Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4exin3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/IGFBP4exin3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120913_1000_2ndset_pl29_01.txt                                                    
5 Target name: IGFBP4ex3in3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120913_1000_2ndset_pl29_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/13/12 1:19:28 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 0 Copy: 1                                                    
26 - 1 Copy: 10                                                    
27 - 2 Copies: 2                                                    
28 - 3 Copies: 1                                                    
29 > 10 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.3573                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-810 12 30.4213 29.1517 1.2696     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.30 1 0.59 0.24 2 2 29.7250 28.8119 0.9132 0.50 0.62 0.65 1.01 1.66 0.65
40 10-810 24 29.0288 28.4720 0.5568                                          
41 10-812 36 31.0000 29.7857 1.2143     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.69 1 0.99 0.44 2 2 31.5682 29.7364 1.8318 0.87 1.54 0.34 0.45 1.05 0.61
42 10-812 48 32.1365 29.6872 2.4493                                          
43 10-813b 60 27.7041 27.0042 0.6999     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.37 1 0.54 0.32 2 2 27.8972 27.0569 0.8403 0.20 0.55 0.68 1.24 1.51 0.27
44 10-813b 72 28.0902 27.1096 0.9807                                          
45 10-814 84 32.3065 29.8082 2.4983     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.39 0     2 2 32.7765 30.1439 2.6327 0.19 2.34 0.20 0.36 0.43 0.07
46 10-814 96 33.2465 30.4795 2.7670                                          
47 10-817 108 28.6764 28.5103 0.1661     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.93 2 < 0.50 0.03 2 2 29.4112 29.0721 0.3391 0.24 0.05 0.97 1.71 2.18 0.46
48 10-817 120 30.1460 29.6339 0.5121                                          
49 10-819 132 30.2408 28.9530 1.2878     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.81 1 0.98 0.21 2 2 31.1258 29.5313 1.5945 0.43 1.30 0.40 0.65 1.00 0.35
50 10-819 144 32.0109 30.1097 1.9013                                          
51 10-820 156 32.9661 31.3938 1.5723     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.02 1 0.88 0.05 2 2 33.3479 32.0830 1.2649 0.43 0.97 0.51 0.82 1.26 0.44
52 10-820 168 33.7297 32.7722 0.9576                                          
53 10-821 180 34.6173 32.7164 1.9009     IGFBP4ex3in3 RNase P   0.60 1 0.99 0.85 2 2 34.6016 32.5792 2.0223 0.17 1.73 0.30 0.55 0.65 0.10
54 10-821 192 34.5858 32.4421 2.1437                                          
55 10-823T 204 28.5483 30.6818 -2.1334     IGFBP4ex3in3 RNase P   11.43 11 < 0.50 0.05 2 2 28.4442 30.6693 -2.2251 0.13 -2.52 5.72 10.73 12.18 1.45
56 10-823T 216 28.3402 30.6569 -2.3167                                          
57 10-824 228 29.6232 28.5628 1.0603     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.14 1 0.82 0.08 2 2 29.6395 28.5428 1.0967 0.05 0.81 0.57 1.12 1.17 0.06
58 10-824 240 29.6558 28.5227 1.1330                                          
59 10-829b 252 30.3798 29.5831 0.7968     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.23 1 0.77 0.16 2 2 30.7614 29.7679 0.9935 0.28 0.70 0.61 1.07 1.41 0.34
60 10-829b 264 31.1431 29.9527 1.1903                                          
61 10-831 276 33.5937 32.5917 1.0019     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.22 1 0.58 0.14 2 1 33.5937 32.5917 1.0019 0.00 0.71 0.61 1.22 1.22 0.00
62 10-831 288 36.8556 33.9839 2.8717 x VICET                                      
63 10-832 300 28.3437 28.2787 0.0649     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.60 3 < 0.50 0.05 2 2 28.4838 28.5726 -0.0888 0.22 -0.38 1.30 2.34 2.89 0.56
64 10-832 312 28.6240 28.8666 -0.2425                                          
65 10-833 324 29.5714 28.3014 1.2700     IGFBP4ex3in3 RNase P   1.06 1 0.87 0.06 2 2 29.8415 28.6333 1.2082 0.09 0.92 0.53 1.01 1.10 0.09
66 10-833 336 30.1115 28.9651 1.1464                                          
67 DNActrl 372 24.2947 23.9521 0.3427     IGFBP4ex3in3 RNase P   2.00 2 < 0.50 0.01 2 2 24.0464 23.7562 0.2901 0.07 0.00 1.00 1.93 2.07 0.15
68 DNActrl 384 23.7980 23.5604 0.2376                                          
69 NTC 348 undetermined undetermined undetermined x NTC IGFBP4ex3in3 RNase P           2                    
70 NTC 360 undetermined undetermined undetermined x NTC