Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120913_1000_2ndset_pl29_01.txt                                                    
5 Target name: CDC6in5ex6                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120913_1000_2ndset_pl29_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/13/12 1:19:28 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 2                                                    
28 - 1 Copy: 1                                                    
29 - 2 Copies: 5                                                    
30 - 3 Copies: 2                                                    
31 - 4 Copies: 1                                                    
32 - 5 Copies: 2                                                    
33 - 6 Copies: 2                                                    
34                                                      
35 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
36 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 4                                                    
37 - Negative control sample well: 2                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-810 9 28.0980 29.7843 -1.6863     CDC6in5ex6 RNase P   5.97 6     2 2 27.7924 29.4158 -1.6234 0.09 -1.58 2.98 5.72 6.24 0.52
42 10-810 21 27.4868 29.0473 -1.5605                                          
43 10-812 33 29.6107 30.4546 -0.8440     CDC6in5ex6 RNase P   3.69 4     2 2 29.2524 30.1826 -0.9302 0.12 -0.88 1.85 3.48 3.92 0.44
44 10-812 45 28.8941 29.9105 -1.0164                                          
45 10-813b 57 28.4986 27.3215 1.1771     CDC6in5ex6 RNase P   1.06 1     2 2 28.2322 27.3587 0.8735 0.43 0.92 0.53 0.86 1.31 0.45
46 10-813b 69 27.9658 27.3960 0.5698                                          
47 10-814 81 30.3311 30.7673 -0.4362     CDC6in5ex6 RNase P   2.32 2     2 2 30.2189 30.4772 -0.2583 0.25 -0.21 1.16 2.05 2.62 0.57
48 10-814 93 30.1067 30.1872 -0.0805                                          
49 10-817 105 28.6111 29.2484 -0.6373     CDC6in5ex6 RNase P   2.85 3     2 2 28.7031 29.2619 -0.5587 0.11 -0.51 1.43 2.70 3.01 0.31
50 10-817 117 28.7952 29.2754 -0.4802                                          
51 10-819 129 29.0593 29.5570 -0.4977     CDC6in5ex6 RNase P   2.48 2     2 2 28.9657 29.3210 -0.3553 0.20 -0.31 1.24 2.25 2.74 0.49
52 10-819 141 28.8721 29.0850 -0.2129                                          
53 10-820 153 30.8210 32.0595 -1.2385     CDC6in5ex6 RNase P   5.03 5     2 2 30.8347 32.2122 -1.3775 0.20 -1.33 2.52 4.57 5.54 0.97
54 10-820 165 30.8484 32.3649 -1.5165                                          
55 10-821 177 33.6450 33.4592 0.1858 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
56 10-821 189 33.3739 33.9464 -0.5724 x VICET                                      
57 10-823T 201 29.1881 30.6315 -1.4434     CDC6in5ex6 RNase P   5.30 5     2 2 29.2104 30.6623 -1.4518 0.01 -1.41 2.65 5.27 5.33 0.06
58 10-823T 213 29.2328 30.6931 -1.4603                                          
59 10-824 225 28.6219 28.6619 -0.0400     CDC6in5ex6 RNase P   1.95 2     2 2 28.9046 28.9136 -0.0091 0.04 0.04 0.97 1.91 1.99 0.08
60 10-824 237 29.1872 29.1653 0.0219                                          
61 10-829b 249 29.1268 29.8259 -0.6991     CDC6in5ex6 RNase P   3.07 3     2 2 28.9956 29.6592 -0.6636 0.05 -0.62 1.53 2.99 3.15 0.15
62 10-829b 261 28.8644 29.4925 -0.6281                                          
63 10-831 273 32.9168 34.2666 -1.3498 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
64 10-831 285 34.1572 33.2514 0.9058 x VICET                                      
65 10-832 297 27.4788 28.6761 -1.1973     CDC6in5ex6 RNase P   5.56 6     2 2 27.1125 28.6345 -1.5220 0.46 -1.48 2.78 4.44 6.97 2.53
66 10-832 309 26.7463 28.5929 -1.8466                                          
67 10-833 321 28.6116 28.6622 -0.0506     CDC6in5ex6 RNase P   2.06 2     2 2 28.5786 28.6699 -0.0913 0.06 -0.05 1.03 2.01 2.12 0.12
68 10-833 333 28.5455 28.6776 -0.1321                                          
69 DNActrl 369 24.3682 24.4903 -0.1221     CDC6in5ex6 RNase P   2.00 2     2 2 23.9669 24.0126 -0.0457 0.11 0.00 1.00 1.90 2.11 0.21
70 DNActrl 381 23.5656 23.5349 0.0308                                          
71 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in5ex6 RNase P           2                    
72 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC