Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/CDC6_in5ex6/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120904_1000_2ndset_pl9_01.txt                                                    
5 Target name: CDC6in5ex6                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120904_1000_2ndset_pl9_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/4/12 4:00:46 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 3                                                    
28 - 0 Copy: 1                                                    
29 - 1 Copy: 1                                                    
30 - 2 Copies: 4                                                    
31 - 3 Copies: 2                                                    
32 - 4 Copies: 2                                                    
33 - 5 Copies: 1                                                    
34 - 8 Copies: 1                                                    
35                                                      
36 Total number of wells omitted from analysis: 9                                                    
37 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
38 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 6                                                    
39 - Negative control sample well: 2                                                    
40                                                      
41                                                      
42 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
43 10-211 9 25.0377 26.3895 -1.3518     CDC6in5ex6 RNase P   3.93 4     2 2 25.1838 26.3750 -1.1912 0.23 -0.98 1.97 3.52 4.39 0.88
44 10-211 21 25.3299 26.3605 -1.0306                                          
45 10-215 33 27.8916 29.5699 -1.6783     CDC6in5ex6 RNase P   4.99 5     2 2 27.5512 29.0866 -1.5354 0.20 -1.32 2.50 4.52 5.51 0.99
46 10-215 45 27.2108 28.6034 -1.3926                                          
47 10-216 57 28.9700 29.6391 -0.6691     CDC6in5ex6 RNase P   2.99 3     2 2 29.2111 30.0058 -0.7947 0.18 -0.58 1.49 2.74 3.26 0.52
48 10-216 69 29.4522 30.3725 -0.9203                                          
49 10-221a 81 27.2142 28.3977 -1.1836     CDC6in5ex6 RNase P   3.67 4     2 2 26.8232 27.9153 -1.0921 0.13 -0.88 1.84 3.45 3.91 0.47
50 10-221a 93 26.4323 27.4330 -1.0006                                          
51 10-222 105 25.0237 26.9346 -1.9109     CDC6in5ex6 RNase P   7.69 8     2 2 24.9912 27.1501 -2.1589 0.35 -1.94 3.84 6.47 9.13 2.66
52 10-222 117 24.9586 27.3656 -2.4070                                          
53 10-223c 129 25.8695 26.2543 -0.3848     CDC6in5ex6 RNase P   2.10 2     2 2 25.6598 25.9463 -0.2865 0.14 -0.07 1.05 1.96 2.25 0.29
54 10-223c 141 25.4502 25.6384 -0.1883                                          
55 10-226 153 31.3611 31.1140 0.2471     CDC6in5ex6 RNase P   1.12 1     2 2 31.4670 30.8524 0.6146 0.52 0.83 0.56 0.87 1.45 0.58
56 10-226 165 31.5730 30.5908 0.9821                                          
57 10-228 177 36.8066 32.8181 3.9885     CDC6in5ex6 RNase P   0.11 0     2 1 36.8066 32.8181 3.9885 0.00 4.20 0.05 0.11 0.11 0.00
58 10-228 189 34.3085 33.2465 1.0620 x VICET                                      
59 10-230T 201 31.1413 31.5129 -0.3717     CDC6in5ex6 RNase P   2.03 2     2 2 30.7560 30.9969 -0.2410 0.18 -0.02 1.02 1.86 2.23 0.37
60 10-230T 213 30.3706 30.4809 -0.1103                                          
61 10-233 225 undetermined 35.4188 undetermined x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
62 10-233 237 undetermined undetermined undetermined x NOVIC                                      
63 10-234 249 37.4366 36.3975 1.0391 x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
64 10-234 261 39.7196 37.1575 2.5621 x VICET                                      
65 10-235 273 undetermined 36.4560 undetermined x VICET CDC6in5ex6 RNase P           2                    
66 10-235 285 33.9698 39.3464 -5.3765 x VICET                                      
67 10-237b 297 28.2558 28.5229 -0.2671     CDC6in5ex6 RNase P   2.61 3     2 2 28.5231 29.1220 -0.5989 0.47 -0.38 1.30 2.07 3.28 1.21
68 10-237b 309 28.7904 29.7211 -0.9306                                          
69 10-238 321 27.5827 27.9931 -0.4103     CDC6in5ex6 RNase P   2.01 2     2 2 27.2631 27.4867 -0.2236 0.26 -0.01 1.01 1.77 2.29 0.52
70 10-238 333 26.9434 26.9804 -0.0370                                          
71 DNActrl 369 25.0459 25.2875 -0.2416     CDC6in5ex6 RNase P   2.00 2     2 2 24.6065 24.8225 -0.2160 0.04 0.00 1.00 1.96 2.04 0.07
72 DNActrl 381 24.1671 24.3575 -0.1904                                          
73 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC CDC6in5ex6 RNase P           2                    
74 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC