Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120907_1000_2ndset_pl18_01.txt                                                    
5 Target name: CDC6in5ex6                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120907_1000_2ndset_pl18_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/7/12 2:52:09 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 2                                                    
28 - 2 Copies: 3                                                    
29 - 3 Copies: 2                                                    
30 - 4 Copies: 5                                                    
31 - 5 Copies: 1                                                    
32 - 6 Copies: 2                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
35 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 4                                                    
36 - Negative control sample well: 2                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-170 129 26.2832 26.6387 -0.3555     CDC6in5ex6 RNase P   1.86 2     2 2 26.6464 26.9352 -0.2889 0.09 0.10 0.93 1.78 1.95 0.17
41 10-170 141 27.0095 27.2318 -0.2223                                          
42 10-442 9 28.7130 29.9135 -1.2006     CDC6in5ex6 RNase P   3.61 4     2 2 28.0586 29.3039 -1.2453 0.06 -0.85 1.81 3.50 3.73 0.22
43 10-442 21 27.4042 28.6943 -1.2901                                          
44 10-447 33 25.6319 27.5730 -1.9411     CDC6in5ex6 RNase P   4.50 4     2 2 26.3039 27.8657 -1.5619 0.54 -1.17 2.25 3.46 5.85 2.39
45 10-447 45 26.9759 28.1585 -1.1826                                          
46 10-450 57 32.3084 33.3324 -1.0241 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
47 10-450 69 31.9588 33.1792 -1.2203 x VICET                                      
48 10-462T 81 29.2145 30.8867 -1.6722     CDC6in5ex6 RNase P   3.86 4     2 2 29.3662 30.7063 -1.3401 0.47 -0.95 1.93 3.06 4.86 1.79
49 10-462T 93 29.5179 30.5260 -1.0080                                          
50 10-463 105 26.4121 28.3305 -1.9184     CDC6in5ex6 RNase P   5.91 6     2 2 26.3800 28.3350 -1.9550 0.05 -1.56 2.95 5.76 6.06 0.30
51 10-463 117 26.3480 28.3396 -1.9916                                          
52 10-468T 153 25.6160 26.7393 -1.1234     CDC6in5ex6 RNase P   3.16 3     2 2 25.9148 26.9690 -1.0542 0.10 -0.66 1.58 3.02 3.32 0.30
53 10-468T 165 26.2137 27.1987 -0.9850                                          
54 10-470 177 26.7012 27.2852 -0.5840     CDC6in5ex6 RNase P   2.43 2     2 2 26.5989 27.2731 -0.6742 0.13 -0.28 1.22 2.28 2.59 0.30
55 10-470 189 26.4966 27.2610 -0.7644                                          
56 10-476 201 33.9272 34.9508 -1.0236 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
57 10-476 213 34.3766 33.8790 0.4976 x VICET                                      
58 10-480 225 27.4974 29.2669 -1.7695     CDC6in5ex6 RNase P   5.51 6     2 2 27.1753 29.0287 -1.8534 0.12 -1.46 2.75 5.19 5.83 0.64
59 10-480 237 26.8533 28.7905 -1.9372                                          
60 10-484 249 29.1612 31.2008 -2.0396     CDC6in5ex6 RNase P   5.16 5     2 2 29.5091 31.2687 -1.7596 0.40 -1.37 2.58 4.25 6.26 2.02
61 10-484 261 29.8570 31.3366 -1.4796                                          
62 10-486 273 26.4044 27.9692 -1.5648     CDC6in5ex6 RNase P   4.17 4     2 2 26.2396 27.6917 -1.4520 0.16 -1.06 2.08 3.85 4.51 0.65
63 10-486 285 26.0748 27.4142 -1.3393                                          
64 10-496 297 28.9631 30.1196 -1.1565     CDC6in5ex6 RNase P   3.33 3     2 2 29.4327 30.5620 -1.1293 0.04 -0.74 1.67 3.27 3.40 0.13
65 10-496 309 29.9024 31.0045 -1.1021                                          
66 10-497 321 28.0510 29.5358 -1.4848     CDC6in5ex6 RNase P   3.89 4     2 2 28.2226 29.5738 -1.3511 0.19 -0.96 1.94 3.54 4.26 0.72
67 10-497 333 28.3943 29.6117 -1.2174                                          
68 DNActrl 369 24.5944 24.9410 -0.3466     CDC6in5ex6 RNase P   2.00 2     2 2 24.4836 24.8762 -0.3926 0.07 0.00 1.00 1.94 2.06 0.13
69 DNActrl 381 24.3728 24.8114 -0.4387                                          
70 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in5ex6 RNase P           2                    
71 NTC 357 34.8592 undetermined undetermined x NTC