Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120918_1000_3rdset_pl5_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120918_1000_3rdset_pl5_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/18/12 2:42:52 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 2                                                    
26 - 2 Copies: 7                                                    
27 - 3 Copies: 15                                                    
28 - 4 Copies: 5                                                    
29 - 5 Copies: 1                                                    
30 > 10 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
33 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 3                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.1245                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-234 3 37.7184 undetermined undetermined x NOVIC KRT20in2ex2 RNase P 5         2                    
42 10-234 9 36.4226 38.8120 -2.3894 x VICET     5                                
43 10-235 27 34.0943 36.2860 -2.1917 x VICET KRT20in2ex2 RNase P 5         2                    
44 10-235 33 34.7394 35.5272 -0.7878 x VICET     5                                
45 10-237b 51 27.6802 27.4123 0.2679     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.21 2 < 0.50 0.29 2 2 28.2037 27.9949 0.2088 0.08 -0.14 1.10 2.12 2.30 0.18
46 10-237b 57 28.7272 28.5774 0.1497         5                                
47 10-238 75 27.2181 27.1119 0.1061     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.50 2 < 0.50 1.41 2 2 27.4652 27.4338 0.0314 0.11 -0.32 1.25 2.37 2.63 0.26
48 10-238 81 27.7122 27.7556 -0.0433         5                                
49 10-239 99 28.6905 28.9993 -0.3088     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.10 3 0.57 0.20 2 2 29.4254 29.7081 -0.2826 0.04 -0.63 1.55 3.05 3.16 0.11
50 10-239 105 30.1604 30.4168 -0.2564         5                                
51 10-240 123 29.3052 28.9506 0.3546     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.23 2 < 0.50 0.26 2 2 29.3767 29.1809 0.1958 0.22 -0.15 1.11 1.99 2.49 0.49
52 10-240 129 29.4481 29.4111 0.0369         5                                
53 10-241 147 28.0924 28.9698 -0.8774     KRT20in2ex2 RNase P 5 5.45 5 < 0.50 0.20 2 2 28.7014 29.7981 -1.0968 0.31 -1.45 2.73 4.68 6.35 1.66
54 10-241 153 29.3104 30.6264 -1.3161         5                                
55 10-245 171 28.2742 28.1553 0.1188     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.66 3 < 0.50 0.15 2 2 28.5783 28.6397 -0.0614 0.25 -0.41 1.33 2.35 3.01 0.67
56 10-245 177 28.8825 29.1241 -0.2416         5                                
57 10-246 195 29.1378 29.4169 -0.2791     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.95 3 0.74 0.08 2 2 29.6406 29.8520 -0.2114 0.10 -0.56 1.48 2.82 3.09 0.28
58 10-246 201 30.1434 30.2870 -0.1436         5                                
59 10-249 219 27.5987 27.5684 0.0302     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.57 3 < 0.50 0.44 2 2 27.8158 27.8283 -0.0125 0.06 -0.36 1.29 2.50 2.65 0.15
60 10-249 225 28.0329 28.0881 -0.0552         5                                
61 10-251 243 26.9321 29.2729 -2.3408     KRT20in2ex2 RNase P 5 14.63 15 0.55 0.09 2 2 27.0754 29.5955 -2.5201 0.25 -2.87 7.31 12.92 16.56 3.65
62 10-251 249 27.2187 29.9182 -2.6995         5                                
63 10-252 267 27.1541 27.1154 0.0387     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.73 3 0.68 0.09 2 2 28.0267 28.1267 -0.1001 0.20 -0.45 1.37 2.48 3.01 0.53
64 10-252 273 28.8993 29.1380 -0.2388         5                                
65 10-254 291 26.5505 27.1153 -0.5648     KRT20in2ex2 RNase P 5 4.08 4 < 0.50 0.14 2 2 26.6794 27.3568 -0.6773 0.16 -1.03 2.04 3.77 4.41 0.64
66 10-254 297 26.8083 27.5982 -0.7898         5                                
67 10-255 315 28.4814 28.4584 0.0231     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.72 3 0.74 0.15 2 2 28.8866 28.9791 -0.0925 0.16 -0.44 1.36 2.51 2.95 0.44
68 10-255 321 29.2917 29.4999 -0.2082         5                                
69 10-256 339 27.8536 28.0782 -0.2246     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.25 3 < 0.50 0.34 2 2 28.4189 28.7693 -0.3505 0.18 -0.70 1.63 2.98 3.55 0.57
70 10-256 345 28.9841 29.4605 -0.4763         5                                
71 10-257 363 27.3167 27.7921 -0.4754     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.64 4 < 0.50 0.17 2 2 27.6668 28.1820 -0.5152 0.06 -0.87 1.82 3.55 3.75 0.20
72 10-257 369 28.0169 28.5719 -0.5550         5                                
73 10-258 15 27.5381 26.8790 0.6591     KRT20in2ex2 RNase P 5 1.97 2 < 0.50 0.12 2 2 27.7083 27.3332 0.3752 0.40 0.02 0.98 1.61 2.39 0.78
74 10-258 21 27.8786 27.7873 0.0912         5                                
75 10-259 39 29.2227 28.9004 0.3222     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.66 3 < 0.50 0.20 2 2 29.0356 29.0946 -0.0590 0.54 -0.41 1.33 2.04 3.46 1.42
76 10-259 45 28.8485 29.2888 -0.4403         5                                
77 10-260 63 27.0564 27.3247 -0.2683     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.55 4 < 0.50 0.22 2 2 27.5620 28.0394 -0.4774 0.30 -0.83 1.78 3.07 4.10 1.03
78 10-260 69 28.0676 28.7542 -0.6866         5                                
79 10-264 87 31.0280 30.4841 0.5439     KRT20in2ex2 RNase P 5 1.93 2 0.66 0.07 2 2 31.1809 30.7824 0.3986 0.21 0.05 0.97 1.75 2.14 0.39
80 10-264 93 31.3339 31.0807 0.2532         5                                
81 10-266 111 29.0521 29.5815 -0.5294     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.12 3 0.50 0.12 2 2 30.2148 30.5071 -0.2923 0.34 -0.64 1.56 2.65 3.68 1.03
82 10-266 117 31.3775 31.4326 -0.0551         5                                
83 10-267 135 29.5738 29.5718 0.0020     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.69 3 0.63 0.15 2 2 29.4512 29.5303 -0.0791 0.11 -0.43 1.35 2.55 2.85 0.30
84 10-267 141 29.3286 29.4888 -0.1602         5                                
85 10-268 159 28.9713 29.5537 -0.5824     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.86 4 < 0.50 0.08 2 2 29.5572 30.1569 -0.5997 0.02 -0.95 1.93 3.82 3.91 0.09
86 10-268 165 30.1431 30.7602 -0.6171         5                                
87 10-270 183 28.7531 29.2334 -0.4803     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.48 3 < 0.50 0.73 2 2 29.0620 29.5098 -0.4478 0.05 -0.80 1.74 3.40 3.56 0.16
88 10-270 189 29.3709 29.7862 -0.4153         5                                
89 10-272T 207 27.2585 27.6787 -0.4202     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.95 3 0.65 0.10 2 2 27.6980 27.9059 -0.2079 0.30 -0.56 1.47 2.54 3.41 0.87
90 10-272T 213 28.1374 28.1330 0.0044         5                                
91 10-273 231 29.0195 29.6603 -0.6408     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.69 4 < 0.50 0.18 2 2 29.6283 30.1624 -0.5341 0.15 -0.88 1.85 3.43 3.98 0.55
92 10-273 237 30.2371 30.6645 -0.4275         5                                
93 10-275 255 29.2774 29.5183 -0.2409     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.10 3 0.66 0.10 2 2 29.5372 29.8182 -0.2809 0.06 -0.63 1.55 3.01 3.19 0.17
94 10-275 261 29.7971 30.1181 -0.3210         5                                
95 10-276 279 27.6662 27.9455 -0.2793     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.76 3 0.58 0.12 2 2 28.7526 28.8652 -0.1126 0.24 -0.46 1.38 2.46 3.09 0.64
96 10-276 285 29.8390 29.7850 0.0540         5                                
97 10-277 303 28.1553 27.9234 0.2319     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.37 2 < 0.50 0.78 2 2 28.5384 28.4308 0.1077 0.18 -0.24 1.18 2.17 2.58 0.41
98 10-277 309 28.9216 28.9381 -0.0166         5                                
99 10-280 327 30.4171 30.8849 -0.4679     KRT20in2ex2 RNase P 5 3.15 3 0.52 0.11 2 2 30.6725 30.9790 -0.3065 0.23 -0.66 1.58 2.82 3.53 0.71
100 10-280 333 30.9279 31.0731 -0.1452         5                                
101 DNActrl 375 24.1230 23.9471 0.1759     KRT20in2ex2 RNase P 5 2.00 2 < 0.50 0.20 2 2 24.5320 24.1815 0.3505 0.25 0.00 1.00 1.77 2.26 0.49
102 DNActrl 381 24.9411 24.4159 0.5251         5                                
103 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 5         2                    
104 NTC 357 undetermined undetermined undetermined x NTC     5