Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120920_1000_3rdset_pl9_01_2nd.txt                                                    
5 Target name: KRT20in7ex7                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120920_1000_3rdset_pl9_01_2nd                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/20/12 12:28:04 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 3                                                    
26 - 1 Copy: 4                                                    
27 - 2 Copies: 13                                                    
28 - 3 Copies: 7                                                    
29 - 4 Copies: 4                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 10                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 8                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.2581                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-170 4 32.6778 29.3418 3.3361     KRT20in7ex7 RNase P 9 0.80 1 < 0.50 0.15 2 2 30.0890 27.7516 2.3374 1.41 1.33 0.40 0.40 1.59 1.19
40 10-170 10 27.5002 26.1615 1.3388         9                                
41 10-468T 28 31.1087 28.5818 2.5269     KRT20in7ex7 RNase P 9 1.11 1 < 0.50 0.17 2 2 29.3102 27.4493 1.8610 0.94 0.85 0.55 0.70 1.76 1.06
42 10-468T 34 27.5118 26.3168 1.1951         9                                
43 10-470 52 28.7178 27.4016 1.3162     KRT20in7ex7 RNase P 9 1.73 2 0.51 0.14 2 2 28.0355 26.8182 1.2172 0.14 0.21 0.87 1.62 1.86 0.24
44 10-470 58 27.3531 26.2349 1.1183         9                                
45 10-476 76 35.0985 36.7705 -1.6720 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 9         2                    
46 10-476 82 34.0103 33.3408 0.6695 x VICET     9                                
47 10-480 100 29.6104 29.2668 0.3436     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.19 3 < 0.50 0.08 2 2 29.4257 29.0891 0.3366 0.01 -0.67 1.60 3.18 3.21 0.03
48 10-480 106 29.2410 28.9114 0.3296         9                                
49 10-484 124 32.6352 31.9862 0.6489     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.27 3 < 0.50 0.10 2 2 31.3551 31.0523 0.3028 0.49 -0.71 1.63 2.57 4.15 1.58
50 10-484 130 30.0751 30.1184 -0.0433         9                                
51 10-486 148 28.8402 28.2338 0.6064     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.06 3 < 0.50 0.07 2 2 28.3646 27.9684 0.3962 0.30 -0.62 1.53 2.65 3.54 0.90
52 10-486 154 27.8891 27.7030 0.1860         9                                
53 10-496 172 32.1244 30.8546 1.2698     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.14 2 < 0.50 0.13 2 2 31.4638 30.5519 0.9119 0.51 -0.10 1.07 1.67 2.75 1.07
54 10-496 178 30.8032 30.2492 0.5540         9                                
55 10-497 196 31.5712 30.2210 1.3502     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.16 2 < 0.50 0.12 2 2 30.5108 29.6133 0.8975 0.64 -0.11 1.08 1.58 2.96 1.38
56 10-497 202 29.4504 29.0056 0.4448         9                                
57 10-499 220 31.0833 29.5488 1.5346     KRT20in7ex7 RNase P 9 1.63 2 < 0.50 0.21 2 2 30.5611 29.2512 1.3099 0.32 0.30 0.81 1.39 1.90 0.51
58 10-499 226 30.0388 28.9537 1.0852         9                                
59 10-500 244 30.4594 29.9110 0.5484     KRT20in7ex7 RNase P 9 4.10 4 < 0.50 0.19 2 2 29.1286 29.1524 -0.0238 0.81 -1.04 2.05 2.76 6.09 3.34
60 10-500 250 27.7978 28.3938 -0.5960         9                                
61 10-501 268 29.1609 29.0859 0.0750     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.51 4 < 0.50 0.43 2 2 29.0235 28.8222 0.2013 0.18 -0.81 1.75 3.21 3.83 0.61
62 10-501 274 28.8861 28.5584 0.3277         9                                
63 10-502T 292 28.8208 28.1884 0.6324     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.39 3 < 0.50 0.09 2 2 27.9128 27.6628 0.2500 0.54 -0.76 1.70 2.60 4.42 1.82
64 10-502T 298 27.0049 27.1372 -0.1323         9                                
65 10-505 316 39.4501 36.8155 2.6346 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 9         2                    
66 10-505 322 34.2415 34.8366 -0.5951 x VICET     9                                
67 10-507T 16 30.4127 29.2056 1.2071     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.29 2 < 0.50 0.16 2 2 29.1309 28.3178 0.8131 0.56 -0.20 1.15 1.75 3.02 1.27
68 10-507T 22 27.8492 27.4301 0.4191         9                                
69 10-508 40 35.7473 33.5897 2.1576 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 9 1.47 1 < 0.50 0.29 2 1 32.9558 31.5021 1.4537 0.00 0.44 0.74 1.47 1.47 0.00
70 10-508 46 32.9558 31.5021 1.4537         9                                
71 10-509 64 35.1991 33.2996 1.8995 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 9 2.48 2 < 0.50 0.13 2 1 33.1385 32.4373 0.7012 0.00 -0.31 1.24 2.48 2.48 0.00
72 10-509 70 33.1385 32.4373 0.7012         9                                
73 10-511c 88 33.0432 32.1351 0.9081     KRT20in7ex7 RNase P 9 1.74 2 < 0.50 0.09 2 2 32.8792 31.6638 1.2154 0.43 0.20 0.87 1.40 2.15 0.75
74 10-511c 94 32.7152 31.1926 1.5227         9                                
75 10-512 112 31.2383 30.2964 0.9418     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.24 2 < 0.50 0.12 2 2 30.9201 30.0745 0.8456 0.14 -0.17 1.12 2.10 2.40 0.30
76 10-512 118 30.6019 29.8525 0.7494         9                                
77 10-515 136 31.7524 31.4591 0.2933     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.14 3 < 0.50 0.07 2 2 31.0486 30.6877 0.3608 0.10 -0.65 1.57 3.00 3.29 0.29
78 10-515 142 30.3447 29.9164 0.4283         9                                
79 10-516 160 36.5577 35.0950 1.4627 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 9         2                    
80 10-516 166 35.5836 34.3682 1.2154 x VICET     9                                
81 10-520 184 28.9854 28.7749 0.2105     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.74 4 < 0.50 0.20 2 2 28.6333 28.5261 0.1072 0.15 -0.90 1.87 3.48 4.02 0.54
82 10-520 190 28.2812 28.2773 0.0039         9                                
83 10-521 208 31.9210 30.0650 1.8560     KRT20in7ex7 RNase P 9 1.40 1 < 0.50 0.53 2 2 31.0147 29.4880 1.5268 0.47 0.52 0.70 1.11 1.76 0.64
84 10-521 214 30.1085 28.9110 1.1975         9                                
85 10-522 232 29.8413 29.4558 0.3855     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.47 3 < 0.50 0.12 2 2 29.6051 29.3894 0.2157 0.24 -0.80 1.74 3.09 3.91 0.82
86 10-522 238 29.3689 29.3230 0.0460         9                                
87 10-525 256 31.2321 30.5891 0.6430     KRT20in7ex7 RNase P 9 3.94 4 < 0.50 0.14 2 2 30.0657 30.0309 0.0348 0.86 -0.98 1.97 2.58 6.00 3.42
88 10-525 262 28.8993 29.4727 -0.5734         9                                
89 10-526 280 30.2815 29.2491 1.0324     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.24 2 < 0.50 0.21 2 2 30.1995 29.3517 0.8479 0.26 -0.16 1.12 1.97 2.55 0.57
90 10-526 286 30.1176 29.4542 0.6633         9                                
91 10-527b 304 33.4525 32.1994 1.2531     KRT20in7ex7 RNase P 9 1.88 2 0.51 0.09 2 2 32.2740 31.1756 1.0984 0.22 0.09 0.94 1.69 2.10 0.40
92 10-527b 310 31.0956 30.1519 0.9437         9                                
93 10-530 328 32.7253 31.7881 0.9372     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.56 3 < 0.50 0.29 2 2 31.7929 31.1398 0.6531 0.40 -0.36 1.28 2.11 3.12 1.02
94 10-530 334 30.8606 30.4916 0.3690         9                                
95 10-532 352 27.3823 25.9295 1.4528     KRT20in7ex7 RNase P 9 1.58 2 0.60 0.11 2 2 27.0698 25.7205 1.3493 0.15 0.34 0.79 1.47 1.70 0.23
96 10-532 358 26.7573 25.5115 1.2457         9                                
97 10-875 376 29.2555 27.9381 1.3174     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.10 2 < 0.50 0.10 2 2 28.3027 27.3626 0.9401 0.53 -0.07 1.05 1.62 2.73 1.11
98 10-875 382 27.3499 26.7870 0.5629         9                                
99 DNActrl 364 26.6742 25.2962 1.3780     KRT20in7ex7 RNase P 9 2.00 2 < 0.50 0.09 2 2 25.5291 24.5177 1.0114 0.52 0.00 1.00 1.55 2.58 1.03
100 DNActrl 370 24.3840 23.7392 0.6448         9                                
101 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in7ex7 RNase P 9         2                    
102 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC     9