Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120905_1000_2ndset_pl11_01_2.txt                                                    
5 Target name: CDC6in5ex6                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120905_1000_2ndset_pl11_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/5/12 1:49:11 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 1 Copy: 3                                                    
28 - 2 Copies: 4                                                    
29 - 3 Copies: 3                                                    
30 - 4 Copies: 1                                                    
31 - 5 Copies: 1                                                    
32 - 6 Copies: 1                                                    
33 - 7 Copies: 1                                                    
34 - 8 Copies: 1                                                    
35                                                      
36 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
37 - Negative control sample well: 2                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-260 9 29.9751 31.6279 -1.6528     CDC6in5ex6 RNase P   2.65 3     2 2 28.5429 29.5314 -0.9885 0.94 -0.41 1.32 1.67 4.20 2.53
42 10-260 21 27.1107 27.4349 -0.3242                                          
43 10-264 33 28.7893 31.2295 -2.4403     CDC6in5ex6 RNase P   7.54 8     2 2 28.4744 30.9730 -2.4985 0.08 -1.92 3.77 7.25 7.85 0.61
44 10-264 45 28.1596 30.7164 -2.5568                                          
45 10-266 57 30.1306 30.2229 -0.0923     CDC6in5ex6 RNase P   1.41 1     2 2 29.5556 29.6371 -0.0815 0.02 0.50 0.71 1.40 1.42 0.02
46 10-266 69 28.9806 29.0513 -0.0707                                          
47 10-267 81 29.1993 30.4805 -1.2812     CDC6in5ex6 RNase P   2.10 2     2 2 29.0113 29.6620 -0.6507 0.89 -0.07 1.05 1.35 3.24 1.89
48 10-267 93 28.8233 28.8435 -0.0202                                          
49 10-268 105 27.8903 30.1377 -2.2474     CDC6in5ex6 RNase P   6.26 6     2 2 27.9674 30.1974 -2.2300 0.02 -1.65 3.13 6.19 6.34 0.15
50 10-268 117 28.0444 30.2571 -2.2127                                          
51 10-270 129 28.9368 30.4436 -1.5068     CDC6in5ex6 RNase P   3.80 4     2 2 27.9917 29.4995 -1.5078 0.00 -0.92 1.90 3.79 3.80 0.01
52 10-270 141 27.0466 28.5555 -1.5088                                          
53 10-272T 153 28.6765 29.3500 -0.6735     CDC6in5ex6 RNase P   1.95 2     2 2 28.3562 28.9046 -0.5484 0.18 0.03 0.98 1.79 2.13 0.34
54 10-272T 165 28.0359 28.4592 -0.4233                                          
55 10-273 177 27.3361 30.9856 -3.6495     CDC6in5ex6 RNase P   7.12 7     2 2 27.9665 30.3818 -2.4153 1.75 -1.83 3.56 3.03 16.75 13.73
56 10-273 189 28.5969 29.7780 -1.1811                                          
57 10-275 201 29.5214 30.7258 -1.2044     CDC6in5ex6 RNase P   2.60 3     2 2 29.3657 30.3259 -0.9602 0.35 -0.38 1.30 2.19 3.08 0.88
58 10-275 213 29.2100 29.9259 -0.7159                                          
59 10-276 225 28.5484 29.6381 -1.0897     CDC6in5ex6 RNase P   1.96 2     2 2 28.8806 29.4322 -0.5516 0.76 0.03 0.98 1.35 2.84 1.49
60 10-276 237 29.2128 29.2262 -0.0134                                          
61 10-277 249 29.8664 29.8867 -0.0203     CDC6in5ex6 RNase P   1.43 1     2 2 28.9373 29.0392 -0.1019 0.12 0.48 0.72 1.35 1.52 0.16
62 10-277 261 28.0081 28.1916 -0.1835                                          
63 10-280 273 29.9971 32.1135 -2.1165     CDC6in5ex6 RNase P   2.66 3     2 2 31.2512 32.2445 -0.9933 1.59 -0.41 1.33 1.22 5.79 4.57
64 10-280 285 32.5053 32.3754 0.1299                                          
65 10-281T 297 28.5411 30.1812 -1.6401     CDC6in5ex6 RNase P   4.96 5     2 2 27.7706 29.6630 -1.8924 0.36 -1.31 2.48 4.16 5.90 1.74
66 10-281T 309 27.0000 29.1448 -2.1448                                          
67 10-282 321 29.3577 29.5697 -0.2120     CDC6in5ex6 RNase P   1.45 1     2 2 28.7871 28.9110 -0.1239 0.12 0.46 0.73 1.37 1.55 0.18
68 10-282 333 28.2166 28.2523 -0.0357                                          
69 DNActrl 369 25.4355 26.0694 -0.6339     CDC6in5ex6 RNase P   2.00 2     2 2 24.6436 25.2269 -0.5832 0.07 0.00 1.00 1.93 2.07 0.14
70 DNActrl 381 23.8517 24.3843 -0.5326                                          
71 NTC 345 39.3628 undetermined undetermined x NTC CDC6in5ex6 RNase P           2                    
72 NTC 357 34.5423 undetermined undetermined x NTC