Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120919_1000_3rdset_pl6_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120919_1000_3rdset_pl6_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/19/12 10:47:46 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 2 Copies: 7                                                    
27 - 3 Copies: 13                                                    
28 - 4 Copies: 9                                                    
29 - 5 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
32 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36 Delta Ct variance: 0.1758                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-281T 3 29.3724 30.0971 -0.7248     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.67 4 < 0.50 0.17 2 2 28.9388 29.5230 -0.5842 0.20 -0.87 1.83 3.33 4.04 0.72
41 10-281T 9 28.5052 28.9488 -0.4436         6                                
42 10-282 27 27.0422 27.0241 0.0181     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.37 2 < 0.50 0.52 2 2 27.1890 27.1413 0.0477 0.04 -0.24 1.18 2.32 2.42 0.10
43 10-282 33 27.3358 27.2585 0.0773         6                                
44 10-283 51 28.2304 27.9354 0.2950     KRT20in2ex2 RNase P 6 1.92 2 < 0.50 0.07 2 2 28.0419 27.6926 0.3493 0.08 0.06 0.96 1.85 1.99 0.14
45 10-283 57 27.8534 27.4498 0.4035         6                                
46 10-284 75 26.7626 27.5052 -0.7426     KRT20in2ex2 RNase P 6 4.10 4 0.51 0.04 2 2 26.6365 27.3832 -0.7467 0.01 -1.04 2.05 4.09 4.12 0.02
47 10-284 81 26.5104 27.2613 -0.7509         6                                
48 10-285 99 28.8133 28.8287 -0.0154     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.50 3 < 0.50 0.34 2 2 28.5591 28.5920 -0.0329 0.02 -0.32 1.25 2.47 2.53 0.06
49 10-285 105 28.3048 28.3553 -0.0505         6                                
50 10-286 123 29.5682 30.0883 -0.5201     KRT20in2ex2 RNase P 6 4.17 4 < 0.50 0.05 2 2 29.2040 29.9731 -0.7691 0.35 -1.06 2.08 3.51 4.95 1.45
51 10-286 129 28.8398 29.8578 -1.0180         6                                
52 10-287 147 27.4782 28.0210 -0.5429     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.61 4 < 0.50 0.28 2 2 27.3993 27.9594 -0.5600 0.02 -0.85 1.80 3.56 3.65 0.09
53 10-287 153 27.3205 27.8977 -0.5772         6                                
54 10-288 171 25.4338 25.6310 -0.1972     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.95 3 0.56 0.06 2 2 25.1031 25.3721 -0.2690 0.10 -0.56 1.47 2.80 3.10 0.29
55 10-288 177 24.7724 25.1133 -0.3409         6                                
56 10-290 195 28.1299 28.0090 0.1209     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.66 3 < 0.50 0.10 2 2 27.5582 27.6805 -0.1222 0.34 -0.41 1.33 2.25 3.15 0.90
57 10-290 201 26.9866 27.3519 -0.3654         6                                
58 10-292 219 26.6903 27.3886 -0.6983     KRT20in2ex2 RNase P 6 4.49 4 0.52 0.12 2 2 26.6926 27.5698 -0.8772 0.25 -1.17 2.25 3.97 5.09 1.12
59 10-292 225 26.6950 27.7510 -1.0560         6                                
60 10-293 243 27.9590 28.4430 -0.4840     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.44 3 < 0.50 0.39 2 2 27.7116 28.2027 -0.4911 0.01 -0.78 1.72 3.42 3.45 0.03
61 10-293 249 27.4642 27.9624 -0.4982         6                                
62 10-294 267 27.5054 27.1384 0.3670     KRT20in2ex2 RNase P 6 1.69 2 0.83 0.12 2 2 27.2543 26.7171 0.5372 0.24 0.25 0.84 1.50 1.90 0.40
63 10-294 273 27.0032 26.2958 0.7074         6                                
64 10-296 291 28.6383 28.0830 0.5553     KRT20in2ex2 RNase P 6 1.92 2 < 0.50 0.09 2 2 28.1787 27.8314 0.3473 0.29 0.06 0.96 1.66 2.22 0.56
65 10-296 297 27.7190 27.5798 0.1392         6                                
66 10-297 315 28.3631 28.1766 0.1865     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.35 2 < 0.50 0.59 2 2 28.1046 28.0492 0.0554 0.19 -0.23 1.18 2.15 2.58 0.43
67 10-297 321 27.8461 27.9218 -0.0757         6                                
68 10-298 15 30.3276 31.0383 -0.7106     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.62 4 < 0.50 0.13 2 2 30.0768 30.6416 -0.5649 0.21 -0.86 1.81 3.27 4.00 0.73
69 10-298 21 29.8259 30.2450 -0.4191         6                                
70 10-299 39 26.9354 27.7467 -0.8113     KRT20in2ex2 RNase P 6 4.32 4 0.59 0.10 2 2 27.1290 27.9505 -0.8215 0.01 -1.11 2.16 4.29 4.35 0.06
71 10-299 45 27.3225 28.1543 -0.8318         6                                
72 10-302 63 28.1058 28.3859 -0.2801     KRT20in2ex2 RNase P 6 4.04 4 < 0.50 0.07 2 2 27.7469 28.4707 -0.7239 0.63 -1.01 2.02 2.97 5.49 2.52
73 10-302 69 27.3879 28.5555 -1.1676         6                                
74 10-306T 87 29.3128 29.7868 -0.4741     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.49 3 < 0.50 0.49 2 2 29.0365 29.5486 -0.5121 0.05 -0.80 1.74 3.40 3.58 0.18
75 10-306T 93 28.7602 29.3105 -0.5502         6                                
76 10-307 111 29.0149 29.1595 -0.1446     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.91 3 0.57 0.05 2 2 28.8216 29.0727 -0.2511 0.15 -0.54 1.46 2.70 3.13 0.43
77 10-307 117 28.6283 28.9859 -0.3576         6                                
78 10-308 135 28.2634 28.4280 -0.1646     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.92 3 0.68 0.04 2 2 28.2900 28.5468 -0.2567 0.13 -0.55 1.46 2.74 3.12 0.37
79 10-308 141 28.3167 28.6656 -0.3489         6                                
80 10-309 159 29.3442 29.2640 0.0802     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.56 3 < 0.50 0.23 2 2 29.0373 29.1029 -0.0656 0.21 -0.36 1.28 2.31 2.83 0.52
81 10-309 165 28.7304 28.9417 -0.2114         6                                
82 10-310 183 29.4321 30.0237 -0.5916     KRT20in2ex2 RNase P 6 4.34 4 0.57 0.10 2 2 29.3059 30.1326 -0.8267 0.33 -1.12 2.17 3.69 5.11 1.42
83 10-310 189 29.1797 30.2415 -1.0618         6                                
84 10-311 207 27.8806 28.4609 -0.5803     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.15 3 < 0.50 0.10 2 2 27.8992 28.2630 -0.3638 0.31 -0.65 1.57 2.71 3.66 0.95
85 10-311 213 27.9177 28.0651 -0.1473         6                                
86 10-313 231 26.9560 28.0875 -1.1316     KRT20in2ex2 RNase P 6 5.05 5 < 0.50 0.07 2 2 27.0260 28.0715 -1.0455 0.12 -1.34 2.52 4.76 5.36 0.60
87 10-313 237 27.0961 28.0555 -0.9594         6                                
88 10-314 255 27.5115 27.7524 -0.2410     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.07 3 0.56 0.06 2 2 27.4480 27.7763 -0.3283 0.12 -0.62 1.54 2.89 3.26 0.37
89 10-314 261 27.3846 27.8001 -0.4156         6                                
90 10-316 279 27.2414 26.9689 0.2725     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.38 2 < 0.50 0.76 2 2 26.9204 26.8792 0.0413 0.33 -0.25 1.19 2.02 2.79 0.77
91 10-316 285 26.5995 26.7895 -0.1900         6                                
92 10-321 303 28.1679 28.1642 0.0037     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.52 3 < 0.50 0.27 2 2 28.1210 28.1645 -0.0435 0.07 -0.33 1.26 2.44 2.60 0.17
93 10-321 309 28.0740 28.1648 -0.0908         6                                
94 10-322 327 28.5664 28.7207 -0.1542     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.68 3 0.52 0.18 2 2 28.3016 28.4345 -0.1328 0.03 -0.42 1.34 2.64 2.72 0.08
95 10-322 333 28.0369 28.1483 -0.1114         6                                
96 10-323 351 35.6002 undetermined undetermined x NOVIC KRT20in2ex2 RNase P 6         2                    
97 10-323 357 39.7665 38.0035 1.7630 x VICET     6                                
98 10-324 375 28.7206 29.0000 -0.2794     KRT20in2ex2 RNase P 6 3.47 3 < 0.50 0.26 2 2 28.4258 28.9301 -0.5043 0.32 -0.79 1.73 2.97 4.05 1.09
99 10-324 381 28.1309 28.8601 -0.7292         6                                
100 DNActrl 363 24.7450 24.5429 0.2021     KRT20in2ex2 RNase P 6 2.00 2 < 0.50 0.08 2 2 24.5192 24.2289 0.2903 0.12 0.00 1.00 1.88 2.13 0.24
101 DNActrl 369 24.2934 23.9148 0.3786         6                                
102 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 6         2                    
103 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC     6