Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120905_1000_2ndset_pl10_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120905_1000_2ndset_pl10_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/5/12 11:57:09 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 1                                                    
28 > 10 Copies: 14                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
31 - Negative control sample well: 2                                                    
32                                                      
33                                                      
34 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
35 10-239 3 28.4927 29.8462 -1.3535     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 38.69 39     2 2 28.6801 29.9487 -1.2686 0.12 -4.27 19.34 36.48 41.03 4.55
36 10-239 15 28.8676 30.0513 -1.1837         10                                
37 10-240 27 27.1517 28.5758 -1.4241     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 43.74 44     2 2 27.1127 28.5584 -1.4457 0.03 -4.45 21.87 43.09 44.40 1.31
38 10-240 39 27.0736 28.5410 -1.4674         10                                
39 10-241 51 28.4949 29.7731 -1.2782     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 50.56 51     2 2 28.4619 30.1166 -1.6548 0.53 -4.66 25.28 38.95 65.64 26.69
40 10-241 63 28.4288 30.4601 -2.0313         10                                
41 10-245 75 28.6296 29.2212 -0.5916     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 23.57 24     2 2 28.2860 28.8394 -0.5534 0.05 -3.56 11.78 22.95 24.20 1.25
42 10-245 87 27.9424 28.4575 -0.5152         10                                
43 10-246 99 27.7972 29.8584 -2.0612     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 58.97 59     2 2 27.8865 29.7633 -1.8768 0.26 -4.88 29.49 51.90 67.02 15.12
44 10-246 111 27.9758 29.6683 -1.6924         10                                
45 10-249 123 26.6579 27.6986 -1.0408     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 34.26 34     2 2 26.6449 27.7380 -1.0931 0.07 -4.10 17.13 33.04 35.52 2.48
46 10-249 135 26.6319 27.7773 -1.1454         10                                
47 10-251 147 28.7697 29.9594 -1.1897     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 36.12 36     2 2 28.8284 29.9977 -1.1694 0.03 -4.17 18.06 35.61 36.63 1.02
48 10-251 159 28.8870 30.0360 -1.1490         10                                
49 10-252 171 26.9506 27.6737 -0.7231     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 26.00 26     2 2 26.8591 27.5544 -0.6953 0.04 -3.70 13.00 25.50 26.51 1.00
50 10-252 183 26.7676 27.4350 -0.6675         10                                
51 10-254 195 25.5776 27.0089 -1.4313     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 44.88 45     2 2 25.4588 26.9415 -1.4827 0.07 -4.49 22.44 43.31 46.50 3.20
52 10-254 207 25.3401 26.8742 -1.5341         10                                
53 10-255 219 27.6638 28.5502 -0.8864     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 32.92 33     2 2 27.6616 28.6971 -1.0355 0.21 -4.04 16.46 29.68 36.50 6.82
54 10-255 231 27.6594 28.8440 -1.1846         10                                
55 10-256 243 27.2277 29.1341 -1.9065     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 62.80 63     2 2 27.2017 29.1693 -1.9676 0.09 -4.97 31.40 60.20 65.52 5.32
56 10-256 255 27.1758 29.2045 -2.0287         10                                
57 10-257 267 27.0170 27.8977 -0.8807     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 29.46 29     2 2 26.8894 27.7646 -0.8752 0.01 -3.88 14.73 29.34 29.57 0.22
58 10-257 279 26.7618 27.6316 -0.8698         10                                
59 10-258 291 26.1141 27.6131 -1.4990     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 42.56 43     2 2 25.9874 27.3937 -1.4063 0.13 -4.41 21.28 39.91 45.39 5.47
60 10-258 303 25.8607 27.1743 -1.3136         10                                
61 10-259 315 27.9471 28.9106 -0.9635     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 34.36 34     2 2 27.9386 29.0359 -1.0973 0.19 -4.10 17.18 31.31 37.69 6.38
62 10-259 327 27.9301 29.1612 -1.2311         10                                
63 DNActrl 363 27.7528 24.9080 2.8448     MAP2K4ex1in1 RNase P 10 2.00 2     2 2 27.6701 24.6649 3.0052 0.23 0.00 1.00 1.79 2.24 0.45
64 DNActrl 375 27.5874 24.4218 3.1656         10                                
65 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex1in1 RNase P 10         2                    
66 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC     10