Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4exin3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4exin3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120910_1000_2ndset_pl21_01.txt                                                    
5 Target name: IGFBP4ex3in3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120910_1000_2ndset_pl21_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/10/12 4:36:00 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 1 Copy: 3                                                    
27 - 2 Copies: 11                                                    
28                                                      
29 Total number of wells omitted from analysis: 5                                                    
30 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 3                                                    
31 - Negative control sample well: 2                                                    
32                                                      
33 Delta Ct variance: 0.3041                                                    
34                                                      
35                                                      
36 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
37 10-551 12 30.3634 29.5441 0.8193     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.62 2 0.72 0.14 2 2 29.9427 29.5391 0.4036 0.59 0.30 0.81 1.22 2.16 0.95
38 10-551 24 29.5220 29.5342 -0.0122                                          
39 10-553 36 26.6050 27.3629 -0.7579     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.28 2 0.80 0.17 2 2 27.2922 27.3794 -0.0872 0.95 -0.19 1.14 1.43 3.63 2.20
40 10-553 48 27.9794 27.3959 0.5835                                          
41 10-555 60 29.7162 29.7787 -0.0625     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.33 2 0.77 0.32 2 2 29.6408 29.7616 -0.1208 0.08 -0.22 1.17 2.24 2.43 0.19
42 10-555 72 29.5653 29.7444 -0.1791                                          
43 10-556 84 31.7491 30.4159 1.3331     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.54 1 0.63 0.11 2 2 32.1076 30.1197 1.9879 0.93 1.89 0.27 0.34 0.85 0.51
44 10-556 96 32.4661 29.8234 2.6426                                          
45 10-560 108 27.9188 28.0139 -0.0951     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.57 2 0.62 0.25 2 2 29.2145 28.7610 0.4535 0.78 0.35 0.78 1.07 2.29 1.22
46 10-560 120 30.5102 29.5081 1.0021                                          
47 10-561 132 34.8210 33.2259 1.5951 x VICET IGFBP4ex3in3 RNase P           2                    
48 10-561 144 34.0557 33.8679 0.1878 x VICET                                      
49 10-563 156 29.4733 28.6011 0.8722     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.14 1 < 0.50 0.23 2 2 29.8932 28.9802 0.9130 0.06 0.81 0.57 1.11 1.17 0.06
50 10-563 168 30.3131 29.3593 0.9538                                          
51 10-564 180 32.1389 30.4256 1.7133     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.67 1 < 0.50 0.01 2 2 32.3760 30.6988 1.6772 0.05 1.58 0.34 0.65 0.69 0.03
52 10-564 192 32.6131 30.9721 1.6410                                          
53 10-565T 204 30.8688 30.1059 0.7630     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.96 2 0.75 0.16 2 2 29.5166 29.3880 0.1285 0.90 0.03 0.98 1.26 3.05 1.78
54 10-565T 216 28.1643 28.6702 -0.5060                                          
55 10-570 228 28.9837 29.2453 -0.2616     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.40 2 0.74 0.27 2 2 29.2564 29.4153 -0.1589 0.15 -0.26 1.20 2.23 2.57 0.34
56 10-570 240 29.5290 29.5853 -0.0562                                          
57 10-574 252 27.6810 27.6361 0.0448     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.91 2 0.80 0.11 2 2 28.0990 27.9345 0.1645 0.17 0.06 0.96 1.76 2.08 0.32
58 10-574 264 28.5170 28.2328 0.2841                                          
59 10-576 276 30.7943 31.1063 -0.3120     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.87 2 0.81 0.06 2 2 31.7586 31.5606 0.1980 0.72 0.10 0.94 1.31 2.66 1.35
60 10-576 288 32.7229 32.0149 0.7079                                          
61 10-585T 300 29.6716 29.7377 -0.0661     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.57 2 0.62 0.14 2 2 29.6431 29.1947 0.4484 0.73 0.35 0.79 1.10 2.25 1.15
62 10-585T 312 29.6146 28.6517 0.9629                                          
63 10-586 324 33.2880 32.9789 0.3090     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.73 2 < 0.50 0.28 2 1 33.2880 32.9789 0.3090 0.00 0.21 0.87 1.73 1.73 0.00
64 10-586 336 33.6880 33.0815 0.6065 x VICET                                      
65 DNActrl 372 24.3354 24.1299 0.2056     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.00 2 0.83 0.10 2 2 23.9562 23.8547 0.1015 0.15 0.00 1.00 1.86 2.15 0.29
66 DNActrl 384 23.5769 23.5795 -0.0026                                          
67 NTC 348 34.1214 undetermined undetermined x NTC IGFBP4ex3in3 RNase P           2                    
68 NTC 360 29.5468 undetermined undetermined x NTC