Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in11ex12/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in11ex12/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl26_01.txt                                                    
5 Target name: CDC6in11ex12                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl26_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 2:09:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 5                                                    
26 - 2 Copies: 9                                                    
27 - 3 Copies: 1                                                    
28                                                      
29 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
30 - Negative control sample well: 2                                                    
31                                                      
32 Delta Ct variance: 0.1748                                                    
33                                                      
34                                                      
35 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
36 10-716 10 29.2722 28.4193 0.8529     CDC6in11ex12 RNase P   1.25 1 < 0.50 0.62 2 2 29.3458 28.3909 0.9549 0.14 0.68 0.62 1.16 1.34 0.18
37 10-716 22 29.4194 28.3625 1.0569                                          
38 10-717 34 28.8379 28.2513 0.5866     CDC6in11ex12 RNase P   1.55 2 < 0.50 0.46 2 2 28.6420 27.9980 0.6440 0.08 0.37 0.77 1.49 1.61 0.12
39 10-717 46 28.4461 27.7447 0.7014                                          
40 10-722T 58 29.0362 28.5240 0.5121     CDC6in11ex12 RNase P   1.41 1 < 0.50 0.44 2 2 29.2361 28.4546 0.7815 0.38 0.51 0.70 1.17 1.70 0.53
41 10-722T 70 29.4361 28.3852 1.0509                                          
42 10-726 82 32.4857 32.2932 0.1925     CDC6in11ex12 RNase P   2.15 2 0.66 0.56 2 2 32.2117 32.0410 0.1707 0.03 -0.10 1.07 2.12 2.18 0.07
43 10-726 94 31.9377 31.7889 0.1488                                          
44 10-730 106 29.5828 28.8735 0.7093     CDC6in11ex12 RNase P   1.44 1 < 0.50 0.36 2 2 29.5046 28.7557 0.7489 0.06 0.47 0.72 1.40 1.48 0.08
45 10-730 118 29.4264 28.6378 0.7885                                          
46 10-731 130 28.2721 28.0505 0.2216     CDC6in11ex12 RNase P   2.18 2 0.51 0.64 2 2 28.4402 28.2871 0.1530 0.10 -0.12 1.09 2.07 2.28 0.21
47 10-731 142 28.6082 28.5238 0.0844                                          
48 10-732 154 28.8978 28.3262 0.5716     CDC6in11ex12 RNase P   1.61 2 < 0.50 0.20 2 2 28.9105 28.3220 0.5886 0.02 0.31 0.80 1.59 1.63 0.04
49 10-732 166 28.9233 28.3177 0.6055                                          
50 10-733 178 27.4089 26.9621 0.4468     CDC6in11ex12 RNase P   1.76 2 < 0.50 0.06 2 2 27.5633 27.1079 0.4554 0.01 0.18 0.88 1.75 1.78 0.02
51 10-733 190 27.7177 27.2537 0.4640                                          
52 10-734 202 33.4083 32.4377 0.9706     CDC6in11ex12 RNase P   1.49 1 < 0.50 0.61 2 2 32.9114 32.2132 0.6982 0.39 0.42 0.75 1.23 1.80 0.57
53 10-734 214 32.4145 31.9888 0.4257                                          
54 10-735 226 31.6503 31.1379 0.5124     CDC6in11ex12 RNase P   1.75 2 < 0.50 0.07 2 2 31.7307 31.2604 0.4703 0.06 0.20 0.87 1.70 1.80 0.10
55 10-735 238 31.8110 31.3828 0.4282                                          
56 10-738 250 28.8017 29.0630 -0.2613     CDC6in11ex12 RNase P   3.15 3 < 0.50 0.45 2 2 28.8342 29.2159 -0.3817 0.17 -0.66 1.58 2.90 3.43 0.53
57 10-738 262 28.8666 29.3689 -0.5022                                          
58 10-739 274 29.8814 29.4872 0.3941     CDC6in11ex12 RNase P   1.68 2 < 0.50 0.08 2 2 29.7026 29.1770 0.5256 0.19 0.25 0.84 1.53 1.84 0.31
59 10-739 286 29.5239 28.8668 0.6571                                          
60 10-747 298 30.0952 29.2311 0.8641     CDC6in11ex12 RNase P   1.53 2 < 0.50 0.34 2 2 30.2733 29.6148 0.6585 0.29 0.38 0.77 1.33 1.77 0.44
61 10-747 310 30.4514 29.9984 0.4530                                          
62 10-748 322 29.3136 28.5077 0.8059     CDC6in11ex12 RNase P   1.34 1 < 0.50 0.42 2 2 29.4627 28.6099 0.8528 0.07 0.58 0.67 1.30 1.38 0.09
63 10-748 334 29.6118 28.7121 0.8996                                          
64 DNActrl 370 23.9483 23.6074 0.3409     CDC6in11ex12 RNase P   2.00 2 0.61 0.29 2 2 23.8413 23.5667 0.2746 0.09 0.00 1.00 1.91 2.09 0.18
65 DNActrl 382 23.7343 23.5260 0.2083                                          
66 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in11ex12 RNase P           2                    
67 NTC 358 undetermined undetermined undetermined x NTC