Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120903_1000_2ndset_pl5_01.txt                                                    
5 Target name: CDC6in5ex6                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120903_1000_2ndset_pl5_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/3/12 3:04:06 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 2 Copies: 6                                                    
29 - 3 Copies: 4                                                    
30 - 4 Copies: 2                                                    
31 - 6 Copies: 1                                                    
32 - 8 Copies: 1                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
35 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
36 - Negative control sample well: 2                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-102 9 29.3468 29.7623 -0.4155     CDC6in5ex6 RNase P   2.58 3     2 2 28.9345 29.4065 -0.4720 0.08 -0.37 1.29 2.49 2.69 0.20
41 10-102 21 28.5222 29.0507 -0.5285                                          
42 10-103 33 31.3361 31.2449 0.0912     CDC6in5ex6 RNase P   1.77 2     2 2 30.6868 30.6116 0.0751 0.02 0.18 0.88 1.75 1.79 0.04
43 10-103 45 30.0374 29.9783 0.0591                                          
44 10-105 57 28.0261 28.7420 -0.7159     CDC6in5ex6 RNase P   2.34 2     2 2 28.2176 28.5450 -0.3274 0.55 -0.23 1.17 1.79 3.06 1.27
45 10-105 69 28.4092 28.3481 0.0611                                          
46 10-106 81 29.0808 30.9787 -1.8979     CDC6in5ex6 RNase P   6.14 6     2 2 28.9739 30.6952 -1.7212 0.25 -1.62 3.07 5.44 6.94 1.51
47 10-106 93 28.8671 30.4117 -1.5446                                          
48 10-107 105 24.5061 25.6594 -1.1533     CDC6in5ex6 RNase P   3.61 4     2 2 24.7990 25.7527 -0.9537 0.28 -0.85 1.80 3.14 4.14 1.00
49 10-107 117 25.0920 25.8460 -0.7541                                          
50 10-109 129 27.5178 27.3653 0.1525     CDC6in5ex6 RNase P   1.67 2     2 2 27.0329 26.8749 0.1580 0.01 0.26 0.84 1.66 1.68 0.01
51 10-109 141 26.5480 26.3846 0.1634                                          
52 10-110 153 26.1304 28.4423 -2.3119     CDC6in5ex6 RNase P   8.19 8     2 2 26.0821 28.2174 -2.1353 0.25 -2.03 4.09 7.24 9.25 2.01
53 10-110 165 26.0338 27.9924 -1.9587                                          
54 10-112 177 26.9883 27.5805 -0.5923     CDC6in5ex6 RNase P   3.39 3     2 2 27.0235 27.8856 -0.8621 0.38 -0.76 1.69 2.81 4.08 1.27
55 10-112 189 27.0588 28.1906 -1.1318                                          
56 10-113 201 27.6156 28.8987 -1.2832     CDC6in5ex6 RNase P   4.29 4     2 2 27.1950 28.3990 -1.2040 0.11 -1.10 2.15 4.06 4.54 0.47
57 10-113 213 26.7745 27.8993 -1.1247                                          
58 10-114 225 27.7804 28.1280 -0.3476     CDC6in5ex6 RNase P   2.36 2     2 2 27.6137 27.9536 -0.3399 0.01 -0.24 1.18 2.35 2.37 0.03
59 10-114 237 27.4471 27.7793 -0.3322                                          
60 10-115 249 33.5889 34.8665 -1.2776 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
61 10-115 261 33.2635 33.8333 -0.5698 x VICET                                      
62 10-117 273 27.6701 28.8465 -1.1764     CDC6in5ex6 RNase P   3.23 3     2 2 28.1116 28.9061 -0.7945 0.54 -0.69 1.62 2.48 4.21 1.73
63 10-117 285 28.5530 28.9656 -0.4126                                          
64 10-119 297 28.6788 28.9707 -0.2918     CDC6in5ex6 RNase P   1.93 2     2 2 28.4808 28.5332 -0.0524 0.34 0.05 0.97 1.64 2.28 0.64
65 10-119 309 28.2828 28.0957 0.1871                                          
66 10-120 321 27.5232 28.4838 -0.9607     CDC6in5ex6 RNase P   3.36 3     2 2 27.0525 27.9041 -0.8516 0.15 -0.75 1.68 3.12 3.63 0.51
67 10-120 333 26.5819 27.3245 -0.7425                                          
68 DNActrl 369 25.6042 25.8596 -0.2554     CDC6in5ex6 RNase P   2.00 2     2 2 25.3014 25.4035 -0.1021 0.22 0.00 1.00 1.80 2.22 0.43
69 DNActrl 381 24.9987 24.9474 0.0513                                          
70 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in5ex6 RNase P           2                    
71 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC