Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120917_1000_3rdset_pl2_01_2nd.txt                                                    
5 Target name: KRT20in7ex7                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120917_1000_3rdset_pl2_01_2nd                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/17/12 4:43:49 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 30                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 11                                                    
26 - 2 Copies: 9                                                    
27 - 3 Copies: 6                                                    
28 - 4 Copies: 1                                                    
29 - 5 Copies: 1                                                    
30 - 6 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.2769                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-055 4 29.3874 28.6149 0.7725     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.66 3 < 0.50 0.27 2 2 28.1390 27.7968 0.3421 0.61 -0.41 1.33 1.97 3.58 1.61
40 10-055 10 26.8905 26.9787 -0.0882         2                                
41 10-059 28 33.1953 30.7719 2.4234     KRT20in7ex7 RNase P 2 0.71 1 > 0.99 1.07 2 2 32.0396 29.7997 2.2399 0.26 1.49 0.36 0.63 0.81 0.18
42 10-059 34 30.8838 28.8274 2.0564         2                                
43 10-062b 52 29.1995 27.3610 1.8385     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.16 1 0.50 0.07 2 2 28.5832 27.0438 1.5393 0.42 0.79 0.58 0.94 1.43 0.48
44 10-062b 58 27.9668 26.7267 1.2401         2                                
45 10-063 76 29.8217 27.8333 1.9884     KRT20in7ex7 RNase P 2 0.95 1 0.94 0.09 2 2 28.9821 27.1545 1.8276 0.23 1.07 0.47 0.85 1.06 0.21
46 10-063 82 28.1425 26.4757 1.6668         2                                
47 10-065 100 30.6159 29.3259 1.2900     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.43 1 < 0.50 0.37 2 2 30.1465 28.9110 1.2355 0.08 0.48 0.72 1.38 1.49 0.11
48 10-065 106 29.6770 28.4960 1.1810         2                                
49 10-066 124 28.0528 27.6435 0.4092     KRT20in7ex7 RNase P 2 3.02 3 < 0.50 0.10 2 2 26.8490 26.6910 0.1580 0.36 -0.60 1.51 2.54 3.60 1.06
50 10-066 130 25.6453 25.7386 -0.0932         2                                
51 10-067 148 28.9528 26.9806 1.9722     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.14 1 0.78 0.07 2 2 28.2187 26.6490 1.5696 0.57 0.82 0.57 0.86 1.50 0.64
52 10-067 154 27.4845 26.3175 1.1670         2                                
53 10-069b 172 26.8667 26.2191 0.6476     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.00 2 < 0.50 0.10 2 2 26.1902 25.4387 0.7515 0.15 -0.00 1.00 1.86 2.15 0.29
54 10-069b 178 25.5136 24.6582 0.8554         2                                
55 10-071 196 29.6123 27.8782 1.7340     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.37 1 < 0.50 0.13 2 2 28.4554 27.1561 1.2993 0.61 0.55 0.69 1.01 1.85 0.84
56 10-071 202 27.2986 26.4340 0.8646         2                                
57 10-073 220 29.3443 28.2419 1.1024     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.66 2 < 0.50 0.39 2 2 28.7613 27.7377 1.0236 0.11 0.27 0.83 1.57 1.75 0.18
58 10-073 226 28.1784 27.2335 0.9448         2                                
59 10-078 244 30.6616 30.9475 -0.2859     KRT20in7ex7 RNase P 2 4.70 5 < 0.50 0.12 2 2 29.9429 30.4230 -0.4801 0.27 -1.23 2.35 4.11 5.38 1.27
60 10-078 250 29.2243 29.8985 -0.6742         2                                
61 10-079b 268 28.1143 27.5142 0.6001     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.53 3 < 0.50 0.24 2 2 27.8963 27.4837 0.4126 0.27 -0.34 1.27 2.22 2.88 0.66
62 10-079b 274 27.6783 27.4531 0.2252         2                                
63 10-083 292 26.9141 26.5295 0.3846     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.67 3 < 0.50 0.16 2 2 26.4010 26.0643 0.3367 0.07 -0.42 1.33 2.58 2.76 0.18
64 10-083 298 25.8880 25.5992 0.2888         2                                
65 10-085 316 31.0005 29.3961 1.6045     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.07 1 0.86 0.07 2 2 30.4111 28.7530 1.6581 0.08 0.90 0.53 1.03 1.11 0.08
66 10-085 322 29.8217 28.1099 1.7118         2                                
67 10-086 16 30.2871 30.5698 -0.2827     KRT20in7ex7 RNase P 2 5.97 6 < 0.50 0.12 2 2 28.9829 29.8077 -0.8248 0.77 -1.58 2.99 4.10 8.70 4.59
68 10-086 22 27.6786 29.0455 -1.3669         2                                
69 10-092 40 30.4757 29.5511 0.9245     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.01 2 < 0.50 0.10 2 2 29.8264 29.0771 0.7493 0.25 -0.00 1.00 1.78 2.26 0.49
70 10-092 46 29.1772 28.6032 0.5741         2                                
71 10-094 64 26.9650 26.9295 0.0355     KRT20in7ex7 RNase P 2 3.75 4 < 0.50 0.15 2 2 26.5477 26.7025 -0.1548 0.27 -0.91 1.88 3.29 4.28 0.99
72 10-094 70 26.1304 26.4756 -0.3452         2                                
73 10-095 88 30.0281 28.9559 1.0721     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.08 2 < 0.50 0.07 2 2 28.8127 28.1137 0.6990 0.53 -0.05 1.04 1.60 2.69 1.09
74 10-095 94 27.5973 27.2714 0.3260         2                                
75 10-096 112 28.1121 27.1566 0.9555     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.77 2 < 0.50 0.08 2 2 27.7085 26.7771 0.9314 0.03 0.18 0.88 1.74 1.80 0.06
76 10-096 118 27.3050 26.3977 0.9073         2                                
77 10-097 136 29.5418 28.5941 0.9478     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.50 3 < 0.50 0.24 2 2 28.1905 27.7589 0.4316 0.73 -0.32 1.25 1.75 3.58 1.83
78 10-097 142 26.8392 26.9238 -0.0846         2                                
79 10-098 160 32.6062 31.3245 1.2816     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.28 1 < 0.50 0.17 2 2 32.2844 30.8921 1.3924 0.16 0.64 0.64 1.19 1.39 0.20
80 10-098 166 31.9626 30.4596 1.5031         2                                
81 10-099 184 30.4404 28.7892 1.6512     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.28 1 < 0.50 0.10 2 2 29.6910 28.2934 1.3977 0.36 0.64 0.64 1.07 1.53 0.45
82 10-099 190 28.9416 27.7975 1.1442         2                                
83 10-102 208 30.4312 29.3193 1.1119     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.77 2 < 0.50 0.15 2 2 29.8155 28.8849 0.9306 0.26 0.18 0.88 1.56 2.01 0.45
84 10-102 214 29.1998 28.4505 0.7492         2                                
85 10-103 232 32.7922 30.2758 2.5164     KRT20in7ex7 RNase P 2 0.76 1 0.99 0.64 2 2 32.2264 30.0801 2.1463 0.52 1.39 0.38 0.59 0.98 0.40
86 10-103 238 31.6606 29.8843 1.7763         2                                
87 10-105 256 30.1197 29.0652 1.0544     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.75 2 < 0.50 0.21 2 2 29.4720 28.5296 0.9424 0.16 0.19 0.88 1.62 1.90 0.27
88 10-105 262 28.8242 27.9939 0.8303         2                                
89 10-106 280 30.7905 30.4673 0.3232     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.73 3 < 0.50 0.23 2 2 30.7037 30.4005 0.3032 0.03 -0.45 1.37 2.70 2.77 0.08
90 10-106 286 30.6168 30.3337 0.2831         2                                
91 10-107 304 27.2229 26.2639 0.9590     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.83 2 < 0.50 0.11 2 2 26.7203 25.8387 0.8816 0.11 0.13 0.92 1.73 1.93 0.20
92 10-107 310 26.2177 25.4136 0.8041         2                                
93 10-109 328 28.2410 26.9598 1.2813     KRT20in7ex7 RNase P 2 1.38 1 < 0.50 0.23 2 2 27.6175 26.3297 1.2879 0.01 0.53 0.69 1.37 1.39 0.01
94 10-109 334 26.9941 25.6996 1.2945         2                                
95 DNActrl 364 25.4301 24.5274 0.9027     KRT20in7ex7 RNase P 2 2.00 2 < 0.50 0.07 2 2 25.0045 24.2510 0.7535 0.21 0.00 1.00 1.80 2.22 0.41
96 DNActrl 370 24.5789 23.9746 0.6044         2                                
97 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in7ex7 RNase P 2         2                    
98 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC     2