Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in11ex12/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in11ex12/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120906_1000_2ndset_pl15_01_2.txt                                                    
5 Target name: CDC6in11ex12                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120906_1000_2ndset_pl15_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/6/12 3:38:38 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 1 Copy: 4                                                    
29 - 2 Copies: 4                                                    
30 - 3 Copies: 3                                                    
31 - 4 Copies: 1                                                    
32 - 9 Copies: 1                                                    
33 > 10 Copies: 1                                                    
34                                                      
35 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
36 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
37 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
38 - Negative control sample well: 2                                                    
39                                                      
40                                                      
41 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
42 10-346 10 27.1191 28.8183 -1.6992     CDC6in11ex12 RNase P   3.95 4     2 2 28.1128 28.7798 -0.6669 1.46 -0.98 1.98 1.93 8.09 6.15
43 10-346 22 29.1066 28.7413 0.3653                                          
44 10-347 34 28.5367 28.3047 0.2319     CDC6in11ex12 RNase P   2.52 3     2 2 27.4072 27.4244 -0.0172 0.35 -0.33 1.26 2.12 3.00 0.87
45 10-347 46 26.2777 26.5440 -0.2663                                          
46 10-348 58 26.8273 28.6186 -1.7913     CDC6in11ex12 RNase P   11.46 11     2 2 26.4136 28.6163 -2.2027 0.58 -2.52 5.73 8.62 15.25 6.63
47 10-348 70 26.0000 28.6141 -2.6141                                          
48 10-349 82 26.7399 28.4934 -1.7535     CDC6in11ex12 RNase P   8.95 9     2 2 26.2776 28.1238 -1.8462 0.13 -2.16 4.48 8.40 9.55 1.15
49 10-349 94 25.8152 27.7541 -1.9389                                          
50 10-353 106 undetermined undetermined undetermined x NOVIC CDC6in11ex12 RNase P           2                    
51 10-353 118 35.3240 37.6155 -2.2916 x VICET                                      
52 10-356 130 29.8247 30.8675 -1.0428     CDC6in11ex12 RNase P   2.16 2     2 2 30.2379 30.0295 0.2084 1.77 -0.11 1.08 0.91 5.13 4.22
53 10-356 142 30.6512 29.1915 1.4597                                          
54 10-357 154 29.8668 29.1522 0.7146     CDC6in11ex12 RNase P   1.27 1     2 2 30.1576 29.1811 0.9765 0.37 0.66 0.63 1.06 1.52 0.46
55 10-357 166 30.4484 29.2101 1.2384                                          
56 10-359 178 31.1233 31.4745 -0.3512     CDC6in11ex12 RNase P   2.95 3     2 2 31.3308 31.5729 -0.2421 0.15 -0.56 1.47 2.73 3.18 0.45
57 10-359 190 31.5383 31.6714 -0.1330                                          
58 10-360 202 26.8169 25.7063 1.1107     CDC6in11ex12 RNase P   1.65 2     2 2 26.7014 26.1078 0.5937 0.73 0.28 0.83 1.15 2.36 1.21
59 10-360 214 26.5859 26.5093 0.0766                                          
60 10-361 226 28.5749 25.9687 2.6061     CDC6in11ex12 RNase P   0.52 1     2 2 28.5863 26.3303 2.2560 0.50 1.94 0.26 0.41 0.66 0.26
61 10-361 238 28.5978 26.6918 1.9059                                          
62 10-363 250 31.9929 30.7959 1.1969     CDC6in11ex12 RNase P   2.54 3     2 2 30.4964 30.5227 -0.0262 1.73 -0.34 1.27 1.09 5.92 4.83
63 10-363 262 29.0000 30.2494 -1.2494                                          
64 10-364 274 27.7506 25.1871 2.5635     CDC6in11ex12 RNase P   0.57 1     2 2 28.0688 25.9392 2.1296 0.61 1.81 0.28 0.42 0.77 0.35
65 10-364 286 28.3870 26.6913 1.6956                                          
66 10-369 298 31.4499 31.0210 0.4289     CDC6in11ex12 RNase P   1.80 2     2 2 31.2332 30.7630 0.4701 0.06 0.15 0.90 1.75 1.85 0.10
67 10-369 310 31.0165 30.5051 0.5114                                          
68 10-374 322 29.3870 27.4708 1.9162     CDC6in11ex12 RNase P   0.69 1     2 2 29.4042 27.5503 1.8538 0.09 1.54 0.34 0.66 0.72 0.06
69 10-374 334 29.4214 27.6299 1.7915                                          
70 DNActrl 370 24.5388 24.3435 0.1953     CDC6in11ex12 RNase P   2.00 2     2 2 24.5358 24.2196 0.3162 0.17 0.00 1.00 1.84 2.17 0.34
71 DNActrl 382 24.5328 24.0957 0.4371                                          
72 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in11ex12 RNase P           2                    
73 NTC 358 33.0000 undetermined undetermined x NTC