Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4exin3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4exin3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120906_1000_2ndset_pl15_01_2.txt                                                    
5 Target name: IGFBP4ex3in3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120906_1000_2ndset_pl15_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/6/12 3:38:38 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 0 Copy: 1                                                    
29 - 1 Copy: 6                                                    
30 - 2 Copies: 5                                                    
31 - 3 Copies: 1                                                    
32 - 4 Copies: 1                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 5                                                    
35 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
36 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
37 - Outlier determined by the software: 1                                                    
38 - Negative control sample well: 2                                                    
39                                                      
40                                                      
41 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
42 10-346 12 27.5204 28.5817 -1.0613     IGFBP4ex3in3 RNase P   4.35 4     2 2 27.9259 28.9334 -1.0075 0.08 -1.12 2.17 4.19 4.51 0.32
43 10-346 24 28.3313 29.2851 -0.9538                                          
44 10-347 36 26.6271 26.0924 0.5347     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.78 2     2 2 26.1807 25.9009 0.2797 0.36 0.17 0.89 1.49 2.12 0.63
45 10-347 48 25.7342 25.7094 0.0248                                          
46 10-348 60 27.3337 27.8280 -0.4944     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.84 3     2 2 27.7573 28.1503 -0.3930 0.14 -0.51 1.42 2.65 3.05 0.40
47 10-348 72 28.1809 28.4725 -0.2916                                          
48 10-349 84 28.1188 27.7466 0.3722     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.68 2     2 2 28.0578 27.6975 0.3603 0.02 0.25 0.84 1.67 1.70 0.03
49 10-349 96 27.9969 27.6483 0.3485                                          
50 10-353 108 undetermined undetermined undetermined x NOVIC IGFBP4ex3in3 RNase P           2                    
51 10-353 120 undetermined 37.5894 undetermined x VICET                                      
52 10-356 132 31.2519 29.7347 1.5172     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.89 1     2 2 30.7667 29.4903 1.2764 0.34 1.16 0.45 0.76 1.05 0.30
53 10-356 144 30.2815 29.2459 1.0356                                          
54 10-357 156 29.2144 28.6503 0.5641     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.46 1     2 1 29.2144 28.6503 0.5641 0.00 0.45 0.73 1.46 1.46 0.00
55 10-357 168 28.9074 31.4897 -2.5823 x OCONF                                      
56 10-359 180 34.0354 30.9057 3.1297     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.48 0     2 2 33.5234 31.3398 2.1836 1.34 2.07 0.24 0.25 0.92 0.67
57 10-359 192 33.0113 31.7738 1.2374                                          
58 10-360 204 25.5201 25.7888 -0.2687     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.26 2     2 2 25.8565 25.9181 -0.0616 0.29 -0.17 1.13 1.95 2.60 0.65
59 10-360 216 26.1930 26.0475 0.1455                                          
60 10-361 228 27.0887 26.4458 0.6429     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.28 1     2 2 27.3069 26.5510 0.7558 0.16 0.64 0.64 1.18 1.38 0.20
61 10-361 240 27.5250 26.6562 0.8688                                          
62 10-363 252 31.4147 30.8129 0.6018     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.17 1     2 2 31.5273 30.6453 0.8821 0.40 0.77 0.59 0.97 1.42 0.46
63 10-363 264 31.6400 30.4776 1.1623                                          
64 10-364 276 25.8880 25.2755 0.6125     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.13 1     2 2 26.7315 25.7968 0.9346 0.46 0.82 0.57 0.90 1.41 0.51
65 10-364 288 27.5750 26.3182 1.2567                                          
66 10-369 300 31.6365 30.5155 1.1210     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.93 1     2 2 31.8430 30.6228 1.2202 0.14 1.11 0.46 0.87 0.99 0.13
67 10-369 312 32.0494 30.7301 1.3193                                          
68 10-374 324 27.9951 27.5949 0.4003     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.54 2     2 2 28.1370 27.6495 0.4875 0.12 0.38 0.77 1.45 1.64 0.19
69 10-374 336 28.2788 27.7041 0.5747                                          
70 DNActrl 372 24.6785 24.5408 0.1377     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.00 2     2 2 24.5477 24.4355 0.1122 0.04 0.00 1.00 1.97 2.04 0.07
71 DNActrl 384 24.4169 24.3302 0.0868                                          
72 NTC 348 undetermined undetermined undetermined x NTC IGFBP4ex3in3 RNase P           2                    
73 NTC 360 undetermined undetermined undetermined x NTC