Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120910_1000_2ndset_pl20_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120910_1000_2ndset_pl20                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/10/12 2:15:55 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 2                                                    
28 - 2 Copies: 1                                                    
29 > 10 Copies: 12                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 4                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35                                                      
36 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
37 10-522 3 29.6939 30.6314 -0.9375     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 39.94 40     2 2 29.5810 30.5942 -1.0132 0.11 -4.32 19.97 37.90 42.09 4.19
38 10-522 15 29.4681 30.5570 -1.0889         20                                
39 10-525 27 29.1114 30.7295 -1.6182     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 57.49 57     2 2 29.1160 30.6547 -1.5386 0.11 -4.85 28.74 54.40 60.75 6.34
40 10-525 39 29.1207 30.5798 -1.4591         20                                
41 10-526 51 28.7144 29.9214 -1.2070     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 38.49 38     2 2 28.8329 29.7929 -0.9600 0.35 -4.27 19.25 32.44 45.68 13.24
42 10-526 63 28.9514 29.6644 -0.7130         20                                
43 10-527b 75 29.9234 31.3642 -1.4408     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 69.63 70     2 2 29.7701 31.5852 -1.8151 0.53 -5.12 34.82 53.72 90.26 36.54
44 10-527b 87 29.6168 31.8062 -2.1894         20                                
45 10-530 99 30.8053 31.2284 -0.4231     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 24.78 25     2 2 31.0553 31.3801 -0.3247 0.14 -3.63 12.39 23.15 26.53 3.38
46 10-530 111 31.3053 31.5317 -0.2264         20                                
47 10-532 123 25.9566 26.4887 -0.5321     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 28.76 29     2 2 25.8287 26.3680 -0.5393 0.01 -3.85 14.38 28.61 28.90 0.29
48 10-532 135 25.7007 26.2472 -0.5465         20                                
49 10-533 147 26.7496 27.9671 -1.2175     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 41.16 41     2 2 26.8050 27.8617 -1.0567 0.23 -4.36 20.58 36.82 46.01 9.19
50 10-533 159 26.8603 27.7563 -0.8959         20                                
51 10-534 171 32.7027 33.4617 -0.7590 x VICET MAP2K4ex1in1 RNase P 20         2                    
52 10-534 183 32.9771 33.8068 -0.8298 x VICET     20                                
53 10-536T 195 32.2935 33.4401 -1.1466 x VICET MAP2K4ex1in1 RNase P 20         2                    
54 10-536T 207 32.0365 33.8707 -1.8342 x VICET     20                                
55 10-540 219 27.3921 28.7135 -1.3214     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 40.53 41     2 2 27.6265 28.6607 -1.0342 0.41 -4.34 20.26 33.21 49.45 16.24
56 10-540 231 27.8608 28.6079 -0.7471         20                                
57 10-541 243 29.5459 29.4571 0.0888     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 19.17 19     2 2 29.2713 29.2259 0.0454 0.06 -3.26 9.59 18.61 19.76 1.15
58 10-541 255 28.9967 28.9947 0.0021         20                                
59 10-543 267 30.1278 29.9394 0.1884     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 20.33 20     2 2 30.0940 30.1331 -0.0392 0.32 -3.35 10.17 17.37 23.81 6.44
60 10-543 279 30.0601 30.3269 -0.2667         20                                
61 10-544 291 32.0444 32.8637 -0.8193     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 21.53 22     2 2 32.3359 32.4577 -0.1218 0.99 -3.43 10.77 13.28 34.92 21.64
62 10-544 303 32.6275 32.0518 0.5757         20                                
63 10-550 315 28.5852 30.0005 -1.4152     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 53.36 53     2 2 28.4427 29.8738 -1.4311 0.02 -4.74 26.68 52.77 53.95 1.17
64 10-550 327 28.3002 29.7471 -1.4469         20                                
65 DNActrl 363 28.1244 24.9705 3.1538     MAP2K4ex1in1 RNase P 20 2.00 2     2 2 27.9989 24.6923 3.3065 0.22 0.00 1.00 1.80 2.22 0.42
66 DNActrl 375 27.8734 24.4141 3.4593         20                                
67 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex1in1 RNase P 20         2                    
68 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC     20