Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/KRT20in7ex7/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120919_1000_3rdset_pl7_01.txt                                                    
5 Target name: KRT20in7ex7                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120919_1000_3rdset_pl7_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/19/12 12:38:31 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 2                                                    
26 - 1 Copy: 7                                                    
27 - 2 Copies: 17                                                    
28 - 3 Copies: 4                                                    
29 - 4 Copies: 1                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
32 - Undetermined VIC Ct: 2                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36 Delta Ct variance: 0.2165                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-327 4 33.8590 32.0164 1.8426     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.64 2 < 0.50 0.37 2 2 32.3654 31.6796 0.6858 1.64 0.29 0.82 0.74 3.66 2.92
41 10-327 10 30.8718 31.3429 -0.4711         7                                
42 10-329 28 31.0185 29.1515 1.8670     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.19 1 < 0.50 0.30 2 2 30.0341 28.8902 1.1439 1.02 0.74 0.60 0.72 1.97 1.25
43 10-329 34 29.0496 28.6288 0.4208         7                                
44 10-330 52 30.2193 29.1276 1.0917     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.74 2 < 0.50 0.23 2 2 29.3790 28.7753 0.6037 0.69 0.20 0.87 1.24 2.43 1.20
45 10-330 58 28.5386 28.4229 0.1157         7                                
46 10-331 76 30.6363 29.0911 1.5452     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.39 1 < 0.50 0.46 2 2 29.6584 28.7334 0.9250 0.88 0.53 0.69 0.90 2.13 1.23
47 10-331 82 28.6806 28.3757 0.3049         7                                
48 10-333 100 29.8247 28.7111 1.1136     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.66 2 < 0.50 0.28 2 2 29.3708 28.7050 0.6657 0.63 0.27 0.83 1.22 2.27 1.05
49 10-333 106 28.9168 28.6989 0.2179         7                                
50 10-335 124 31.2320 30.2910 0.9410     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.43 2 < 0.50 0.22 2 2 29.5009 29.3815 0.1194 1.16 -0.28 1.21 1.37 4.29 2.92
51 10-335 130 27.7698 28.4720 -0.7022         7                                
52 10-336 148 29.6854 28.9894 0.6960     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.00 2 < 0.50 0.18 2 2 29.0061 28.6043 0.4018 0.42 0.00 1.00 1.63 2.45 0.82
53 10-336 154 28.3268 28.2192 0.1076         7                                
54 10-337 172 29.5677 29.2515 0.3161     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.21 2 < 0.50 0.26 2 2 29.1276 28.8745 0.2531 0.09 -0.15 1.11 2.12 2.31 0.19
55 10-337 178 28.6876 28.4975 0.1901         7                                
56 10-338 196 29.0079 28.5712 0.4366     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.92 3 < 0.50 0.29 2 2 28.0363 28.1835 -0.1471 0.83 -0.55 1.46 1.95 4.38 2.43
57 10-338 202 27.0648 27.7957 -0.7309         7                                
58 10-339 220 31.5017 30.3305 1.1712     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.45 1 < 0.50 0.66 2 2 30.8953 30.0342 0.8611 0.44 0.46 0.73 1.17 1.80 0.63
59 10-339 226 30.2888 29.7378 0.5511         7                                
60 10-340 244 31.2566 30.8808 0.3758     KRT20in7ex7 RNase P 7 3.35 3 < 0.50 0.39 2 2 29.7723 30.1167 -0.3444 1.02 -0.74 1.67 2.03 5.52 3.48
61 10-340 250 28.2879 29.3525 -1.0647         7                                
62 10-341 268 35.1653 33.9303 1.2349 x VICET KRT20in7ex7 RNase P 7         2                    
63 10-341 274 33.8329 34.1247 -0.2917 x VICET     7                                
64 10-342 292 29.1733 28.2308 0.9425     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.67 2 0.53 0.23 2 2 28.5554 27.8990 0.6563 0.40 0.26 0.84 1.37 2.04 0.67
65 10-342 298 27.9375 27.5672 0.3702         7                                
66 10-343 316 34.2338 32.6107 1.6231     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.62 2 < 0.50 0.29 2 2 32.9464 32.2395 0.7069 1.30 0.31 0.81 0.86 3.05 2.19
67 10-343 322 31.6591 31.8683 -0.2093         7                                
68 10-346 16 30.5941 29.5666 1.0275     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.35 2 < 0.50 0.30 2 2 29.4499 29.2855 0.1644 1.22 -0.23 1.18 1.29 4.28 2.99
69 10-346 22 28.3057 29.0044 -0.6988         7                                
70 10-347 40 28.5145 27.7555 0.7590     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.70 2 < 0.50 0.25 2 2 28.0681 27.4368 0.6314 0.18 0.23 0.85 1.56 1.86 0.30
71 10-347 46 27.6218 27.1180 0.5038         7                                
72 10-348 64 29.1424 28.7005 0.4419     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.75 3 < 0.50 0.18 2 2 28.3640 28.4265 -0.0625 0.71 -0.46 1.38 1.94 3.91 1.96
73 10-348 70 27.5857 28.1525 -0.5668         7                                
74 10-349 88 28.4901 28.8694 -0.3793     KRT20in7ex7 RNase P 7 3.87 4 < 0.50 0.22 2 2 27.7034 28.2554 -0.5520 0.24 -0.95 1.93 3.43 4.36 0.93
75 10-349 94 26.9168 27.6415 -0.7247         7                                
76 10-353 112 undetermined undetermined undetermined x NOVIC KRT20in7ex7 RNase P 7         2                    
77 10-353 118 37.8266 undetermined undetermined x NOVIC     7                                
78 10-356 136 31.4757 30.8295 0.6461     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.09 2 < 0.50 0.21 2 2 30.3341 29.9966 0.3375 0.44 -0.06 1.04 1.69 2.58 0.90
79 10-356 142 29.1926 29.1637 0.0290         7                                
80 10-357 160 30.4167 29.6861 0.7307     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.08 2 < 0.50 0.34 2 2 29.8304 29.4881 0.3423 0.55 -0.06 1.04 1.59 2.72 1.13
81 10-357 166 29.2441 29.2902 -0.0460         7                                
82 10-359 184 31.8930 31.3901 0.5029     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.90 2 < 0.50 0.20 2 2 31.3284 30.8584 0.4700 0.05 0.07 0.95 1.86 1.95 0.09
83 10-359 190 30.7639 30.3267 0.4372         7                                
84 10-360 208 27.9698 26.9662 1.0036     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.65 2 < 0.50 0.43 2 2 27.3295 26.6527 0.6768 0.46 0.28 0.82 1.32 2.07 0.75
85 10-360 214 26.6892 26.3392 0.3499         7                                
86 10-361 232 29.1572 27.1731 1.9842     KRT20in7ex7 RNase P 7 0.91 1 < 0.50 0.22 2 2 28.2892 26.7527 1.5366 0.63 1.14 0.45 0.67 1.24 0.57
87 10-361 238 27.4212 26.3322 1.0890         7                                
88 10-363 256 32.0155 31.1790 0.8365     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.29 2 < 0.50 0.24 2 2 31.1205 30.9181 0.2023 0.90 -0.20 1.15 1.48 3.56 2.08
89 10-363 262 30.2254 30.6572 -0.4318         7                                
90 10-364 280 27.9483 26.4672 1.4811     KRT20in7ex7 RNase P 7 0.90 1 < 0.50 0.20 2 2 27.8286 26.2795 1.5491 0.10 1.15 0.45 0.86 0.94 0.09
91 10-364 286 27.7090 26.0918 1.6172         7                                
92 10-369 304 31.1809 31.4248 -0.2439     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.83 3 < 0.50 0.21 2 2 30.7829 30.8857 -0.1029 0.20 -0.50 1.42 2.57 3.12 0.55
93 10-369 310 30.3848 30.3466 0.0381         7                                
94 10-374 328 29.6601 28.5116 1.1486     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.38 1 < 0.50 0.61 2 2 29.0023 28.0652 0.9370 0.30 0.54 0.69 1.19 1.59 0.41
95 10-374 334 28.3444 27.6189 0.7255         7                                
96 10-376 352 30.4488 29.3496 1.0992     KRT20in7ex7 RNase P 7 1.44 1 < 0.50 0.69 2 2 29.9015 29.0274 0.8741 0.32 0.48 0.72 1.23 1.68 0.45
97 10-376 358 29.3542 28.7051 0.6491         7                                
98 10-377 376 31.2046 30.4014 0.8032     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.12 2 < 0.50 0.18 2 2 30.2555 29.9426 0.3129 0.69 -0.09 1.06 1.51 2.98 1.47
99 10-377 382 29.3064 29.4837 -0.1773         7                                
100 DNActrl 364 26.6513 25.9657 0.6856     KRT20in7ex7 RNase P 7 2.00 2 < 0.50 0.23 2 2 25.6517 25.2527 0.3990 0.41 0.00 1.00 1.64 2.44 0.80
101 DNActrl 370 24.6520 24.5396 0.1124         7                                
102 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC KRT20in7ex7 RNase P 7         2                    
103 NTC 346 undetermined undetermined undetermined x NTC     7