Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4_exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120903_1000_2ndset_pl6_01.txt                                                    
5 Target name: IGFBP4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120903_1000_2ndset_pl6_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/3/12 5:06:32 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 1 Copy: 1                                                    
28 - 2 Copies: 2                                                    
29 - 3 Copies: 1                                                    
30 - 4 Copies: 5                                                    
31 - 5 Copies: 1                                                    
32 - 6 Copies: 1                                                    
33 - 7 Copies: 2                                                    
34 - 8 Copies: 1                                                    
35 > 10 Copies: 1                                                    
36                                                      
37 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
38 - Negative control sample well: 2                                                    
39                                                      
40                                                      
41 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
42 10-121 11 30.6768 29.1645 1.5123     IGFBP4ex1in1 RNase P   3.17 3     2 2 30.4844 29.0895 1.3949 0.17 -0.67 1.59 2.93 3.44 0.52
43 10-121 23 30.2919 29.0144 1.2774                                          
44 10-130 35 26.2796 26.1423 0.1373     IGFBP4ex1in1 RNase P   7.36 7     2 2 26.2338 26.0520 0.1819 0.06 -1.88 3.68 7.13 7.59 0.45
45 10-130 47 26.1880 25.9616 0.2264                                          
46 10-131 59 28.3259 28.6278 -0.3019     IGFBP4ex1in1 RNase P   8.23 8     2 2 28.7054 28.6862 0.0192 0.45 -2.04 4.12 6.59 10.29 3.70
47 10-131 71 29.0848 28.7446 0.3403                                          
48 10-132 83 27.4605 27.2508 0.2097     IGFBP4ex1in1 RNase P   7.37 7     2 2 27.5122 27.3328 0.1794 0.04 -1.88 3.68 7.22 7.53 0.31
49 10-132 95 27.5638 27.4148 0.1490                                          
50 10-133 107 28.2400 27.2366 1.0034     IGFBP4ex1in1 RNase P   4.13 4     2 2 28.4594 27.4464 1.0130 0.01 -1.05 2.07 4.11 4.16 0.06
51 10-133 119 28.6789 27.6563 1.0226                                          
52 10-136 131 28.1627 27.7419 0.4208     IGFBP4ex1in1 RNase P   6.02 6     2 2 28.1484 27.6777 0.4707 0.07 -1.59 3.01 5.82 6.23 0.42
53 10-136 143 28.1341 27.6135 0.5206                                          
54 10-137 155 24.4392 25.2146 -0.7754     IGFBP4ex1in1 RNase P   12.22 12     2 2 25.2953 25.8456 -0.5502 0.32 -2.61 6.11 10.45 14.28 3.83
55 10-137 167 26.1515 26.4766 -0.3250                                          
56 10-139b 179 28.2201 27.2373 0.9828     IGFBP4ex1in1 RNase P   3.98 4     2 2 28.1346 27.0670 1.0675 0.12 -0.99 1.99 3.75 4.22 0.47
57 10-139b 191 28.0490 26.8968 1.1522                                          
58 10-141b 203 28.0947 27.0329 1.0618     IGFBP4ex1in1 RNase P   3.68 4     2 2 28.3696 27.1872 1.1825 0.17 -0.88 1.84 3.38 4.00 0.62
59 10-141b 215 28.6446 27.3414 1.3032                                          
60 10-143 227 32.3909 31.6074 0.7834     IGFBP4ex1in1 RNase P   3.84 4     2 2 32.6922 31.5711 1.1211 0.48 -0.94 1.92 3.04 4.85 1.81
61 10-143 239 32.9936 31.5348 1.4588                                          
62 10-146 251 29.7272 28.4253 1.3019     IGFBP4ex1in1 RNase P   3.69 4     2 2 30.0287 28.8526 1.1761 0.18 -0.88 1.85 3.38 4.03 0.65
63 10-146 263 30.3302 29.2800 1.0502                                          
64 10-147 275 27.8349 27.0364 0.7985     IGFBP4ex1in1 RNase P   4.63 5     2 2 27.7950 26.9441 0.8509 0.07 -1.21 2.31 4.46 4.80 0.34
65 10-147 287 27.7551 26.8518 0.9033                                          
66 10-149 299 31.9784 30.4073 1.5711     IGFBP4ex1in1 RNase P   2.10 2     2 2 32.6109 30.6194 1.9915 0.59 -0.07 1.05 1.57 2.81 1.24
67 10-149 311 33.2433 30.8315 2.4119                                          
68 10-150 323 32.5241 29.8673 2.6568     IGFBP4ex1in1 RNase P   1.25 1     2 2 32.3140 29.5790 2.7350 0.11 0.67 0.63 1.19 1.32 0.14
69 10-150 335 32.1040 29.2907 2.8133                                          
70 DNActrl 371 26.8683 24.8050 2.0633     IGFBP4ex1in1 RNase P   2.00 2     2 2 26.7944 24.7336 2.0608 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.01
71 DNActrl 383 26.7205 24.6622 2.0583                                          
72 NTC 347 undetermined undetermined undetermined x NTC IGFBP4ex1in1 RNase P           2                    
73 NTC 359 undetermined undetermined undetermined x NTC