Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120921_1000_3rdset_pl12_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120921_1000_3rdset_pl12_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/21/12 11:35:02 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 2 Copies: 11                                                    
26 - 3 Copies: 15                                                    
27 - 4 Copies: 3                                                    
28 - 5 Copies: 1                                                    
29 - 6 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.1551                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-679 3 28.3869 27.9757 0.4112     KRT20in2ex2 RNase P 12 1.73 2 0.79 0.21 2 2 28.2891 27.9602 0.3289 0.12 0.21 0.87 1.64 1.84 0.20
40 10-679 9 28.1913 27.9448 0.2466         12                                
41 10-680 27 28.7203 28.7369 -0.0166     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.17 2 < 0.50 0.39 2 2 28.6392 28.6336 0.0057 0.03 -0.12 1.08 2.14 2.20 0.07
42 10-680 33 28.5582 28.5302 0.0280         12                                
43 10-686 51 29.3538 29.6054 -0.2515     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.87 3 0.56 0.09 2 2 29.3423 29.7401 -0.3979 0.21 -0.52 1.44 2.59 3.18 0.58
44 10-686 57 29.3307 29.8749 -0.5442         12                                
45 10-687 75 26.5372 26.7144 -0.1772     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.62 3 < 0.50 0.18 2 2 26.3723 26.6380 -0.2657 0.13 -0.39 1.31 2.46 2.78 0.32
46 10-687 81 26.2074 26.5616 -0.3542         12                                
47 10-689 99 28.2761 28.8096 -0.5335     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.15 3 0.61 0.18 2 2 28.0226 28.5526 -0.5300 0.00 -0.65 1.57 3.14 3.15 0.02
48 10-689 105 27.7691 28.2956 -0.5266         12                                
49 10-691 123 28.6832 28.8786 -0.1953     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.60 3 < 0.50 0.20 2 2 28.4870 28.7446 -0.2576 0.09 -0.38 1.30 2.49 2.72 0.22
50 10-691 129 28.2908 28.6106 -0.3198         12                                
51 10-694 147 32.3723 32.5189 -0.1466     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.41 2 < 0.50 0.27 2 1 32.3723 32.5189 -0.1466 0.00 -0.27 1.21 2.41 2.41 0.00
52 10-694 153 32.4885 33.6714 -1.1830 x VICET     12                                
53 10-695 171 30.3882 30.9440 -0.5559     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.38 3 0.51 0.30 2 2 29.8536 30.4894 -0.6357 0.11 -0.76 1.69 3.20 3.58 0.37
54 10-695 177 29.3191 30.0347 -0.7156         12                                
55 10-696 195 31.3050 31.8131 -0.5081     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.61 4 < 0.50 0.19 2 2 31.1330 31.8628 -0.7298 0.31 -0.85 1.81 3.10 4.21 1.12
56 10-696 201 30.9609 31.9125 -0.9516         12                                
57 10-698 219 29.6916 30.2255 -0.5338     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.14 3 0.68 0.13 2 2 29.9454 30.4730 -0.5276 0.01 -0.65 1.57 3.13 3.15 0.03
58 10-698 225 30.1991 30.7205 -0.5214         12                                
59 10-700 243 30.4272 31.0944 -0.6673     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.84 4 < 0.50 0.09 2 2 29.7811 30.5997 -0.8185 0.21 -0.94 1.92 3.46 4.27 0.81
60 10-700 249 29.1351 30.1049 -0.9698         12                                
61 10-702 267 29.4830 28.9588 0.5242     KRT20in2ex2 RNase P 12 1.62 2 0.93 0.41 2 2 29.5189 29.0885 0.4304 0.13 0.31 0.81 1.51 1.73 0.21
62 10-702 273 29.5549 29.2182 0.3367         12                                
63 10-706 291 27.9667 27.8243 0.1424     KRT20in2ex2 RNase P 12 1.89 2 0.54 0.11 2 2 27.8947 27.6891 0.2056 0.09 0.08 0.94 1.81 1.97 0.17
64 10-706 297 27.8227 27.5540 0.2687         12                                
65 10-707 315 31.1103 31.5783 -0.4680     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.53 3 < 0.50 0.12 2 2 31.3945 31.6108 -0.2164 0.36 -0.34 1.27 2.13 3.01 0.89
66 10-707 321 31.6787 31.6434 0.0352         12                                
67 10-709 15 28.5072 27.9764 0.5308     KRT20in2ex2 RNase P 12 1.94 2 < 0.50 0.10 2 2 27.4564 27.2862 0.1702 0.51 0.05 0.97 1.51 2.49 0.98
68 10-709 21 26.4056 26.5960 -0.1904         12                                
69 10-710 39 30.4529 30.7989 -0.3459     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.48 3 < 0.50 0.31 2 2 30.2792 30.9542 -0.6750 0.47 -0.80 1.74 2.77 4.37 1.60
70 10-710 45 30.1054 31.1095 -1.0041         12                                
71 10-713 63 30.0791 30.6509 -0.5718     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.07 3 0.65 0.10 2 2 30.3348 30.8294 -0.4945 0.11 -0.62 1.53 2.91 3.24 0.33
72 10-713 69 30.5906 31.0078 -0.4173         12                                
73 10-715 87 25.9575 26.2303 -0.2728     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.51 3 < 0.50 0.51 2 2 26.0658 26.2682 -0.2023 0.10 -0.33 1.25 2.39 2.63 0.24
74 10-715 93 26.1742 26.3061 -0.1319         12                                
75 10-716 111 27.8453 28.3100 -0.4647     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.99 3 0.65 0.06 2 2 27.5677 28.0230 -0.4553 0.01 -0.58 1.49 2.97 3.01 0.04
76 10-716 117 27.2901 27.7360 -0.4459         12                                
77 10-717 135 28.0146 28.1531 -0.1385     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.26 2 < 0.50 0.37 2 2 28.0563 28.1114 -0.0551 0.12 -0.18 1.13 2.14 2.40 0.26
78 10-717 141 28.0980 28.0697 0.0283         12                                
79 10-722T 159 28.8259 28.5852 0.2407     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.08 2 < 0.50 0.15 2 2 28.7022 28.6371 0.0651 0.25 -0.06 1.04 1.84 2.35 0.51
80 10-722T 165 28.5784 28.6889 -0.1105         12                                
81 10-726 183 31.4441 32.9131 -1.4690     KRT20in2ex2 RNase P 12 5.91 6 < 0.50 0.09 2 2 31.2128 32.6521 -1.4394 0.04 -1.56 2.95 5.79 6.03 0.24
82 10-726 189 30.9814 32.3911 -1.4097         12                                
83 10-730 207 28.1771 28.6343 -0.4572     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.84 3 0.62 0.09 2 2 27.9951 28.3797 -0.3846 0.10 -0.51 1.42 2.70 2.99 0.29
84 10-730 213 27.8131 28.1251 -0.3120         12                                
85 10-731 231 27.7973 28.3085 -0.5112     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.07 3 0.66 0.12 2 2 27.8478 28.3434 -0.4956 0.02 -0.62 1.54 3.04 3.10 0.07
86 10-731 237 27.8982 28.3783 -0.4801         12                                
87 10-732 255 27.6295 27.8472 -0.2177     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.80 3 < 0.50 0.11 2 2 27.4745 27.8370 -0.3626 0.20 -0.49 1.40 2.53 3.10 0.56
88 10-732 261 27.3194 27.8269 -0.5075         12                                
89 10-733 279 25.9772 26.6963 -0.7191     KRT20in2ex2 RNase P 12 3.51 4 < 0.50 0.23 2 2 25.9762 26.6658 -0.6895 0.04 -0.81 1.76 3.44 3.59 0.14
90 10-733 285 25.9753 26.6352 -0.6599         12                                
91 10-734 303 33.2263 32.4469 0.7794     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.04 2 < 0.50 0.20 2 2 32.7548 32.6585 0.0963 0.97 -0.03 1.02 1.27 3.27 2.00
92 10-734 309 32.2834 32.8701 -0.5867         12                                
93 10-735 327 29.7172 30.8037 -1.0864     KRT20in2ex2 RNase P 12 5.26 5 < 0.50 0.13 2 2 29.4776 30.7484 -1.2707 0.26 -1.39 2.63 4.63 5.97 1.35
94 10-735 333 29.2380 30.6931 -1.4550         12                                
95 10-738 351 29.5903 29.1055 0.4848     KRT20in2ex2 RNase P 12 1.61 2 0.91 0.41 2 2 29.8681 29.4290 0.4391 0.06 0.32 0.80 1.56 1.66 0.10
96 10-738 357 30.1459 29.7525 0.3934         12                                
97 10-739 375 29.2511 29.8519 -0.6008     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.89 3 0.65 0.08 2 2 29.2650 29.6709 -0.4060 0.28 -0.53 1.44 2.52 3.30 0.78
98 10-739 381 29.2789 29.4899 -0.2111         12                                
99 DNActrl 363 24.5839 24.4600 0.1239     KRT20in2ex2 RNase P 12 2.00 2 < 0.50 0.12 2 2 24.4670 24.3437 0.1233 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00
100 DNActrl 369 24.3501 24.2274 0.1226         12                                
101 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 12         2                    
102 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC     12