Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120921_1000_3rdset_pl13_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120921_1000_3rdset_pl13_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/21/12 1:41:34 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 2                                                    
26 - 2 Copies: 3                                                    
27 - 3 Copies: 17                                                    
28 - 4 Copies: 7                                                    
29 - 5 Copies: 2                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 7                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 5                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.1244                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-747 3 29.5975 29.5766 0.0209     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.94 3 0.64 0.18 2 2 29.6142 29.7988 -0.1846 0.29 -0.55 1.47 2.55 3.38 0.84
40 10-747 9 29.6309 30.0209 -0.3900         13                                
41 10-748 27 27.9652 28.2524 -0.2872     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.01 3 0.74 0.09 2 2 28.4484 28.6707 -0.2223 0.09 -0.59 1.51 2.88 3.15 0.27
42 10-748 33 28.9316 29.0890 -0.1574         13                                
43 10-749 51 29.8578 30.8326 -0.9748     KRT20in2ex2 RNase P 13 4.35 4 < 0.50 0.13 2 2 30.0682 30.8216 -0.7534 0.31 -1.12 2.18 3.73 5.08 1.34
44 10-749 57 30.2785 30.8106 -0.5321         13                                
45 10-750 75 28.8998 29.9123 -1.0125     KRT20in2ex2 RNase P 13 5.03 5 < 0.50 0.10 2 2 29.4159 30.3772 -0.9613 0.07 -1.33 2.51 4.85 5.21 0.36
46 10-750 81 29.9320 30.8420 -0.9101         13                                
47 10-754 99 31.9558 32.3508 -0.3950     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.40 3 < 0.50 0.17 2 1 31.9558 32.3508 -0.3950 0.00 -0.76 1.70 3.40 3.40 0.00
48 10-754 105 33.8908 34.0162 -0.1254 x VICET     13                                
49 10-756 123 28.3941 28.6129 -0.2189     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.98 3 0.66 0.13 2 2 28.5163 28.7219 -0.2057 0.02 -0.57 1.49 2.95 3.01 0.05
50 10-756 129 28.6385 28.8310 -0.1925         13                                
51 10-760 147 29.5537 29.7759 -0.2222     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.63 4 < 0.50 0.24 2 2 30.1932 30.6834 -0.4902 0.38 -0.86 1.81 3.01 4.37 1.36
52 10-760 153 30.8327 31.5910 -0.7583         13                                
53 10-765 171 30.7393 30.7641 -0.0248     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.75 3 0.61 0.29 2 2 31.1343 31.2256 -0.0912 0.09 -0.46 1.38 2.63 2.88 0.25
54 10-765 177 31.5294 31.6870 -0.1576         13                                
55 10-766 195 31.7243 32.1186 -0.3942     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.43 3 < 0.50 0.20 2 2 31.8264 32.2363 -0.4099 0.02 -0.78 1.72 3.39 3.47 0.07
56 10-766 201 31.9285 32.3541 -0.4256         13                                
57 10-768 219 31.1671 31.2031 -0.0360     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.46 2 < 0.50 0.83 2 2 31.6993 31.6301 0.0692 0.15 -0.30 1.23 2.29 2.65 0.36
58 10-768 225 32.2315 32.0571 0.1744         13                                
59 10-769 243 31.9189 31.9747 -0.0558     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.27 3 < 0.50 0.15 2 2 32.0581 32.3994 -0.3413 0.40 -0.71 1.64 2.68 3.99 1.30
60 10-769 249 32.1973 32.8241 -0.6268         13                                
61 10-771 267 33.7591 34.9803 -1.2212 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 13         2                    
62 10-771 273 34.6350 36.8514 -2.2164 x VICET     13                                
63 10-773 291 28.0677 27.9558 0.1119     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.68 3 0.69 0.20 2 2 28.2744 28.3286 -0.0542 0.23 -0.42 1.34 2.39 3.01 0.62
64 10-773 297 28.4812 28.7015 -0.2202         13                                
65 10-775 315 28.4255 28.8715 -0.4460     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.90 4 < 0.50 0.17 2 2 28.5594 29.1525 -0.5930 0.21 -0.96 1.95 3.52 4.31 0.80
66 10-775 321 28.6933 29.4334 -0.7401         13                                
67 10-779 15 28.0221 28.5561 -0.5340     KRT20in2ex2 RNase P 13 4.06 4 < 0.50 0.09 2 2 28.3347 28.9864 -0.6517 0.17 -1.02 2.03 3.74 4.40 0.66
68 10-779 21 28.6472 29.4166 -0.7694         13                                
69 10-781 39 28.0909 28.4678 -0.3769     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.23 3 0.53 0.16 2 2 28.3827 28.7044 -0.3217 0.08 -0.69 1.61 3.11 3.35 0.25
70 10-781 45 28.6745 28.9410 -0.2665         13                                
71 10-784 63 27.8538 27.8298 0.0240     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.65 3 0.61 0.33 2 2 28.2280 28.2657 -0.0377 0.09 -0.41 1.33 2.54 2.77 0.23
72 10-784 69 28.6021 28.7016 -0.0994         13                                
73 10-785 87 30.0004 30.4649 -0.4645     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.74 3 0.54 0.29 2 2 30.4747 30.5588 -0.0841 0.54 -0.45 1.37 2.10 3.56 1.46
74 10-785 93 30.9489 30.6526 0.2962         13                                
75 10-786 111 28.4658 28.8889 -0.4231     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.34 3 < 0.50 0.19 2 2 29.2678 29.6398 -0.3720 0.07 -0.74 1.67 3.23 3.46 0.24
76 10-786 117 30.0698 30.3908 -0.3210         13                                
77 10-789 135 32.4892 33.1052 -0.6160 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 13         2                    
78 10-789 141 32.9639 33.6151 -0.6512 x VICET     13                                
79 10-791 159 28.8612 29.8221 -0.9609     KRT20in2ex2 RNase P 13 5.21 5 < 0.50 0.10 2 2 29.2979 30.3112 -1.0133 0.07 -1.38 2.61 5.03 5.41 0.38
80 10-791 165 29.7346 30.8003 -1.0657         13                                
81 10-792 183 28.1727 28.1552 0.0175     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.24 3 < 0.50 0.14 2 2 28.4176 28.7456 -0.3280 0.49 -0.70 1.62 2.55 4.12 1.57
82 10-792 189 28.6626 29.3361 -0.6735         13                                
83 10-793 207 28.1607 28.7135 -0.5528     KRT20in2ex2 RNase P 13 4.14 4 < 0.50 0.11 2 2 28.3413 29.0219 -0.6807 0.18 -1.05 2.07 3.79 4.52 0.74
84 10-793 213 28.5218 29.3304 -0.8086         13                                
85 10-795a 231 27.5039 27.7827 -0.2787     KRT20in2ex2 RNase P 13 4.40 4 < 0.50 0.18 2 2 27.6232 28.3931 -0.7699 0.69 -1.14 2.20 3.13 6.19 3.06
86 10-795a 237 27.7425 29.0035 -1.2610         13                                
87 10-797 255 29.0965 29.0063 0.0902     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.35 2 < 0.50 0.66 2 2 29.2926 29.1578 0.1348 0.06 -0.23 1.18 2.28 2.43 0.15
88 10-797 261 29.4887 29.3094 0.1793         13                                
89 10-800 279 27.6099 27.9587 -0.3488     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.06 3 0.67 0.08 2 2 28.1466 28.3901 -0.2435 0.15 -0.61 1.53 2.84 3.29 0.45
90 10-800 285 28.6832 28.8214 -0.1382         13                                
91 10-803 303 29.9980 29.9908 0.0072     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.13 3 0.58 0.13 2 2 30.3426 30.6182 -0.2756 0.40 -0.64 1.56 2.57 3.80 1.23
92 10-803 309 30.6872 31.2455 -0.5583         13                                
93 10-805 327 29.5153 30.2383 -0.7230     KRT20in2ex2 RNase P 13 4.26 4 < 0.50 0.09 2 2 29.4101 30.1313 -0.7212 0.00 -1.09 2.13 4.25 4.26 0.01
94 10-805 333 29.3049 30.0243 -0.7194         13                                
95 10-807 351 28.9558 29.2154 -0.2596     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.17 3 0.64 0.11 2 2 29.9112 30.2072 -0.2960 0.05 -0.66 1.59 3.09 3.25 0.16
96 10-807 357 30.8665 31.1989 -0.3324         13                                
97 10-808 375 30.5690 30.9506 -0.3816     KRT20in2ex2 RNase P 13 3.37 3 < 0.50 0.22 2 2 30.6018 30.9867 -0.3848 0.00 -0.75 1.69 3.36 3.38 0.02
98 10-808 381 30.6346 31.0227 -0.3881         13                                
99 DNActrl 363 24.5839 24.0780 0.5060     KRT20in2ex2 RNase P 13 2.00 2 < 0.50 0.11 2 2 24.7980 24.4291 0.3689 0.19 0.00 1.00 1.82 2.20 0.38
100 DNActrl 369 25.0120 24.7803 0.2318         13                                
101 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 13         2                    
102 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC     13