Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120917_1000_3rdset_pl1_01_2.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120917_1000_3rdset_pl1_01_2                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/17/12 2:08:05 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 30                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 2 Copies: 9                                                    
27 - 3 Copies: 11                                                    
28 - 4 Copies: 4                                                    
29 - 5 Copies: 3                                                    
30 - 6 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36 Delta Ct variance: 0.1691                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-001 3 34.7356 34.8575 -0.1219 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 1         2                    
41 10-001 9 35.7922 34.9692 0.8230 x VICET     1                                
42 10-004 27 29.8248 29.2093 0.6156     KRT20in2ex2 RNase P 1 1.70 2 0.97 1.00 2 2 30.0681 29.4971 0.5710 0.06 0.24 0.85 1.64 1.75 0.10
43 10-004 33 30.3113 29.7849 0.5264         1                                
44 10-008 51 24.6696 24.7610 -0.0914     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.72 3 < 0.50 0.46 2 2 24.3870 24.4981 -0.1111 0.03 -0.44 1.36 2.68 2.76 0.07
45 10-008 57 24.1043 24.2352 -0.1308         1                                
46 10-009b 75 27.6675 28.4450 -0.7774     KRT20in2ex2 RNase P 1 4.79 5 < 0.50 0.10 2 2 27.6717 28.5988 -0.9272 0.21 -1.26 2.40 4.32 5.32 1.00
47 10-009b 81 27.6758 28.7527 -1.0769         1                                
48 10-010 99 29.4849 29.7459 -0.2609     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.23 3 0.70 0.04 2 2 29.3279 29.6860 -0.3580 0.14 -0.69 1.61 3.02 3.45 0.44
49 10-010 105 29.1709 29.6261 -0.4552         1                                
50 10-012 123 27.8908 28.0950 -0.2042     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.72 3 < 0.50 0.43 2 2 27.7158 27.8260 -0.1102 0.13 -0.44 1.36 2.55 2.90 0.35
51 10-012 129 27.5407 27.5570 -0.0163         1                                
52 10-015 147 27.1208 27.6497 -0.5289     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.38 3 0.64 0.08 2 2 27.0721 27.4958 -0.4237 0.15 -0.76 1.69 3.14 3.64 0.49
53 10-015 153 27.0233 27.3419 -0.3185         1                                
54 10-016 171 25.9894 26.7964 -0.8071     KRT20in2ex2 RNase P 1 4.36 4 < 0.50 0.05 2 2 25.7343 26.5246 -0.7903 0.02 -1.12 2.18 4.31 4.41 0.10
55 10-016 177 25.4792 26.2529 -0.7736         1                                
56 10-017 195 29.3625 28.7358 0.6268     KRT20in2ex2 RNase P 1 1.72 2 0.99 0.77 2 2 28.9670 28.4151 0.5519 0.11 0.22 0.86 1.63 1.81 0.18
57 10-017 201 28.5714 28.0944 0.4770         1                                
58 10-020 219 27.3109 27.5931 -0.2822     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.95 3 0.64 0.09 2 2 27.2536 27.4810 -0.2273 0.08 -0.56 1.47 2.84 3.06 0.22
59 10-020 225 27.1964 27.3689 -0.1725         1                                
60 10-022T 243 29.9187 30.0744 -0.1557     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.50 3 < 0.50 0.08 2 2 29.6065 30.0794 -0.4729 0.45 -0.81 1.75 2.81 4.36 1.55
61 10-022T 249 29.2942 30.0843 -0.7901         1                                
62 10-024 267 27.4112 27.9983 -0.5871     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.60 4 < 0.50 0.36 2 2 27.2604 27.7743 -0.5139 0.10 -0.85 1.80 3.42 3.79 0.37
63 10-024 273 27.1097 27.5504 -0.4407         1                                
64 10-026 291 27.8055 28.2256 -0.4201     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.29 3 0.72 0.05 2 2 27.6172 28.0020 -0.3847 0.05 -0.72 1.64 3.21 3.37 0.16
65 10-026 297 27.4290 27.7783 -0.3493         1                                
66 10-029 315 27.9742 29.0198 -1.0457     KRT20in2ex2 RNase P 1 5.02 5 < 0.50 0.05 2 2 27.7626 28.7576 -0.9949 0.07 -1.33 2.51 4.85 5.20 0.35
67 10-029 321 27.5511 28.4953 -0.9442         1                                
68 10-030 15 31.2637 31.0297 0.2340     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.15 2 0.73 0.07 2 2 30.2430 30.0144 0.2286 0.01 -0.10 1.08 2.14 2.16 0.02
69 10-030 21 29.2223 28.9991 0.2232         1                                
70 10-032 39 26.2613 26.4227 -0.1613     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.48 2 < 0.50 0.49 2 2 26.3073 26.2817 0.0255 0.26 -0.31 1.24 2.17 2.82 0.64
71 10-032 45 26.3532 26.1408 0.2124         1                                
72 10-033 63 26.2263 27.1966 -0.9703     KRT20in2ex2 RNase P 1 5.52 6 < 0.50 0.29 2 2 26.1094 27.2400 -1.1306 0.23 -1.46 2.76 4.94 6.17 1.23
73 10-033 69 25.9925 27.2834 -1.2909         1                                
74 10-034 87 27.7134 28.1423 -0.4289     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.29 3 0.75 0.06 2 2 27.4585 27.8444 -0.3859 0.06 -0.72 1.65 3.20 3.39 0.20
75 10-034 93 27.2037 27.5465 -0.3428         1                                
76 10-035 111 29.1241 28.9804 0.1437     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.50 2 < 0.50 0.41 2 2 28.7749 28.7615 0.0134 0.18 -0.32 1.25 2.28 2.73 0.45
77 10-035 117 28.4257 28.5426 -0.1169         1                                
78 10-037 135 28.4430 29.1913 -0.7482     KRT20in2ex2 RNase P 1 4.30 4 < 0.50 0.05 2 2 28.3842 29.1549 -0.7708 0.03 -1.10 2.15 4.23 4.37 0.13
79 10-037 141 28.3253 29.1186 -0.7933         1                                
80 10-039b 159 27.4716 27.4217 0.0499     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.72 3 < 0.50 0.30 2 2 27.4406 27.5529 -0.1123 0.23 -0.45 1.36 2.43 3.05 0.61
81 10-039b 165 27.4096 27.6841 -0.2745         1                                
82 10-041 183 28.4672 28.8663 -0.3991     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.98 3 0.69 0.05 2 2 28.4116 28.6527 -0.2411 0.22 -0.57 1.49 2.67 3.32 0.65
83 10-041 189 28.3560 28.4391 -0.0831         1                                
84 10-043 207 27.6320 28.6051 -0.9731     KRT20in2ex2 RNase P 1 4.61 5 < 0.50 0.40 2 2 27.4839 28.3553 -0.8714 0.14 -1.20 2.30 4.30 4.95 0.65
85 10-043 213 27.3357 28.1054 -0.7697         1                                
86 10-045 231 28.1068 28.1663 -0.0596     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.46 2 < 0.50 0.47 2 2 28.0765 28.0426 0.0339 0.13 -0.30 1.23 2.31 2.63 0.32
87 10-045 237 28.0463 27.9189 0.1274         1                                
88 10-046 255 25.8689 25.8575 0.0114     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.33 2 < 0.50 0.21 2 2 25.8202 25.7047 0.1156 0.15 -0.22 1.16 2.16 2.50 0.34
89 10-046 261 25.7716 25.5518 0.2198         1                                
90 10-049 279 26.7577 27.2432 -0.4855     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.47 3 0.58 0.11 2 2 26.6686 27.1303 -0.4617 0.03 -0.79 1.74 3.41 3.53 0.11
91 10-049 285 26.5796 27.0174 -0.4378         1                                
92 10-052 303 27.1060 27.5925 -0.4866     KRT20in2ex2 RNase P 1 3.63 4 < 0.50 0.41 2 2 26.7929 27.3198 -0.5270 0.06 -0.86 1.82 3.53 3.73 0.20
93 10-052 309 26.4798 27.0471 -0.5674         1                                
94 10-054 327 29.4875 29.2912 0.1963     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.34 2 < 0.50 0.17 2 2 29.4785 29.3742 0.1043 0.13 -0.23 1.17 2.20 2.50 0.30
95 10-054 333 29.4695 29.4572 0.0124         1                                
96 DNActrl 375 24.0747 23.7243 0.3504     KRT20in2ex2 RNase P 1 2.00 2 0.94 0.05 2 2 24.0944 23.7611 0.3333 0.02 0.00 1.00 1.98 2.02 0.05
97 DNActrl 381 24.1142 23.7980 0.3162         1                                
98 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 1         2                    
99 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC     1