Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120907_1000_2ndset_pl18_01.txt                                                    
5 Target name: IGFBP4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120907_1000_2ndset_pl18_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/7/12 2:52:09 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 2                                                    
28 - 2 Copies: 1                                                    
29 - 4 Copies: 2                                                    
30 - 5 Copies: 3                                                    
31 - 6 Copies: 2                                                    
32 - 7 Copies: 1                                                    
33 - 8 Copies: 1                                                    
34 - 10 Copies: 1                                                    
35 > 10 Copies: 2                                                    
36                                                      
37 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
38 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 4                                                    
39 - Negative control sample well: 2                                                    
40                                                      
41                                                      
42 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
43 10-170 131 29.0562 27.9271 1.1291     IGFBP4ex1in1 RNase P   4.13 4     2 2 28.4544 27.7883 0.6661 0.65 -1.05 2.07 3.00 5.70 2.70
44 10-170 143 27.8526 27.6494 0.2031                                          
45 10-442 11 30.1168 30.5095 -0.3927     IGFBP4ex1in1 RNase P   7.53 8     2 2 29.8217 30.0208 -0.1991 0.27 -1.91 3.76 6.58 8.61 2.03
46 10-442 23 29.5266 29.5320 -0.0054                                          
47 10-447 35 27.0226 28.0707 -1.0481     IGFBP4ex1in1 RNase P   11.33 11     2 2 27.6086 28.3972 -0.7885 0.37 -2.50 5.66 9.46 13.56 4.10
48 10-447 47 28.1947 28.7236 -0.5289                                          
49 10-450 59 32.0843 33.5462 -1.4618 x VICET IGFBP4ex1in1 RNase P           2                    
50 10-450 71 34.1662 33.5582 0.6080 x VICET                                      
51 10-462T 83 30.6851 31.1446 -0.4594     IGFBP4ex1in1 RNase P   6.97 7     2 2 31.1926 31.2796 -0.0869 0.53 -1.80 3.48 5.38 9.02 3.64
52 10-462T 95 31.7001 31.4146 0.2856                                          
53 10-463 107 29.1611 29.1053 0.0559     IGFBP4ex1in1 RNase P   5.28 5     2 2 29.4193 29.1078 0.3116 0.36 -1.40 2.64 4.43 6.31 1.88
54 10-463 119 29.6776 29.1103 0.5673                                          
55 10-468T 155 27.4637 27.0110 0.4527     IGFBP4ex1in1 RNase P   5.00 5     2 2 27.9752 27.5835 0.3917 0.09 -1.32 2.50 4.79 5.22 0.42
56 10-468T 167 28.4867 28.1560 0.3307                                          
57 10-470 179 28.6380 28.1939 0.4441     IGFBP4ex1in1 RNase P   4.43 4     2 2 28.5293 27.9640 0.5653 0.17 -1.15 2.22 4.08 4.82 0.75
58 10-470 191 28.4206 27.7341 0.6865                                          
59 10-476 203 34.2612 34.0487 0.2125 x VICET IGFBP4ex1in1 RNase P           2                    
60 10-476 215 38.5208 34.6362 3.8846 x VICET                                      
61 10-480 227 28.5138 29.6161 -1.1024     IGFBP4ex1in1 RNase P   13.67 14     2 2 28.5020 29.5611 -1.0590 0.06 -2.77 6.83 13.26 14.08 0.82
62 10-480 239 28.4903 29.5060 -1.0157                                          
63 10-484 251 30.2750 31.5780 -1.3030     IGFBP4ex1in1 RNase P   10.33 10     2 2 31.1931 31.8491 -0.6560 0.92 -2.37 5.17 6.60 16.18 9.58
64 10-484 263 32.1112 32.1202 -0.0089                                          
65 10-486 275 28.6505 28.4252 0.2253     IGFBP4ex1in1 RNase P   5.49 5     2 2 28.6379 28.3822 0.2557 0.04 -1.46 2.75 5.38 5.61 0.23
66 10-486 287 28.6254 28.3392 0.2862                                          
67 10-496 299 30.0340 30.2012 -0.1672     IGFBP4ex1in1 RNase P   5.54 6     2 2 30.9909 30.7460 0.2448 0.58 -1.47 2.77 4.16 7.36 3.20
68 10-496 311 31.9477 31.2909 0.6568                                          
69 10-497 323 31.2199 30.3032 0.9167     IGFBP4ex1in1 RNase P   5.65 6     2 2 30.5686 30.3533 0.2153 0.99 -1.50 2.82 3.47 9.19 5.71
70 10-497 335 29.9173 30.4034 -0.4861                                          
71 DNActrl 371 27.2128 25.4577 1.7551     IGFBP4ex1in1 RNase P   2.00 2     2 2 26.9330 25.2196 1.7134 0.06 0.00 1.00 1.94 2.06 0.12
72 DNActrl 383 26.6532 24.9814 1.6717                                          
73 NTC 347 undetermined undetermined undetermined x NTC IGFBP4ex1in1 RNase P           2                    
74 NTC 359 36.9617 undetermined undetermined x NTC