Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120917_1000_3rdset_pl1_01_2.txt                                                    
5 Target name: KRT20in7ex7                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120917_1000_3rdset_pl1_01_2                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/17/12 2:08:05 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 30                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 1 Copy: 12                                                    
27 - 2 Copies: 13                                                    
28 - 3 Copies: 3                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
31 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34 Delta Ct variance: 0.2566                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-001 4 35.9089 34.8250 1.0839 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 1         2                    
39 10-001 10 35.9934 33.9997 1.9937 x VICET     1                                
40 10-004 28 31.6457 29.7830 1.8628     KRT20in7ex7 RNase P 1 0.83 1 0.95 0.30 2 2 31.1032 29.5473 1.5559 0.43 1.27 0.42 0.67 1.03 0.36
41 10-004 34 30.5607 29.3116 1.2491         1                                
42 10-008 52 24.8574 24.4112 0.4462     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.68 2 0.52 0.17 2 2 25.0397 24.4961 0.5436 0.14 0.26 0.84 1.57 1.79 0.23
43 10-008 58 25.2220 24.5810 0.6409         1                                
44 10-009b 76 28.7519 28.7349 0.0170     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.22 2 0.64 0.10 2 2 28.7548 28.6188 0.1360 0.17 -0.15 1.11 2.05 2.41 0.37
45 10-009b 82 28.7577 28.5027 0.2550         1                                
46 10-010 100 30.4162 29.3369 1.0793     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.37 1 < 0.50 0.57 2 2 30.2151 29.3762 0.8389 0.34 0.55 0.68 1.16 1.61 0.46
47 10-010 106 30.0140 29.4156 0.5985         1                                
48 10-012 124 28.0870 27.5383 0.5486     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.58 2 < 0.50 0.46 2 2 28.2617 27.6328 0.6289 0.11 0.34 0.79 1.49 1.67 0.18
49 10-012 130 28.4365 27.7272 0.7093         1                                
50 10-015 148 27.5753 27.1062 0.4691     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.71 2 < 0.50 0.25 2 2 27.7562 27.2385 0.5177 0.07 0.23 0.85 1.65 1.76 0.12
51 10-015 154 27.9372 27.3708 0.5664         1                                
52 10-016 172 25.8591 26.0760 -0.2168     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.92 3 < 0.50 0.09 2 2 25.9718 26.2289 -0.2571 0.06 -0.55 1.46 2.84 3.00 0.16
53 10-016 178 26.0844 26.3819 -0.2974         1                                
54 10-017 196 29.6633 28.2372 1.4261     KRT20in7ex7 RNase P 1 0.95 1 0.86 0.08 2 2 29.3833 28.0246 1.3586 0.10 1.07 0.48 0.91 1.00 0.09
55 10-017 202 29.1032 27.8120 1.2912         1                                
56 10-020 220 27.6807 27.4128 0.2680     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.53 2 < 0.50 0.29 2 2 28.2279 27.5525 0.6753 0.58 0.39 0.76 1.15 2.03 0.88
57 10-020 226 28.7750 27.6923 1.0827         1                                
58 10-022T 244 30.2531 29.9078 0.3454     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.02 2 0.69 0.07 2 2 30.0981 29.8278 0.2703 0.11 -0.02 1.01 1.92 2.13 0.21
59 10-022T 250 29.9430 29.7478 0.1952         1                                
60 10-024 268 27.9030 27.8639 0.0392     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.28 2 0.51 0.15 2 2 27.6231 27.5268 0.0963 0.08 -0.19 1.14 2.20 2.38 0.18
61 10-024 274 27.3431 27.1897 0.1534         1                                
62 10-026 292 27.7838 27.1700 0.6138     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.44 1 < 0.50 0.92 2 2 28.1569 27.3942 0.7627 0.21 0.47 0.72 1.30 1.60 0.30
63 10-026 298 28.5301 27.6184 0.9116         1                                
64 10-029 316 29.5237 29.0976 0.4261     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.91 2 0.70 0.03 2 2 29.1432 28.7915 0.3517 0.11 0.06 0.96 1.82 2.01 0.20
65 10-029 322 28.7626 28.4854 0.2773         1                                
66 10-030 16 30.5064 29.4255 1.0809     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.10 1 0.55 0.10 2 2 30.3619 29.2073 1.1547 0.10 0.87 0.55 1.04 1.15 0.11
67 10-030 22 30.2175 28.9890 1.2284         1                                
68 10-032 40 27.5290 26.5382 0.9908     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.28 1 < 0.50 0.36 2 2 27.3084 26.3760 0.9324 0.08 0.64 0.64 1.23 1.33 0.10
69 10-032 46 27.0878 26.2139 0.8739         1                                
70 10-033 64 25.9311 26.4768 -0.5457     KRT20in7ex7 RNase P 1 3.24 3 < 0.50 0.06 2 2 26.5745 26.9843 -0.4099 0.19 -0.70 1.62 2.95 3.56 0.61
71 10-033 70 27.2179 27.4919 -0.2740         1                                
72 10-034 88 28.7302 27.5984 1.1319     KRT20in7ex7 RNase P 1 0.86 1 0.95 0.12 2 2 29.0959 27.5891 1.5067 0.53 1.22 0.43 0.66 1.11 0.45
73 10-034 94 29.4615 27.5799 1.8816         1                                
74 10-035 112 29.1213 28.6964 0.4249     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.05 2 0.64 0.07 2 2 28.9325 28.6806 0.2519 0.24 -0.04 1.03 1.82 2.31 0.49
75 10-035 118 28.7437 28.6647 0.0790         1                                
76 10-037 136 28.7524 28.7931 -0.0407     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.85 2 < 0.50 0.10 2 2 29.2072 28.8059 0.4013 0.63 0.11 0.92 1.36 2.51 1.15
77 10-037 142 29.6620 28.8186 0.8433         1                                
78 10-039b 160 28.8516 27.5728 1.2788     KRT20in7ex7 RNase P 1 0.99 1 0.79 0.03 2 2 28.8396 27.5401 1.2995 0.03 1.01 0.50 0.98 1.01 0.03
79 10-039b 166 28.8277 27.5075 1.3202         1                                
80 10-041 184 29.3446 28.7151 0.6295     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.24 1 < 0.50 0.33 2 2 29.3572 28.3850 0.9722 0.48 0.68 0.62 0.98 1.58 0.60
81 10-041 190 29.3697 28.0549 1.3149         1                                
82 10-043 208 28.2521 27.9721 0.2801     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.08 2 0.63 0.07 2 2 28.4067 28.1769 0.2298 0.07 -0.06 1.04 2.01 2.16 0.15
83 10-043 214 28.5613 28.3817 0.1796         1                                
84 10-045 232 28.8498 27.8692 0.9806     KRT20in7ex7 RNase P 1 0.98 1 0.83 0.06 2 2 29.4370 28.1199 1.3171 0.48 1.03 0.49 0.78 1.24 0.46
85 10-045 238 30.0242 28.3706 1.6536         1                                
86 10-046 256 25.7515 25.3024 0.4491     KRT20in7ex7 RNase P 1 1.23 1 < 0.50 0.13 2 2 26.3798 25.3882 0.9916 0.77 0.70 0.61 0.84 1.79 0.95
87 10-046 262 27.0081 25.4739 1.5342         1                                
88 10-049 280 27.4693 27.4575 0.0117     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.83 3 < 0.50 0.08 2 2 26.9964 27.2072 -0.2108 0.31 -0.50 1.41 2.42 3.30 0.88
89 10-049 286 26.5235 26.9569 -0.4334         1                                
90 10-052 304 27.2636 27.2165 0.0470     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.19 2 0.68 0.12 2 2 27.3066 27.1463 0.1603 0.16 -0.13 1.09 2.02 2.36 0.34
91 10-052 310 27.3497 27.0760 0.2736         1                                
92 10-054 328 30.8552 29.2436 1.6116     KRT20in7ex7 RNase P 1 0.65 1 > 0.99 1.15 2 2 31.2547 29.3538 1.9010 0.41 1.61 0.33 0.54 0.80 0.26
93 10-054 334 31.6543 29.4640 2.1903         1                                
94 DNActrl 376 24.0349 23.6948 0.3400     KRT20in7ex7 RNase P 1 2.00 2 0.70 0.05 2 2 23.9823 23.6943 0.2880 0.07 0.00 1.00 1.93 2.07 0.14
95 DNActrl 382 23.9298 23.6938 0.2360         1                                
96 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in7ex7 RNase P 1         2                    
97 NTC 358 undetermined undetermined undetermined x NTC     1