Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120920_1000_3rdset_pl11_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120920_1000_3rdset_pl11_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/20/12 4:23:11 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 4                                                    
26 - 1 Copy: 1                                                    
27 - 2 Copies: 6                                                    
28 - 3 Copies: 14                                                    
29 - 4 Copies: 4                                                    
30 - 5 Copies: 1                                                    
31 - 6 Copies: 1                                                    
32                                                      
33 Total number of wells omitted from analysis: 11                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 9                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.1775                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-601 3 29.8371 30.1622 -0.3252     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.84 3 0.74 0.08 2 2 30.0069 30.2947 -0.2878 0.05 -0.51 1.42 2.77 2.91 0.15
42 10-601 9 30.1768 30.4272 -0.2504         11                                
43 10-607 27 29.3252 29.5074 -0.1822     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.70 3 0.75 0.20 2 2 29.4582 29.6721 -0.2139 0.04 -0.43 1.35 2.64 2.76 0.12
44 10-607 33 29.5912 29.8368 -0.2456         11                                
45 10-611 51 29.5439 29.1797 0.3642     KRT20in2ex2 RNase P 11 1.79 2 0.81 0.09 2 2 29.9117 29.5347 0.3770 0.02 0.16 0.90 1.77 1.81 0.03
46 10-611 57 30.2794 29.8897 0.3897         11                                
47 10-612 75 27.6284 27.8493 -0.2209     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.84 3 0.79 0.08 2 2 27.8164 28.1055 -0.2891 0.10 -0.51 1.42 2.71 2.98 0.27
48 10-612 81 28.0045 28.3618 -0.3573         11                                
49 10-614 99 27.0489 26.4050 0.6439     KRT20in2ex2 RNase P 11 1.55 2 0.92 0.59 2 2 28.1966 27.6083 0.5883 0.08 0.37 0.77 1.49 1.61 0.12
50 10-614 105 29.3443 28.8117 0.5326         11                                
51 10-615 123 28.0180 28.8192 -0.8012     KRT20in2ex2 RNase P 11 3.88 4 < 0.50 0.04 2 2 28.3171 29.0564 -0.7393 0.09 -0.96 1.94 3.72 4.05 0.33
52 10-615 129 28.6162 29.2937 -0.6775         11                                
53 10-616 147 27.9644 28.3229 -0.3584     KRT20in2ex2 RNase P 11 3.00 3 0.81 0.04 2 2 28.6010 28.9693 -0.3683 0.01 -0.59 1.50 2.98 3.02 0.04
54 10-616 153 29.2376 29.6157 -0.3781         11                                
55 10-620 171 29.1284 30.5697 -1.4412     KRT20in2ex2 RNase P 11 5.55 6 < 0.50 0.09 2 2 29.7460 31.0016 -1.2556 0.26 -1.47 2.78 4.88 6.31 1.43
56 10-620 177 30.3637 31.4336 -1.0700         11                                
57 10-621 195 28.3068 28.8288 -0.5220     KRT20in2ex2 RNase P 11 3.74 4 < 0.50 0.07 2 2 28.7166 29.4015 -0.6850 0.23 -0.90 1.87 3.34 4.19 0.85
58 10-621 201 29.1264 29.9743 -0.8479         11                                
59 10-623T 219 31.1112 31.3809 -0.2697     KRT20in2ex2 RNase P 11 3.18 3 0.57 0.12 2 2 31.0370 31.4884 -0.4514 0.26 -0.67 1.59 2.80 3.61 0.80
60 10-623T 225 30.9627 31.5959 -0.6332         11                                
61 10-627 243 33.9172 34.8034 -0.8862 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 11         2                    
62 10-627 249 33.5929 34.7196 -1.1267 x VICET     11                                
63 10-628 267 27.4296 26.8601 0.5695     KRT20in2ex2 RNase P 11 1.42 1 < 0.50 2.26 2 2 27.9758 27.2687 0.7071 0.19 0.49 0.71 1.29 1.57 0.27
64 10-628 273 28.5219 27.6773 0.8447         11                                
65 10-637 IS 291 30.4610 31.0495 -0.5884     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.88 3 0.71 0.05 2 2 31.0206 31.3308 -0.3102 0.39 -0.53 1.44 2.38 3.50 1.12
66 10-637 IS 297 31.5802 31.6121 -0.0319         11                                
67 10-638 315 29.0014 29.2389 -0.2375     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.81 3 0.76 0.05 2 2 29.1676 29.4409 -0.2734 0.05 -0.49 1.41 2.74 2.88 0.14
68 10-638 321 29.3337 29.6429 -0.3092         11                                
69 10-641 15 29.4588 30.5291 -1.0703     KRT20in2ex2 RNase P 11 5.19 5 < 0.50 0.06 2 2 29.7240 30.8822 -1.1583 0.12 -1.38 2.60 4.88 5.52 0.63
70 10-641 21 29.9891 31.2353 -1.2462         11                                
71 10-644 39 30.0814 30.5088 -0.4273     KRT20in2ex2 RNase P 11 3.24 3 0.63 0.22 2 2 30.2900 30.7706 -0.4806 0.08 -0.70 1.62 3.13 3.37 0.24
72 10-644 45 30.4985 31.0325 -0.5340         11                                
73 10-645 63 32.2401 33.0474 -0.8072 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 11         2                    
74 10-645 69 33.6438 34.3743 -0.7305 x VICET     11                                
75 10-646 87 27.3931 26.9741 0.4189     KRT20in2ex2 RNase P 11 1.88 2 0.68 0.04 2 2 27.6594 27.3490 0.3104 0.15 0.09 0.94 1.74 2.02 0.28
76 10-646 93 27.9257 27.7240 0.2018         11                                
77 10-648 111 28.3989 28.4346 -0.0357     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.27 2 < 0.50 0.55 2 2 29.1632 29.1288 0.0344 0.10 -0.18 1.14 2.16 2.38 0.22
78 10-648 117 29.9276 29.8230 0.1046         11                                
79 10-649 135 28.4339 28.4720 -0.0381     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.22 2 < 0.50 0.33 2 2 28.8553 28.7916 0.0637 0.14 -0.15 1.11 2.07 2.39 0.31
80 10-649 141 29.2767 29.1113 0.1655         11                                
81 10-651T 159 30.8071 31.6583 -0.8513     KRT20in2ex2 RNase P 11 4.20 4 < 0.50 0.09 2 1 30.8071 31.6583 -0.8513 0.00 -1.07 2.10 4.20 4.20 0.00
82 10-651T 165 31.8164 33.0877 -1.2714 x VICET     11                                
83 10-654 183 29.7272 29.8966 -0.1695     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.54 3 0.65 0.23 2 2 30.0051 30.1309 -0.1258 0.06 -0.34 1.27 2.46 2.62 0.15
84 10-654 189 30.2831 30.3652 -0.0821         11                                
85 10-655 207 34.2351 34.3115 -0.0764 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 11         2                    
86 10-655 213 34.1138 35.4978 -1.3840 x VICET     11                                
87 10-656 231 32.2132 34.3841 -2.1708 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 11         2                    
88 10-656 237 32.8227 33.0271 -0.2044 x VICET     11                                
89 10-659 255 27.8455 28.6750 -0.8296     KRT20in2ex2 RNase P 11 4.34 4 < 0.50 0.12 2 2 27.8227 28.7214 -0.8986 0.10 -1.12 2.17 4.13 4.55 0.42
90 10-659 261 27.8000 28.7677 -0.9677         11                                
91 10-660 279 27.6123 28.1292 -0.5170     KRT20in2ex2 RNase P 11 3.15 3 0.69 0.09 2 2 28.4835 28.9225 -0.4390 0.11 -0.66 1.58 2.99 3.33 0.34
92 10-660 285 29.3547 29.7158 -0.3611         11                                
93 10-662 303 27.6052 28.1189 -0.5138     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.77 3 0.73 0.09 2 2 27.9211 28.1710 -0.2499 0.37 -0.47 1.38 2.30 3.32 1.02
94 10-662 309 28.2371 28.2231 0.0140         11                                
95 10-667 327 27.0776 27.2311 -0.1535     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.83 3 0.81 0.05 2 2 27.1304 27.4157 -0.2853 0.19 -0.50 1.42 2.59 3.11 0.52
96 10-667 333 27.1832 27.6003 -0.4172         11                                
97 10-675 351 26.1877 26.5022 -0.3145     KRT20in2ex2 RNase P 11 3.49 3 < 0.50 0.42 2 2 26.7326 27.3172 -0.5846 0.38 -0.80 1.74 2.89 4.21 1.31
98 10-675 357 27.2775 28.1323 -0.8548         11                                
99 10-677 375 27.5306 27.6963 -0.1657     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.79 3 0.79 0.08 2 2 28.0337 28.2975 -0.2639 0.14 -0.48 1.40 2.61 2.99 0.38
100 10-677 381 28.5368 28.8988 -0.3620         11                                
101 DNActrl 363 24.8646 24.6655 0.1991     KRT20in2ex2 RNase P 11 2.00 2 < 0.50 0.05 2 2 24.8634 24.6459 0.2175 0.03 0.00 1.00 1.97 2.03 0.05
102 DNActrl 369 24.8621 24.6262 0.2358         11                                
103 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 11         2                    
104 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC     11