Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120906_1000_2ndset_pl14-01_2.txt                                                    
5 Target name: CDC6in5ex6                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120906_1000_2ndset_pl14-01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/6/12 1:46:43 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 2 Copies: 4                                                    
29 - 3 Copies: 4                                                    
30 - 4 Copies: 2                                                    
31 - 6 Copies: 4                                                    
32                                                      
33 Total number of wells omitted from analysis: 5                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
35 - Outlier determined by the software: 1                                                    
36 - Negative control sample well: 2                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-327 9 31.6297 31.9898 -0.3600     CDC6in5ex6 RNase P   2.72 3     2 2 30.4753 31.4224 -0.9471 0.83 -0.44 1.36 1.81 4.08 2.27
41 10-327 21 29.3208 30.8550 -1.5342                                          
42 10-329 33 27.4565 27.4277 0.0288     CDC6in5ex6 RNase P   2.10 2     2 2 26.9254 27.5026 -0.5772 0.86 -0.07 1.05 1.38 3.20 1.82
43 10-329 45 26.3944 27.5775 -1.1831                                          
44 10-330 57 27.1239 28.0635 -0.9396     CDC6in5ex6 RNase P   3.65 4     2 2 26.6843 28.0569 -1.3726 0.61 -0.87 1.82 2.70 4.93 2.22
45 10-330 69 26.2447 28.0503 -1.8056                                          
46 10-331 81 26.0000 28.2583 -2.2583     CDC6in5ex6 RNase P   6.31 6     2 2 26.0564 28.2186 -2.1622 0.14 -1.66 3.15 5.90 6.74 0.84
47 10-331 93 26.1128 28.1790 -2.0661                                          
48 10-333 105 23.7508 27.6355 -3.8847     CDC6in5ex6 RNase P   6.30 6     2 2 25.8232 27.9837 -2.1605 2.44 -1.66 3.15 1.91 20.81 18.91
49 10-333 117 27.8956 28.3320 -0.4364                                          
50 10-335 129 26.9654 28.5644 -1.5991     CDC6in5ex6 RNase P   5.75 6     2 2 26.1166 28.1444 -2.0278 0.61 -1.52 2.87 4.27 7.73 3.47
51 10-335 141 25.2678 27.7244 -2.4566                                          
52 10-336 153 25.2692 27.3835 -2.1143     CDC6in5ex6 RNase P   5.82 6     2 2 25.4745 27.5217 -2.0472 0.09 -1.54 2.91 5.56 6.10 0.54
53 10-336 165 25.6798 27.6599 -1.9801                                          
54 10-337 177 27.1318 28.4758 -1.3440     CDC6in5ex6 RNase P   3.19 3     2 2 27.5143 28.6924 -1.1782 0.23 -0.67 1.59 2.84 3.58 0.73
55 10-337 189 27.8967 28.9091 -1.0124                                          
56 10-338 201 26.6018 26.7903 -0.1885     CDC6in5ex6 RNase P   3.43 3     2 2 25.5698 26.8522 -1.2824 1.55 -0.78 1.71 1.61 7.32 5.71
57 10-338 213 24.5378 26.9141 -2.3763                                          
58 10-339 225 29.4685 29.9435 -0.4750     CDC6in5ex6 RNase P   1.81 2     2 2 29.1503 29.5137 -0.3634 0.16 0.14 0.91 1.68 1.96 0.28
59 10-339 237 28.8321 29.0839 -0.2517                                          
60 10-340 249 26.9930 28.8613 -1.8683     CDC6in5ex6 RNase P   4.49 4     2 2 27.2426 28.9134 -1.6708 0.28 -1.17 2.24 3.91 5.14 1.23
61 10-340 261 27.4922 28.9654 -1.4732                                          
62 10-341 273 32.5452 33.3106 -0.7654 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
63 10-341 285 33.3853 33.2229 0.1625 x VICET                                      
64 10-342 297 27.1555 27.3705 -0.2150     CDC6in5ex6 RNase P   1.64 2     2 1 27.1555 27.3705 -0.2150 0.00 0.29 0.82 1.64 1.64 0.00
65 10-342 309 19.2517 26.7465 -7.4949 x OCONF                                      
66 10-343 321 29.1327 31.5237 -2.3910     CDC6in5ex6 RNase P   3.46 3     2 2 29.9615 31.2578 -1.2963 1.55 -0.79 1.73 1.62 7.39 5.77
67 10-343 333 30.7902 30.9919 -0.2017                                          
68 DNActrl 369 24.1721 24.4646 -0.2925     CDC6in5ex6 RNase P   2.00 2     2 2 23.9648 24.4702 -0.5053 0.30 0.00 1.00 1.73 2.32 0.59
69 DNActrl 381 23.7575 24.4757 -0.7182                                          
70 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in5ex6 RNase P           2                    
71 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC