Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120914_1000_2ndset_pl31_01.txt                                                    
5 Target name: CDC6in5ex6                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120914_1000_2ndset_pl31_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/14/12 12:09:53 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 2 Copies: 4                                                    
29 - 3 Copies: 5                                                    
30 - 4 Copies: 3                                                    
31 - 5 Copies: 1                                                    
32 > 10 Copies: 1                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
35 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
36 - Negative control sample well: 2                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-868 9 25.5907 29.5295 -3.9389     CDC6in5ex6 RNase P   25.37 25     2 2 25.4357 29.1349 -3.6992 0.34 -3.66 12.68 21.48 29.95 8.47
41 10-868 21 25.2807 28.7403 -3.4596                                          
42 10-870 33 24.6748 25.1969 -0.5221     CDC6in5ex6 RNase P   2.86 3     2 2 24.9562 25.5069 -0.5507 0.04 -0.52 1.43 2.80 2.92 0.11
43 10-870 45 25.2377 25.8170 -0.5793                                          
44 10-871 57 26.1220 27.2658 -1.1438     CDC6in5ex6 RNase P   3.69 4     2 2 26.1540 27.0710 -0.9170 0.32 -0.88 1.84 3.15 4.32 1.16
45 10-871 69 26.1859 26.8762 -0.6903                                          
46 10-872 81 24.8296 25.9516 -1.1220     CDC6in5ex6 RNase P   3.98 4     2 2 24.9389 25.9668 -1.0279 0.13 -0.99 1.99 3.73 4.25 0.52
47 10-872 93 25.0482 25.9819 -0.9338                                          
48 10-873 105 26.4632 27.8466 -1.3834     CDC6in5ex6 RNase P   4.73 5     2 2 26.5987 27.8756 -1.2769 0.15 -1.24 2.37 4.40 5.09 0.70
49 10-873 117 26.7341 27.9045 -1.1704                                          
50 10-875 129 25.8042 26.2983 -0.4941     CDC6in5ex6 RNase P   2.62 3     2 2 25.7620 26.1864 -0.4245 0.10 -0.39 1.31 2.50 2.75 0.25
51 10-875 141 25.7197 26.0746 -0.3549                                          
52 10-877 153 30.0122 29.8282 0.1840     CDC6in5ex6 RNase P   1.62 2     2 2 30.3139 30.0411 0.2728 0.13 0.31 0.81 1.52 1.72 0.20
53 10-877 165 30.6155 30.2539 0.3616                                          
54 10-881 177 26.6991 27.0462 -0.3471     CDC6in5ex6 RNase P   3.03 3     2 2 26.2314 26.8669 -0.6355 0.41 -0.60 1.52 2.48 3.70 1.22
55 10-881 189 25.7637 26.6876 -0.9239                                          
56 10-882 201 31.5563 32.6539 -1.0976     CDC6in5ex6 RNase P   3.82 4     2 2 31.7274 32.6946 -0.9672 0.18 -0.93 1.91 3.49 4.18 0.69
57 10-882 213 31.8985 32.7352 -0.8367                                          
58 10-883 225 31.2136 33.0783 -1.8647 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
59 10-883 237 31.5754 33.0614 -1.4860 x VICET                                      
60 10-884 249 30.9197 31.8059 -0.8862     CDC6in5ex6 RNase P   2.96 3     2 2 31.0623 31.6639 -0.6016 0.40 -0.57 1.48 2.43 3.61 1.18
61 10-884 261 31.2049 31.5219 -0.3169                                          
62 10-885 273 28.4839 28.9765 -0.4926     CDC6in5ex6 RNase P   2.98 3     2 2 28.3762 28.9850 -0.6088 0.16 -0.57 1.49 2.75 3.23 0.48
63 10-885 285 28.2684 28.9935 -0.7251                                          
64 10-887 297 29.4589 29.5090 -0.0502     CDC6in5ex6 RNase P   2.19 2     2 2 29.4030 29.5701 -0.1671 0.17 -0.13 1.10 2.02 2.38 0.36
65 10-887 309 29.3472 29.6312 -0.2840                                          
66 10-888 321 28.3909 28.4771 -0.0863     CDC6in5ex6 RNase P   1.84 2     2 2 28.4381 28.3555 0.0827 0.24 0.12 0.92 1.64 2.07 0.43
67 10-888 333 28.4854 28.2338 0.2516                                          
68 DNActrl 369 24.0216 24.0402 -0.0186     CDC6in5ex6 RNase P   2.00 2     2 2 23.9887 24.0231 -0.0344 0.02 0.00 1.00 1.98 2.02 0.04
69 DNActrl 381 23.9557 24.0059 -0.0502                                          
70 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in5ex6 RNase P           2                    
71 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC