Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120919_1000_3rdset_pl8_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120919_1000_3rdset_pl8_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/19/12 2:42:53 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 2 Copies: 5                                                    
27 - 3 Copies: 14                                                    
28 - 4 Copies: 7                                                    
29 - 5 Copies: 3                                                    
30 - 6 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
33 - Undetermined VIC Ct: 2                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36 Delta Ct variance: 0.1323                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-378 3 31.9369 32.5029 -0.5659     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.72 4 < 0.50 0.24 2 2 30.7798 31.2164 -0.4367 0.18 -0.89 1.86 3.40 4.06 0.67
41 10-378 9 29.6226 29.9300 -0.3074         8                                
42 10-382 27 26.8811 26.9382 -0.0571     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.30 3 < 0.50 0.16 2 2 26.8153 27.0818 -0.2665 0.30 -0.72 1.65 2.86 3.82 0.96
43 10-382 33 26.7496 27.2254 -0.4758         8                                
44 10-385 51 26.3865 26.3642 0.0222     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.65 3 0.61 0.21 2 2 26.5529 26.5044 0.0485 0.04 -0.41 1.33 2.61 2.70 0.10
45 10-385 57 26.7194 26.6447 0.0747         8                                
46 10-386T 75 27.0844 27.2131 -0.1288     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.15 3 0.61 0.11 2 2 26.8888 27.0884 -0.1997 0.10 -0.66 1.58 3.00 3.31 0.31
47 10-386T 81 26.6932 26.9637 -0.2706         8                                
48 10-390 99 23.9829 24.6385 -0.6556     KRT20in2ex2 RNase P 8 4.93 5 < 0.50 0.11 2 2 24.0041 24.8488 -0.8448 0.27 -1.30 2.47 4.33 5.62 1.30
49 10-390 105 24.0252 25.0592 -1.0339         8                                
50 10-391 123 27.0868 27.2288 -0.1421     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.53 4 < 0.50 0.26 2 2 26.7849 27.1491 -0.3642 0.31 -0.82 1.77 3.03 4.12 1.09
51 10-391 129 26.4831 27.0693 -0.5863         8                                
52 10-393 147 27.5409 27.6245 -0.0836     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.12 3 0.68 0.07 2 2 27.5397 27.7240 -0.1843 0.14 -0.64 1.56 2.91 3.35 0.44
53 10-393 153 27.5386 27.8235 -0.2849         8                                
54 10-396 171 26.2592 27.4355 -1.1763     KRT20in2ex2 RNase P 8 6.40 6 < 0.50 0.11 2 2 26.4471 27.6687 -1.2216 0.06 -1.68 3.20 6.21 6.61 0.40
55 10-396 177 26.6350 27.9018 -1.2668         8                                
56 10-398 195 undetermined undetermined undetermined x NOVIC KRT20in2ex2 RNase P 8         2                    
57 10-398 201 undetermined undetermined undetermined x NOVIC     8                                
58 10-402b 219 26.8153 26.7356 0.0797     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.77 3 0.77 0.10 2 2 26.9581 26.9701 -0.0120 0.13 -0.47 1.38 2.60 2.95 0.35
59 10-402b 225 27.1009 27.2047 -0.1038         8                                
60 10-404 243 28.9413 28.8583 0.0829     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.69 3 < 0.50 0.32 2 2 28.5735 28.5438 0.0298 0.08 -0.43 1.34 2.59 2.79 0.20
61 10-404 249 28.2058 28.2292 -0.0233         8                                
62 10-406 267 27.8119 27.2455 0.5664     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.01 2 < 0.50 0.11 2 2 27.4106 26.9589 0.4517 0.16 -0.01 1.00 1.85 2.17 0.32
63 10-406 273 27.0094 26.6724 0.3370         8                                
64 10-408 291 31.7782 31.6499 0.1283     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.23 3 < 0.50 0.16 2 2 31.8192 32.0527 -0.2336 0.51 -0.69 1.61 2.51 4.15 1.64
65 10-408 297 31.8602 32.4556 -0.5954         8                                
66 10-409 315 27.2163 27.1030 0.1133     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.57 3 < 0.50 0.25 2 2 27.0415 26.9451 0.0965 0.02 -0.36 1.28 2.54 2.60 0.06
67 10-409 321 26.8667 26.7871 0.0796         8                                
68 10-410 15 32.6960 32.0860 0.6100     KRT20in2ex2 RNase P 8 1.83 2 0.84 0.09 2 2 31.6653 31.0776 0.5878 0.03 0.13 0.91 1.80 1.86 0.06
69 10-410 21 30.6346 30.0691 0.5655         8                                
70 10-412 39 26.7463 26.8092 -0.0629     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.80 3 0.82 0.11 2 2 26.8985 26.9282 -0.0297 0.05 -0.49 1.40 2.74 2.87 0.13
71 10-412 45 27.0507 27.0472 0.0035         8                                
72 10-416 63 29.9298 30.2046 -0.2748     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.51 3 < 0.50 0.19 2 2 30.0116 29.8796 0.1320 0.58 -0.33 1.25 1.89 3.32 1.43
73 10-416 69 30.0933 29.5546 0.5388         8                                
74 10-419 87 28.7617 29.0281 -0.2665     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.19 3 0.54 0.15 2 2 28.3864 28.6030 -0.2166 0.07 -0.67 1.60 3.08 3.30 0.22
75 10-419 93 28.0112 28.1779 -0.1667         8                                
76 10-420 111 27.9371 28.0200 -0.0829     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.05 3 0.63 0.08 2 2 27.9685 28.1224 -0.1540 0.10 -0.61 1.53 2.91 3.21 0.30
77 10-420 117 27.9998 28.2248 -0.2250         8                                
78 10-421 135 27.5263 28.0866 -0.5603     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.75 4 < 0.50 0.10 2 2 27.4716 27.9228 -0.4512 0.15 -0.91 1.88 3.48 4.05 0.57
79 10-421 141 27.4169 27.7589 -0.3421         8                                
80 10-422 159 27.9492 27.8467 0.1025     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.37 2 < 0.50 0.85 2 2 27.6319 27.4178 0.2141 0.16 -0.24 1.18 2.19 2.56 0.37
81 10-422 165 27.3145 26.9888 0.3257         8                                
82 10-423 183 26.8953 27.1318 -0.2365     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.07 3 0.58 0.13 2 2 26.7986 26.9594 -0.1607 0.11 -0.62 1.53 2.91 3.23 0.32
83 10-423 189 26.7020 26.7870 -0.0850         8                                
84 10-438 207 28.8902 29.2707 -0.3805     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.67 4 < 0.50 0.29 2 2 28.6945 29.1145 -0.4200 0.06 -0.88 1.84 3.57 3.78 0.20
85 10-438 213 28.4987 28.9583 -0.4595         8                                
86 10-439 231 27.4972 28.2465 -0.7494     KRT20in2ex2 RNase P 8 4.86 5 < 0.50 0.07 2 2 27.5559 28.3812 -0.8253 0.11 -1.28 2.43 4.62 5.13 0.51
87 10-439 237 27.6146 28.5159 -0.9013         8                                
88 10-440 255 27.7975 27.4224 0.3751     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.20 2 < 0.50 0.14 2 2 27.4285 27.1103 0.3183 0.08 -0.14 1.10 2.12 2.29 0.17
89 10-440 261 27.0596 26.7981 0.2615         8                                
90 10-442 279 27.8143 28.2339 -0.4196     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.66 4 < 0.50 0.18 2 2 27.8370 28.2504 -0.4135 0.01 -0.87 1.83 3.64 3.67 0.03
91 10-442 285 27.8596 28.2670 -0.4073         8                                
92 10-447 303 28.0101 28.3743 -0.3642     KRT20in2ex2 RNase P 8 3.49 3 < 0.50 0.85 2 2 27.6802 28.0257 -0.3455 0.03 -0.80 1.74 3.44 3.53 0.09
93 10-447 309 27.3504 27.6772 -0.3268         8                                
94 10-450 327 31.7715 32.3148 -0.5434     KRT20in2ex2 RNase P 8 5.09 5 < 0.50 0.21 2 2 31.5456 32.4353 -0.8897 0.49 -1.35 2.54 4.00 6.47 2.47
95 10-450 333 31.3197 32.5557 -1.2360         8                                
96 10-462T 351 30.0545 30.8019 -0.7474     KRT20in2ex2 RNase P 8 4.47 4 < 0.50 0.26 2 2 29.7440 30.4464 -0.7025 0.06 -1.16 2.23 4.33 4.61 0.28
97 10-462T 357 29.4334 30.0909 -0.6575         8                                
98 10-463 375 27.8932 28.6709 -0.7777     KRT20in2ex2 RNase P 8 4.04 4 < 0.50 0.07 2 2 27.8272 28.3844 -0.5571 0.31 -1.01 2.02 3.47 4.71 1.24
99 10-463 381 27.7613 28.0978 -0.3365         8                                
100 DNActrl 363 24.6807 24.3293 0.3513     KRT20in2ex2 RNase P 8 2.00 2 < 0.50 0.08 2 2 24.6567 24.1995 0.4571 0.15 0.00 1.00 1.86 2.15 0.29
101 DNActrl 369 24.6326 24.0697 0.5629         8                                
102 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in2ex2 RNase P 8         2                    
103 NTC 345 undetermined undetermined undetermined x NTC     8