Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl26_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl26_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 2:09:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 1                                                    
28 > 10 Copies: 14                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
31 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34                                                      
35 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
36 10-716 3 28.6605 28.8978 -0.2374     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 37.49 37     2 2 28.6156 29.0125 -0.3969 0.23 -4.23 18.75 33.57 41.88 8.31
37 10-716 15 28.5708 29.1271 -0.5564         26                                
38 10-717 27 28.3023 28.1524 0.1498     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 29.17 29     2 2 28.3536 28.3882 -0.0346 0.26 -3.87 14.58 25.67 33.15 7.48
39 10-717 39 28.4049 28.6240 -0.2191         26                                
40 10-722T 51 28.6268 28.9595 -0.3327     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 38.10 38     2 2 28.7178 29.1376 -0.4199 0.12 -4.25 19.05 35.86 40.47 4.61
41 10-722T 63 28.8087 29.3158 -0.5071         26                                
42 10-726 75 30.9579 32.9814 -2.0235     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 79.82 80     2 2 31.1113 32.5982 -1.4869 0.76 -5.32 39.91 55.03 115.78 60.76
43 10-726 87 31.2647 32.2150 -0.9503         26                                
44 10-730 99 28.1770 28.9830 -0.8060     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 43.27 43     2 2 28.2444 28.8481 -0.6037 0.29 -4.44 21.64 37.61 49.79 12.18
45 10-730 111 28.3118 28.7132 -0.4014         26                                
46 10-731 123 28.4630 28.5286 -0.0656     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 28.99 29     2 2 28.6929 28.7184 -0.0255 0.06 -3.86 14.49 28.19 29.80 1.61
47 10-731 135 28.9227 28.9082 0.0145         26                                
48 10-732 147 28.3087 28.7148 -0.4062     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 32.81 33     2 2 28.6060 28.8103 -0.2043 0.29 -4.04 16.41 28.53 37.74 9.21
49 10-732 159 28.9033 28.9058 -0.0025         26                                
50 10-733 171 28.5423 28.0643 0.4780     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 23.23 23     2 2 28.2386 27.9446 0.2940 0.26 -3.54 11.61 20.45 26.39 5.94
51 10-733 183 27.9349 27.8249 0.1100         26                                
52 10-734 195 33.1859 32.0117 1.1742     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 12.62 13     2 1 33.1859 32.0117 1.1742 0.00 -2.66 6.31 12.62 12.62 0.00
53 10-734 207 33.5897 33.0960 0.4937 x VICET     26                                
54 10-735 219 30.6106 31.2001 -0.5895     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 50.87 51     2 2 30.4684 31.3053 -0.8369 0.35 -4.67 25.43 42.85 60.39 17.53
55 10-735 231 30.3262 31.4106 -1.0844         26                                
56 10-738 243 30.4148 29.4200 0.9947     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 15.03 15     2 2 30.5700 29.6484 0.9216 0.10 -2.91 7.52 14.29 15.82 1.53
57 10-738 255 30.7251 29.8767 0.8484         26                                
58 10-739 267 30.4345 30.7209 -0.2863     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 36.94 37     2 2 29.2995 29.6750 -0.3755 0.13 -4.21 18.47 34.73 39.30 4.57
59 10-739 279 28.1644 28.6291 -0.4647         26                                
60 10-747 291 30.5730 30.2255 0.3474     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 27.35 27     2 2 30.1490 30.0906 0.0583 0.41 -3.77 13.67 22.38 33.42 11.03
61 10-747 303 29.7250 29.9557 -0.2308         26                                
62 10-748 315 28.3370 29.0469 -0.7099     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 42.97 43     2 2 28.3963 28.9898 -0.5935 0.16 -4.43 21.48 39.64 46.58 6.94
63 10-748 327 28.4557 28.9328 -0.4771         26                                
64 DNActrl 363 27.8910 24.0252 3.8657     MAP2K4ex1in1 RNase P 26 2.00 2     2 2 27.8269 23.9952 3.8317 0.05 0.00 1.00 1.95 2.05 0.09
65 DNActrl 375 27.7629 23.9652 3.7978         26                                
66 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex1in1 RNase P 26         2                    
67 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC     26