Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120918_1000_3rdset_pl4_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120918_1000_3rdset_pl4_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/18/12 12:51:33 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 2                                                    
26 - 1 Copy: 1                                                    
27 - 2 Copies: 6                                                    
28 - 3 Copies: 15                                                    
29 - 4 Copies: 5                                                    
30 - 5 Copies: 2                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
33 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 3                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.1499                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-175T 3 27.4194 27.4601 -0.0406     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.57 3 < 0.50 0.70 2 2 27.8502 27.9532 -0.1030 0.09 -0.36 1.28 2.46 2.68 0.22
42 10-175T 9 28.2810 28.4463 -0.1653         4                                
43 10-176 27 28.3346 28.3931 -0.0585     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.27 3 < 0.50 0.12 2 2 28.8072 29.2604 -0.4532 0.56 -0.71 1.64 2.49 4.30 1.81
44 10-176 33 29.2798 30.1277 -0.8479         4                                
45 10-181 51 26.0290 26.1639 -0.1349     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.71 3 0.67 0.11 2 2 26.3850 26.5632 -0.1782 0.06 -0.44 1.35 2.63 2.79 0.16
46 10-181 57 26.7410 26.9625 -0.2215         4                                
47 10-183 75 26.6146 27.0639 -0.4493     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.88 4 < 0.50 0.11 2 2 26.8060 27.5036 -0.6976 0.35 -0.96 1.94 3.26 4.61 1.34
48 10-183 81 26.9974 27.9432 -0.9458         4                                
49 10-184 99 27.0534 27.2227 -0.1693     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.54 3 < 0.50 0.40 2 2 28.0348 28.1232 -0.0884 0.11 -0.35 1.27 2.40 2.69 0.29
50 10-184 105 29.0162 29.0237 -0.0074         4                                
51 10-185 123 28.2093 28.4939 -0.2846     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.17 3 0.65 0.06 2 2 28.2148 28.6202 -0.4054 0.17 -0.66 1.58 2.91 3.44 0.53
52 10-185 129 28.2203 28.7464 -0.5262         4                                
53 10-186 147 28.0254 28.6051 -0.5797     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.70 4 < 0.50 0.25 2 2 28.8722 29.5005 -0.6284 0.07 -0.89 1.85 3.57 3.82 0.25
54 10-186 153 29.7189 30.3959 -0.6770         4                                
55 10-188 171 27.6515 28.4435 -0.7919     KRT20in2ex2 RNase P 4 4.41 4 < 0.50 0.21 2 2 28.1635 29.0453 -0.8818 0.13 -1.14 2.20 4.14 4.69 0.55
56 10-188 177 28.6755 29.6472 -0.9717         4                                
57 10-189 195 27.0211 27.5888 -0.5677     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.44 3 < 0.50 0.31 2 2 27.0492 27.5736 -0.5244 0.06 -0.78 1.72 3.34 3.54 0.21
58 10-189 201 27.0773 27.5584 -0.4812         4                                
59 10-190 219 27.7806 28.1982 -0.4176     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.29 3 0.53 0.24 2 2 28.0566 28.5191 -0.4626 0.06 -0.72 1.65 3.19 3.40 0.21
60 10-190 225 28.3325 28.8400 -0.5075         4                                
61 10-197a 243 27.6529 27.4071 0.2458     KRT20in2ex2 RNase P 4 1.95 2 0.54 0.08 2 2 27.8609 27.5655 0.2954 0.07 0.04 0.97 1.88 2.02 0.13
62 10-197a 249 28.0689 27.7239 0.3450         4                                
63 10-198a 267 26.2789 26.7980 -0.5191     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.42 3 < 0.50 0.62 2 2 26.7881 27.3029 -0.5148 0.01 -0.77 1.71 3.41 3.43 0.02
64 10-198a 273 27.2974 27.8078 -0.5104         4                                
65 10-200 291 27.0233 26.6497 0.3736     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.03 2 < 0.50 0.06 2 2 27.2976 27.0634 0.2342 0.20 -0.02 1.02 1.85 2.24 0.39
66 10-200 297 27.5719 27.4771 0.0948         4                                
67 10-201 315 26.5679 27.6055 -1.0376     KRT20in2ex2 RNase P 4 4.83 5 < 0.50 0.06 2 2 26.6010 27.6162 -1.0152 0.03 -1.27 2.42 4.76 4.91 0.15
68 10-201 321 26.6340 27.6269 -0.9929         4                                
69 10-203 339 26.6679 26.7454 -0.0774     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.64 3 0.54 0.20 2 2 27.5872 27.7307 -0.1435 0.09 -0.40 1.32 2.52 2.76 0.24
70 10-203 345 28.5065 28.7160 -0.2095         4                                
71 10-204 363 26.9036 27.4661 -0.5625     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.42 3 < 0.50 0.30 2 2 27.2238 27.7422 -0.5184 0.06 -0.78 1.71 3.32 3.53 0.21
72 10-204 369 27.5439 28.0183 -0.4744         4                                
73 10-206 15 27.4628 27.8843 -0.4216     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.39 3 < 0.50 0.25 2 2 27.3758 27.8781 -0.5023 0.11 -0.76 1.69 3.20 3.58 0.38
74 10-206 21 27.2888 27.8718 -0.5830         4                                
75 10-207 39 27.1617 27.4305 -0.2688     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.02 3 0.73 0.05 2 2 27.5823 27.9176 -0.3353 0.09 -0.59 1.51 2.88 3.16 0.28
76 10-207 45 28.0029 28.4047 -0.4018         4                                
77 10-209 63 26.8454 27.0183 -0.1728     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.14 2 < 0.50 0.09 2 2 27.4041 27.2451 0.1590 0.47 -0.10 1.07 1.70 2.70 0.99
78 10-209 69 27.9627 27.4718 0.4909         4                                
79 10-210 87 25.8120 26.3942 -0.5822     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.55 4 < 0.50 0.27 2 2 26.1001 26.6701 -0.5701 0.02 -0.83 1.77 3.52 3.58 0.06
80 10-210 93 26.3881 26.9460 -0.5579         4                                
81 10-211 111 24.9872 25.7572 -0.7700     KRT20in2ex2 RNase P 4 3.79 4 < 0.50 0.12 2 2 25.7733 26.4382 -0.6649 0.15 -0.92 1.90 3.52 4.08 0.55
82 10-211 117 26.5595 27.1192 -0.5597         4                                
83 10-215 135 28.1805 29.1808 -1.0003     KRT20in2ex2 RNase P 4 4.50 5 < 0.50 0.21 2 2 28.3186 29.2323 -0.9138 0.12 -1.17 2.25 4.24 4.78 0.54
84 10-215 141 28.4567 29.2839 -0.8272         4                                
85 10-216 159 29.6924 29.6441 0.0484     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.79 3 0.62 0.11 2 2 30.4590 30.6793 -0.2203 0.38 -0.48 1.39 2.31 3.36 1.04
86 10-216 165 31.2256 31.7146 -0.4890         4                                
87 10-221a 183 27.2938 27.3406 -0.0468     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.89 3 0.66 0.07 2 2 27.8021 28.0747 -0.2727 0.32 -0.53 1.44 2.47 3.38 0.91
88 10-221a 189 28.3104 28.8089 -0.4985         4                                
89 10-222 207 27.5218 27.5945 -0.0728     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.62 3 0.53 0.34 2 2 27.4739 27.6079 -0.1341 0.09 -0.39 1.31 2.51 2.74 0.22
90 10-222 213 27.4259 27.6213 -0.1953         4                                
91 10-223c 231 25.4721 25.5469 -0.0748     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.37 2 < 0.50 0.50 2 2 25.9994 25.9853 0.0141 0.13 -0.24 1.18 2.23 2.52 0.29
92 10-223c 237 26.5267 26.4238 0.1029         4                                
93 10-226 255 31.6778 30.3955 1.2824     KRT20in2ex2 RNase P 4 1.18 1 < 0.50 0.34 2 2 31.5218 30.5089 1.0129 0.38 0.76 0.59 0.98 1.43 0.45
94 10-226 261 31.3658 30.6223 0.7434         4                                
95 10-228 279 34.0178 34.8375 -0.8197 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 4         2                    
96 10-228 285 39.5373 35.5051 4.0323 x VICET     4                                
97 10-230T 303 30.1819 30.0708 0.1111     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.23 2 < 0.50 0.19 2 2 30.5277 30.4278 0.0999 0.02 -0.16 1.12 2.21 2.25 0.03
98 10-230T 309 30.8735 30.7848 0.0887         4                                
99 10-233 327 undetermined undetermined undetermined x NOVIC KRT20in2ex2 RNase P 4         2                    
100 10-233 333 35.3374 35.8940 -0.5566 x VICET     4                                
101 DNActrl 375 24.7673 24.5441 0.2231     KRT20in2ex2 RNase P 4 2.00 2 < 0.50 0.09 2 2 24.9283 24.6709 0.2575 0.05 0.00 1.00 1.95 2.05 0.10
102 DNActrl 381 25.0894 24.7976 0.2918         4                                
103 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 4         2                    
104 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC     4