Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in11ex12/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in11ex12/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120904_1000_2ndset_pl7_01.txt                                                    
5 Target name: CDC6in11ex12                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120904_1000_2ndset_pl7_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/4/12 12:01:44 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 9                                                    
26 - 2 Copies: 1                                                    
27 - 3 Copies: 2                                                    
28 - 4 Copies: 3                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
31 - Negative control sample well: 2                                                    
32                                                      
33 Delta Ct variance: 0.2702                                                    
34                                                      
35                                                      
36 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
37 10-156 10 27.8070 25.9589 1.8482     CDC6in11ex12 RNase P   0.92 1 > 0.99 0.24 2 2 27.6746 26.0624 1.6121 0.33 1.13 0.46 0.78 1.08 0.30
38 10-156 22 27.5421 26.1660 1.3761                                          
39 10-157 34 29.8365 28.4513 1.3851     CDC6in11ex12 RNase P   1.11 1 0.99 0.09 2 2 30.0258 28.6835 1.3423 0.06 0.86 0.55 1.07 1.14 0.07
40 10-157 46 30.2152 28.9157 1.2996                                          
41 10-159 58 26.2449 26.7104 -0.4655     CDC6in11ex12 RNase P   3.68 4 < 0.50 0.41 2 2 26.4537 26.8475 -0.3938 0.10 -0.88 1.84 3.50 3.87 0.37
42 10-159 70 26.6625 26.9846 -0.3221                                          
43 10-161 82 27.0790 27.3296 -0.2506     CDC6in11ex12 RNase P   3.24 3 < 0.50 0.07 2 2 27.2757 27.4836 -0.2079 0.06 -0.69 1.62 3.14 3.33 0.19
44 10-161 94 27.4723 27.6376 -0.1653                                          
45 10-162 106 28.8227 28.1737 0.6490     CDC6in11ex12 RNase P   1.32 1 0.89 0.10 2 2 29.8086 28.7271 1.0815 0.61 0.59 0.66 0.98 1.79 0.81
46 10-162 118 30.7946 29.2806 1.5140                                          
47 10-165 130 28.0760 26.5099 1.5661     CDC6in11ex12 RNase P   1.04 1 > 0.99 0.10 2 2 28.2101 26.7736 1.4365 0.18 0.95 0.52 0.95 1.13 0.19
48 10-165 142 28.3442 27.0374 1.3068                                          
49 10-171 154 28.0806 26.9249 1.1557     CDC6in11ex12 RNase P   1.41 1 0.87 0.22 2 2 28.1749 27.1875 0.9875 0.24 0.50 0.71 1.26 1.59 0.33
50 10-171 166 28.2693 27.4501 0.8192                                          
51 10-172 178 26.0622 26.6039 -0.5418     CDC6in11ex12 RNase P   4.33 4 < 0.50 0.08 2 2 26.1708 26.7975 -0.6267 0.12 -1.11 2.16 4.08 4.59 0.51
52 10-172 190 26.2795 26.9911 -0.7117                                          
53 10-175T 202 28.2338 26.9600 1.2738     CDC6in11ex12 RNase P   0.98 1 > 0.99 0.11 2 2 28.7922 27.2770 1.5152 0.34 1.03 0.49 0.83 1.16 0.33
54 10-175T 214 29.3506 27.5941 1.7566                                          
55 10-176 226 28.7687 27.9195 0.8493     CDC6in11ex12 RNase P   1.49 1 0.71 0.52 2 2 29.1821 28.2717 0.9104 0.09 0.42 0.75 1.43 1.56 0.13
56 10-176 238 29.5954 28.6238 0.9716                                          
57 10-181 250 26.5962 25.7534 0.8428     CDC6in11ex12 RNase P   1.39 1 0.82 0.22 2 2 26.7624 25.7555 1.0069 0.23 0.52 0.70 1.24 1.56 0.32
58 10-181 262 26.9286 25.7576 1.1710                                          
59 10-183 274 26.1496 26.5209 -0.3714     CDC6in11ex12 RNase P   3.70 4 < 0.50 0.41 2 2 26.4912 26.8899 -0.3987 0.04 -0.89 1.85 3.63 3.77 0.14
60 10-183 286 26.8329 27.2588 -0.4259                                          
61 10-184 298 28.4036 26.7861 1.6175     CDC6in11ex12 RNase P   0.83 1 > 0.99 0.81 2 2 28.6080 26.8574 1.7506 0.19 1.26 0.42 0.76 0.91 0.15
62 10-184 310 28.8125 26.9288 1.8837                                          
63 10-185 322 27.3921 27.4107 -0.0185     CDC6in11ex12 RNase P   2.70 3 < 0.50 0.52 2 2 27.6981 27.6435 0.0546 0.10 -0.43 1.35 2.57 2.84 0.27
64 10-185 334 28.0041 27.8763 0.1278                                          
65 DNActrl 370 24.5028 24.0682 0.4346     CDC6in11ex12 RNase P   2.00 2 < 0.50 0.17 2 2 24.7480 24.2611 0.4869 0.07 0.00 1.00 1.93 2.07 0.15
66 DNActrl 382 24.9933 24.4540 0.5393                                          
67 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in11ex12 RNase P           2                    
68 NTC 358 undetermined undetermined undetermined x NTC