Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120918_1000_3rdset_pl3_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in7ex7                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120918_1000_3rdset_pl3_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/18/12 10:44:13 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 11                                                    
26 - 2 Copies: 13                                                    
27 - 3 Copies: 4                                                    
28 - 4 Copies: 2                                                    
29 - 7 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.1843                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-110 4 28.8437 28.1611 0.6826     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.53 2 < 0.50 0.39 2 2 29.3908 28.5050 0.8858 0.29 0.38 0.77 1.33 1.77 0.43
40 10-110 10 29.9380 28.8488 1.0891         3                                
41 10-112 28 29.0081 27.7877 1.2203     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.52 2 < 0.50 0.26 2 2 28.6258 27.7228 0.9030 0.45 0.40 0.76 1.22 1.89 0.67
42 10-112 34 28.2435 27.6578 0.5857         3                                
43 10-113 52 27.4086 27.2805 0.1280     KRT20in7ex7 RNase P 3 2.05 2 < 0.50 0.18 2 2 28.1192 27.6508 0.4684 0.48 -0.03 1.02 1.62 2.59 0.98
44 10-113 58 28.8298 28.0210 0.8088         3                                
45 10-114 76 28.7266 27.3830 1.3436     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.15 1 < 0.50 0.11 2 2 28.5310 27.2262 1.3049 0.05 0.80 0.57 1.12 1.18 0.06
46 10-114 82 28.3354 27.0693 1.2661         3                                
47 10-115 100 31.5997 32.8005 -1.2008     KRT20in7ex7 RNase P 3 6.52 7 < 0.50 0.15 2 1 31.5997 32.8005 -1.2008 0.00 -1.70 3.26 6.52 6.52 0.00
48 10-115 106 32.6408 33.5137 -0.8729 x VICET     3                                
49 10-117 124 29.9324 28.3473 1.5851     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.02 1 0.59 0.10 2 2 29.8298 28.3555 1.4743 0.16 0.97 0.51 0.94 1.10 0.16
50 10-117 130 29.7273 28.3637 1.3636         3                                
51 10-119 148 29.1744 27.8672 1.3072     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.23 1 < 0.50 0.20 2 2 29.0989 27.8948 1.2042 0.15 0.70 0.62 1.15 1.32 0.18
52 10-119 154 29.0234 27.9223 1.1011         3                                
53 10-120 172 26.7547 27.4448 -0.6901     KRT20in7ex7 RNase P 3 3.67 4 < 0.50 0.12 2 2 27.2405 27.6132 -0.3727 0.45 -0.88 1.84 2.95 4.57 1.63
54 10-120 178 27.7263 27.7815 -0.0552         3                                
55 10-121 196 28.8855 28.3865 0.4990     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.86 2 < 0.50 0.14 2 2 28.9732 28.3628 0.6104 0.16 0.11 0.93 1.72 2.01 0.29
56 10-121 202 29.0609 28.3391 0.7218         3                                
57 10-130 220 25.9359 25.4439 0.4920     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.95 2 0.54 0.17 2 2 26.3621 25.8257 0.5363 0.06 0.03 0.98 1.90 2.02 0.12
58 10-130 226 26.7882 26.2075 0.5807         3                                
59 10-131 244 28.3405 28.5349 -0.1944     KRT20in7ex7 RNase P 3 3.86 4 < 0.50 0.09 2 2 28.2734 28.7185 -0.4450 0.35 -0.95 1.93 3.24 4.59 1.35
60 10-131 250 28.2063 28.9020 -0.6957         3                                
61 10-132 268 28.1499 27.3849 0.7650     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.54 2 < 0.50 0.18 2 2 28.1742 27.2940 0.8801 0.16 0.38 0.77 1.42 1.67 0.25
62 10-132 274 28.1985 27.2032 0.9953         3                                
63 10-133 292 27.8543 26.8604 0.9939     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.14 1 < 0.50 0.14 2 2 28.3007 26.9815 1.3191 0.46 0.82 0.57 0.91 1.42 0.52
64 10-133 298 28.7471 27.1027 1.6444         3                                
65 10-136 316 28.3630 27.2653 1.0978     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.52 2 < 0.50 0.26 2 2 28.0716 27.1708 0.9008 0.28 0.40 0.76 1.32 1.74 0.42
66 10-136 322 27.7803 27.0763 0.7039         3                                
67 10-137 16 25.3724 25.3308 0.0416     KRT20in7ex7 RNase P 3 2.82 3 < 0.50 0.13 2 2 25.4634 25.4540 0.0093 0.05 -0.49 1.41 2.75 2.88 0.13
68 10-137 22 25.5543 25.5772 -0.0229         3                                
69 10-139b 40 26.9362 26.1186 0.8176     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.72 2 < 0.50 0.09 2 2 26.8925 26.1749 0.7176 0.14 0.21 0.86 1.61 1.85 0.24
70 10-139b 46 26.8488 26.2312 0.6176         3                                
71 10-141b 64 28.4093 26.6061 1.8032     KRT20in7ex7 RNase P 3 0.82 1 0.99 0.15 2 2 28.6437 26.8620 1.7818 0.03 1.28 0.41 0.81 0.84 0.02
72 10-141b 70 28.8782 27.1179 1.7603         3                                
73 10-143 88 30.7569 30.7397 0.0173     KRT20in7ex7 RNase P 3 2.01 2 < 0.50 0.09 2 2 31.1949 30.6956 0.4993 0.68 -0.00 1.00 1.44 2.80 1.37
74 10-143 94 31.6329 30.6515 0.9814         3                                
75 10-146 112 29.6028 27.8066 1.7962     KRT20in7ex7 RNase P 3 0.95 1 0.77 0.13 2 2 29.6495 28.0717 1.5778 0.31 1.07 0.47 0.82 1.10 0.29
76 10-146 118 29.6962 28.3369 1.3594         3                                
77 10-147 136 27.5571 26.5473 1.0099     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.32 1 < 0.50 0.41 2 2 27.7986 26.7002 1.0983 0.13 0.60 0.66 1.25 1.41 0.16
78 10-147 142 28.0400 26.8531 1.1868         3                                
79 10-149 160 30.4766 29.4894 0.9872     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.80 2 < 0.50 0.12 2 2 30.6917 30.0361 0.6555 0.47 0.15 0.90 1.43 2.26 0.83
80 10-149 166 30.9067 30.5829 0.3238         3                                
81 10-150 184 30.4034 29.7293 0.6741     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.69 2 < 0.50 0.09 2 2 30.1397 29.3974 0.7423 0.10 0.24 0.85 1.62 1.78 0.16
82 10-150 190 29.8761 29.0656 0.8106         3                                
83 10-156 208 26.1188 24.9353 1.1835     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.35 1 < 0.50 0.65 2 2 26.3943 25.3254 1.0689 0.16 0.57 0.68 1.25 1.46 0.21
84 10-156 214 26.6698 25.7155 0.9543         3                                
85 10-157 232 29.6619 28.6320 1.0298     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.29 1 < 0.50 0.32 2 2 29.8410 28.7024 1.1386 0.15 0.64 0.64 1.19 1.39 0.19
86 10-157 238 30.0201 28.7728 1.2473         3                                
87 10-159 256 26.4798 26.7034 -0.2236     KRT20in7ex7 RNase P 3 3.03 3 < 0.50 0.12 2 2 26.8822 26.9782 -0.0960 0.18 -0.60 1.51 2.77 3.31 0.54
88 10-159 262 27.2847 27.2531 0.0316         3                                
89 10-161 280 27.4775 27.5203 -0.0428     KRT20in7ex7 RNase P 3 2.85 3 < 0.50 0.11 2 2 27.5290 27.5365 -0.0075 0.05 -0.51 1.42 2.78 2.92 0.14
90 10-161 286 27.5806 27.5527 0.0279         3                                
91 10-162 304 29.2144 28.3180 0.8964     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.86 2 < 0.50 0.11 2 2 28.9436 28.3381 0.6054 0.41 0.10 0.93 1.52 2.28 0.76
92 10-162 310 28.6728 28.3583 0.3145         3                                
93 10-165 328 27.7794 26.6162 1.1632     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.16 1 < 0.50 0.14 2 2 28.0249 26.7343 1.2907 0.18 0.79 0.58 1.06 1.27 0.21
94 10-165 334 28.2705 26.8524 1.4181         3                                
95 10-171 352 27.8546 26.8310 1.0236     KRT20in7ex7 RNase P 3 1.29 1 < 0.50 0.29 2 2 28.0649 26.9304 1.1344 0.16 0.63 0.65 1.20 1.39 0.20
96 10-171 358 28.2751 27.0299 1.2452         3                                
97 10-172 376 27.0254 27.3979 -0.3726     KRT20in7ex7 RNase P 3 3.21 3 < 0.50 0.15 2 2 27.0337 27.2127 -0.1790 0.27 -0.68 1.60 2.81 3.67 0.86
98 10-172 382 27.0420 27.0275 0.0145         3                                
99 DNActrl 364 24.7598 24.3034 0.4564     KRT20in7ex7 RNase P 3 2.00 2 < 0.50 0.09 2 2 24.7230 24.2198 0.5031 0.07 0.00 1.00 1.94 2.07 0.13
100 DNActrl 370 24.6862 24.1363 0.5499         3                                
101 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in7ex7 RNase P 3         2                    
102 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC     3