249 29.6010 27.7347 1.8663     RARA ex3in3 RNase P   2.41 2 < 0.50 0.34 2 2 29.9621 27.9537 2.0084 0.20 -0.27 1.20 2.18 2.66 0.48
59 10-871 261 30.3233 28.1727 2.1506                                          
60 10-872 273 28.0772 26.9695 1.1077     RARA ex3in3 RNase P   3.94 4 < 0.50 0.08 2 2 28.0784 26.7811 1.2973 0.27 -0.98 1.97 3.46 4.50 1.04
61 10-872 285 28.0796 26.5926 1.4869                                          
62 10-873 297 29.7406 28.3330 1.4076     RARA ex3in3 RNase P   3.07 3 < 0.50 0.08 2 2 30.1578 28.4976 1.6602 0.36 -0.62 1.53 2.57 3.65 1.08
63 10-873 309 30.5750 28.6622 1.9128                                          
64 10-875 321 29.3418 26.7074 2.6344     RARA ex3in3 RNase P   1.53 2 0.57 0.58 2 2 29.2923 26.6289 2.6634 0.04 0.39 0.77 1.50 1.56 0.06
65 10-875 333 29.2428 26.5504 2.6924                                          
66 DNActrl 369 26.3290 24.1694 2.1595     RARA ex3in3 RNase P   2.00 2 0.67 0.07 2 2 26.3067 24.0297 2.2771 0.17 0.00 1.00 1.84 2.17 0.33
67 DNActrl 381 26.2845 23.8899 2.3946                                          
68 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC RARA ex3in3 RNase P           2                    
69 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC