Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120921_1000_3rdset_pl13_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in7ex7                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120921_1000_3rdset_pl13_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/21/12 1:41:34 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 1 Copy: 3                                                    
27 - 2 Copies: 22                                                    
28 - 3 Copies: 4                                                    
29 - 4 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 4                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.2260                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-747 4 36.0038 33.5388 2.4650 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 13 2.26 2 < 0.50 0.16 2 1 29.2274 28.6303 0.5971 0.00 -0.17 1.13 2.26 2.26 0.00
40 10-747 10 29.2274 28.6303 0.5971         13                                
41 10-748 28 29.6565 28.6540 1.0025     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.81 2 0.77 0.10 2 2 29.2534 28.3416 0.9118 0.13 0.14 0.91 1.70 1.93 0.23
42 10-748 34 28.8504 28.0292 0.8212         13                                
43 10-749 52 31.1862 30.9617 0.2244     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.85 3 < 0.50 0.14 2 2 30.7723 30.5147 0.2576 0.05 -0.51 1.43 2.79 2.92 0.13
44 10-749 58 30.3584 30.0677 0.2907         13                                
45 10-750 76 30.6050 30.5811 0.0240     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.87 3 < 0.50 0.08 2 2 30.0185 29.7716 0.2470 0.32 -0.52 1.44 2.46 3.36 0.89
46 10-750 82 29.4320 28.9621 0.4699         13                                
47 10-754 100 33.2639 32.8270 0.4369     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.18 2 0.55 0.11 2 2 33.4757 32.8264 0.6492 0.30 -0.12 1.09 1.88 2.52 0.64
48 10-754 106 33.6874 32.8259 0.8615         13                                
49 10-756 124 29.8448 28.8811 0.9638     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.02 2 0.71 0.09 2 2 29.1371 28.3825 0.7546 0.30 -0.02 1.01 1.75 2.34 0.59
50 10-756 130 28.4294 27.8839 0.5455         13                                
51 10-760 148 31.8621 30.8236 1.0385     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.45 1 < 0.50 0.75 2 2 31.4446 30.2065 1.2380 0.28 0.47 0.72 1.26 1.66 0.40
52 10-760 154 31.0271 29.5895 1.4376         13                                
53 10-765 172 32.0792 31.4471 0.6320     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.27 2 0.54 0.17 2 2 31.6655 31.0794 0.5860 0.07 -0.18 1.14 2.20 2.35 0.14
54 10-765 178 31.2518 30.7117 0.5401         13                                
55 10-766 196 33.7586 32.7400 1.0186     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.17 2 0.59 0.24 2 2 32.6109 31.9613 0.6497 0.52 -0.12 1.09 1.68 2.81 1.12
56 10-766 202 31.4633 31.1826 0.2807         13                                
57 10-768 220 33.8021 31.3501 2.4520     KRT20in7ex7 RNase P 13 0.76 1 0.58 0.20 2 2 33.1996 31.0238 2.1758 0.39 1.41 0.38 0.62 0.91 0.29
58 10-768 226 32.5971 30.6976 1.8995         13                                
59 10-769 244 33.3997 32.3911 1.0086     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.79 2 0.69 0.14 2 2 32.9832 32.0510 0.9323 0.11 0.16 0.89 1.70 1.88 0.19
60 10-769 250 32.5667 31.7108 0.8559         13                                
61 10-771 268 36.6532 36.5267 0.1265 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 13         2                    
62 10-771 274 35.9878 35.3579 0.6299 x VICET     13                                
63 10-773 292 29.9502 28.7846 1.1655     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.70 2 0.78 0.16 2 2 29.2685 28.2639 1.0046 0.23 0.23 0.85 1.52 1.90 0.38
64 10-773 298 28.5869 27.7432 0.8437         13                                
65 10-775 316 30.2305 29.7473 0.4832     KRT20in7ex7 RNase P 13 3.66 4 < 0.50 0.14 2 2 29.1779 29.2789 -0.1010 0.83 -0.87 1.83 2.44 5.49 3.04
66 10-775 322 28.1253 28.8105 -0.6852         13                                
67 10-779 16 31.6943 29.9449 1.7494     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.78 2 0.64 0.20 2 2 30.1688 29.2279 0.9409 1.14 0.17 0.89 1.01 3.11 2.10
68 10-779 22 28.6433 28.5109 0.1324         13                                
69 10-781 40 30.6957 29.2503 1.4454     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.63 2 0.62 0.22 2 2 29.6322 28.5704 1.0618 0.54 0.29 0.82 1.25 2.13 0.88
70 10-781 46 28.5687 27.8905 0.6782         13                                
71 10-784 64 29.2896 28.1652 1.1244     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.02 2 0.63 0.14 2 2 28.8981 28.1439 0.7542 0.52 -0.02 1.01 1.56 2.61 1.05
72 10-784 70 28.5065 28.1225 0.3840         13                                
73 10-785 88 32.0653 30.6899 1.3754     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.91 2 0.67 0.08 2 2 31.2777 30.4406 0.8371 0.76 0.07 0.95 1.31 2.77 1.46
74 10-785 94 30.4900 30.1913 0.2987         13                                
75 10-786 112 29.8719 29.3387 0.5332     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.17 2 0.61 0.15 2 2 30.1847 29.5336 0.6511 0.17 -0.12 1.09 2.00 2.36 0.36
76 10-786 118 30.4975 29.7285 0.7690         13                                
77 10-789 136 35.7358 33.7788 1.9570 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 13 1.32 1 < 0.50 0.33 2 1 33.9770 32.6102 1.3668 0.00 0.60 0.66 1.32 1.32 0.00
78 10-789 142 33.9770 32.6102 1.3668         13                                
79 10-791 160 31.3671 30.1869 1.1802     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.01 2 0.63 0.11 2 2 30.7172 29.9536 0.7636 0.59 -0.01 1.00 1.51 2.68 1.18
80 10-791 166 30.0673 29.7202 0.3471         13                                
81 10-792 184 29.9752 28.9106 1.0646     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.16 2 0.60 0.16 2 2 29.2818 28.6251 0.6567 0.58 -0.11 1.08 1.63 2.87 1.24
82 10-792 190 28.5885 28.3396 0.2489         13                                
83 10-793 208 30.1766 29.8159 0.3607     KRT20in7ex7 RNase P 13 3.07 3 < 0.50 0.09 2 2 29.4197 29.2688 0.1509 0.30 -0.62 1.54 2.66 3.55 0.90
84 10-793 214 28.6628 28.7216 -0.0588         13                                
85 10-795a 232 29.0801 28.3236 0.7565     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.54 3 < 0.50 0.15 2 2 28.7972 28.3694 0.4278 0.46 -0.34 1.27 2.02 3.19 1.17
86 10-795a 238 28.5143 28.4152 0.0991         13                                
87 10-797 256 31.2313 29.3369 1.8944     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.52 2 < 0.50 0.21 2 2 30.2535 29.0860 1.1674 1.03 0.40 0.76 0.92 2.51 1.60
88 10-797 262 29.2756 28.8352 0.4405         13                                
89 10-800 280 29.2292 28.5833 0.6459     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.40 2 0.57 0.34 2 2 28.9231 28.4182 0.5049 0.20 -0.27 1.20 2.18 2.65 0.47
90 10-800 286 28.6170 28.2530 0.3640         13                                
91 10-803 304 32.0549 30.6323 1.4226     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.70 2 0.54 0.28 2 2 31.1485 30.1428 1.0057 0.59 0.24 0.85 1.27 2.27 1.00
92 10-803 310 30.2421 29.6532 0.5889         13                                
93 10-805 328 32.0323 30.8535 1.1788     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.21 2 0.59 0.16 2 2 30.6198 29.9959 0.6240 0.78 -0.15 1.11 1.51 3.25 1.74
94 10-805 334 29.2074 29.1383 0.0692         13                                
95 10-807 352 31.0880 29.8972 1.1908     KRT20in7ex7 RNase P 13 1.59 2 0.50 0.24 2 2 31.1796 30.0790 1.1006 0.13 0.33 0.80 1.49 1.69 0.20
96 10-807 358 31.2713 30.2608 1.0105         13                                
97 10-808 376 32.7254 31.6477 1.0776     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.06 2 0.58 0.11 2 2 31.6603 30.9329 0.7274 0.50 -0.04 1.03 1.62 2.63 1.01
98 10-808 382 30.5952 30.2180 0.3772         13                                
99 DNActrl 364 25.6728 24.7648 0.9080     KRT20in7ex7 RNase P 13 2.00 2 0.73 0.12 2 2 25.0259 24.2555 0.7704 0.19 0.00 1.00 1.82 2.20 0.38
100 DNActrl 370 24.3790 23.7462 0.6327         13                                
101 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in7ex7 RNase P 13         2                    
102 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC     13