Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120913_1000_2ndset_pl30_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120913_1000_2ndset_pl30_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/13/12 3:22:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 1                                                    
28 > 10 Copies: 14                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
31 - Negative control sample well: 2                                                    
32                                                      
33                                                      
34 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
35 10-835 3 29.9761 31.2951 -1.3190     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 78.93 79     2 2 29.4797 30.9740 -1.4943 0.25 -5.30 39.47 69.90 89.13 19.23
36 10-835 15 28.9833 30.6529 -1.6696         30                                
37 10-838 27 27.4279 27.7378 -0.3100     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 37.35 37     2 2 27.3685 27.7832 -0.4147 0.15 -4.22 18.67 34.73 40.16 5.43
38 10-838 39 27.3091 27.8286 -0.5195         30                                
39 10-839a 51 27.0881 27.1795 -0.0914     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 28.91 29     2 2 27.4098 27.4548 -0.0450 0.07 -3.85 14.45 27.99 29.85 1.86
40 10-839a 63 27.7315 27.7302 0.0013         30                                
41 10-840 75 26.7110 26.9909 -0.2798     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 32.93 33     2 2 26.7019 26.9351 -0.2332 0.07 -4.04 16.47 31.89 34.02 2.13
42 10-840 87 26.6928 26.8794 -0.1866         30                                
43 10-841a 99 29.5829 29.8819 -0.2990     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 34.36 34     2 2 29.8194 30.1139 -0.2945 0.01 -4.10 17.18 34.25 34.47 0.22
44 10-841a 111 30.0559 30.3458 -0.2899         30                                
45 10-851 123 27.5179 28.0696 -0.5517     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 35.47 35     2 2 27.6103 27.9506 -0.3402 0.30 -4.15 17.73 30.63 41.07 10.43
46 10-851 135 27.7028 27.8316 -0.1288         30                                
47 10-852 147 29.0681 29.2477 -0.1796     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 35.25 35     2 2 29.1542 29.4853 -0.3311 0.21 -4.14 17.62 31.73 39.15 7.42
48 10-852 159 29.2403 29.7229 -0.4826         30                                
49 10-853 171 27.2592 27.5492 -0.2900     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 37.62 38     2 2 27.0311 27.4564 -0.4253 0.19 -4.23 18.81 34.26 41.32 7.07
50 10-853 183 26.8030 27.3636 -0.5606         30                                
51 10-855 195 27.8858 28.0423 -0.1566     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 30.80 31     2 2 27.8174 27.9540 -0.1366 0.03 -3.94 15.40 30.38 31.23 0.85
52 10-855 207 27.7491 27.8657 -0.1166         30                                
53 10-856 219 29.8138 29.9438 -0.1300     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 30.92 31     2 2 29.9509 30.0931 -0.1422 0.02 -3.95 15.46 30.66 31.18 0.52
54 10-856 231 30.0879 30.2424 -0.1544         30                                
55 10-857 243 28.1948 28.7069 -0.5121     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 39.97 40     2 2 28.4950 29.0076 -0.5126 0.00 -4.32 19.99 39.96 39.99 0.03
56 10-857 255 28.7952 29.3083 -0.5132         30                                
57 10-861 267 26.7254 26.9455 -0.2201     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 35.50 36     2 2 26.5305 26.8720 -0.3416 0.17 -4.15 17.75 32.64 38.62 5.98
58 10-861 279 26.3355 26.7985 -0.4630         30                                
59 10-865 291 29.4261 28.9867 0.4394     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 22.23 22     2 2 29.4524 29.1188 0.3336 0.15 -3.47 11.12 20.66 23.93 3.26
60 10-865 303 29.4787 29.2509 0.2278         30                                
61 10-867 315 26.3197 26.4450 -0.1254     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 29.66 30     2 2 26.3631 26.4453 -0.0821 0.06 -3.89 14.83 28.78 30.56 1.78
62 10-867 327 26.4066 26.4455 -0.0389         30                                
63 DNActrl 363 27.9216 24.1127 3.8089     MAP2K4ex1in1 RNase P 30 2.00 2     2 2 27.7839 23.9756 3.8083 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00
64 DNActrl 375 27.6461 23.8386 3.8076         30                                
65 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex1in1 RNase P 30         2                    
66 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC     30