Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120911_1000_2ndset_pl23_01.txt                                                    
5 Target name: IGFBP4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120911_1000_2ndset_pl23_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/11/12 12:59:09 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 2 Copies: 3                                                    
29 - 4 Copies: 3                                                    
30 - 5 Copies: 1                                                    
31 - 6 Copies: 2                                                    
32 - 7 Copies: 1                                                    
33 - 8 Copies: 2                                                    
34 - 9 Copies: 1                                                    
35 > 10 Copies: 1                                                    
36                                                      
37 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
38 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
39 - Negative control sample well: 2                                                    
40                                                      
41                                                      
42 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
43 10-616 11 29.3018 29.2162 0.0856     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 8.10 8     2 2 28.9538 28.9286 0.0252 0.09 -2.02 4.05 7.76 8.44 0.68
44 10-616 23 28.6058 28.6410 -0.0352         23                                
45 10-620 35 30.7776 30.7746 0.0031     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 7.25 7     2 2 30.8480 30.6635 0.1846 0.26 -1.86 3.62 6.39 8.22 1.83
46 10-620 47 30.9184 30.5524 0.3660         23                                
47 10-621 59 29.4403 29.3189 0.1215     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 8.21 8     2 2 29.0306 29.0249 0.0056 0.16 -2.04 4.10 7.57 8.89 1.32
48 10-621 71 28.6208 28.7310 -0.1102         23                                
49 10-623T 83 33.5137 30.9773 2.5364     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 2.18 2     2 2 33.0052 31.0883 1.9169 0.88 -0.13 1.09 1.42 3.35 1.93
50 10-623T 95 32.4968 31.1993 1.2975         23                                
51 10-627 107 undetermined 34.0263 undetermined x VICET IGFBP4ex1in1 RNase P 23         2                    
52 10-627 119 36.2745 34.4849 1.7896 x VICET     23                                
53 10-628 131 28.2892 27.1372 1.1520     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 4.46 4     2 2 27.6808 26.7969 0.8839 0.38 -1.16 2.23 3.71 5.38 1.67
54 10-628 143 27.0724 26.4567 0.6157         23                                
55 10-637IS 155 32.6269 31.6890 0.9379     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 3.82 4     2 2 32.8661 31.7571 1.1090 0.24 -0.93 1.91 3.39 4.30 0.91
56 10-637IS 167 33.1052 31.8251 1.2801         23                                
57 10-638 179 30.7695 30.0330 0.7365     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 5.70 6     2 2 30.1646 29.6344 0.5302 0.29 -1.51 2.85 4.94 6.58 1.64
58 10-638 191 29.5597 29.2357 0.3239         23                                
59 10-641 203 29.6969 30.5883 -0.8914     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 17.46 17     2 2 29.2489 30.3323 -1.0834 0.27 -3.13 8.73 15.28 19.94 4.66
60 10-641 215 28.8009 30.0763 -1.2754         23                                
61 10-644 227 31.4088 30.9386 0.4701     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 6.40 6     2 2 31.0721 30.7076 0.3645 0.15 -1.68 3.20 5.95 6.88 0.94
62 10-644 239 30.7354 30.4765 0.2589         23                                
63 10-645 251 35.5510 32.9992 2.5518     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 2.39 2     2 2 34.7528 32.9693 1.7835 1.09 -0.26 1.20 1.40 4.08 2.67
64 10-645 263 33.9545 32.9394 1.0152         23                                
65 10-646 275 27.0039 27.3181 -0.3142     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 9.17 9     2 2 27.1193 27.2744 -0.1551 0.22 -2.20 4.59 8.22 10.24 2.03
66 10-646 287 27.2348 27.2308 0.0040         23                                
67 10-648 299 29.9138 29.1668 0.7469     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 5.15 5     2 2 29.6433 28.9660 0.6773 0.10 -1.37 2.58 4.91 5.41 0.50
68 10-648 311 29.3729 28.7652 0.6077         23                                
69 10-649 323 29.8504 28.9112 0.9392     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 3.73 4     2 2 29.8535 28.7107 1.1428 0.29 -0.90 1.87 3.24 4.30 1.06
70 10-649 335 29.8566 28.5103 1.3463         23                                
71 DNActrl 371 26.5259 24.3316 2.1943     IGFBP4ex1in1 RNase P 23 2.00 2     2 2 26.1939 24.1516 2.0423 0.21 0.00 1.00 1.80 2.22 0.42
72 DNActrl 383 25.8618 23.9715 1.8903         23                                
73 NTC 347 undetermined undetermined undetermined x NTC IGFBP4ex1in1 RNase P 23         2                    
74 NTC 359 undetermined 36.5800 undetermined x NTC     23