Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120903_1000_2ndset_pl6_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120903_1000_2ndset_pl6_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/3/12 5:06:32 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 1                                                    
28 > 10 Copies: 14                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
31 - Negative control sample well: 2                                                    
32                                                      
33                                                      
34 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
35 10-121 3 29.5600 29.6964 -0.1364     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 20.96 21     2 2 29.5883 29.3855 0.2028 0.48 -3.39 10.48 16.57 26.52 9.95
36 10-121 15 29.6167 29.0746 0.5421         6                                
37 10-130 27 25.2675 25.7177 -0.4502     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 36.86 37     2 2 25.3423 25.9540 -0.6117 0.23 -4.20 18.43 32.96 41.23 8.27
38 10-130 39 25.4171 26.1902 -0.7731         6                                
39 10-131 51 28.1041 28.6547 -0.5506     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 36.37 36     2 2 28.3114 28.9037 -0.5922 0.06 -4.18 18.18 35.33 37.44 2.10
40 10-131 63 28.5187 29.1527 -0.6339         6                                
41 10-132 75 27.1703 27.5451 -0.3748     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 27.50 28     2 2 27.2009 27.3901 -0.1892 0.26 -3.78 13.75 24.18 31.28 7.10
42 10-132 87 27.2314 27.2350 -0.0036         6                                
43 10-133 99 27.4585 27.2250 0.2335     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 20.11 20     2 2 27.6047 27.3421 0.2626 0.04 -3.33 10.06 19.71 20.52 0.81
44 10-133 111 27.7510 27.4593 0.2917         6                                
45 10-136 123 27.2301 27.9814 -0.7513     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 40.96 41     2 2 27.0026 27.7662 -0.7636 0.02 -4.36 20.48 40.61 41.31 0.70
46 10-136 135 26.7751 27.5510 -0.7759         6                                
47 10-137 147 25.6263 26.1263 -0.5000     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 32.43 32     2 2 25.7711 26.1979 -0.4268 0.10 -4.02 16.21 30.83 34.12 3.29
48 10-137 159 25.9159 26.2696 -0.3537         6                                
49 10-139b 171 27.6440 27.2022 0.4418     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 17.21 17     2 2 27.4312 26.9443 0.4869 0.06 -3.11 8.61 16.68 17.76 1.08
50 10-139b 183 27.2183 26.6863 0.5320         6                                
51 10-141b 195 27.1472 26.9784 0.1689     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 23.08 23     2 2 27.3029 27.2387 0.0641 0.15 -3.53 11.54 21.46 24.81 3.35
52 10-141b 207 27.4585 27.4991 -0.0406         6                                
53 10-143 219 31.5871 31.0294 0.5577     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 16.13 16     2 2 31.8274 31.2466 0.5808 0.03 -3.01 8.07 15.87 16.39 0.52
54 10-143 231 32.0676 31.4638 0.6038         6                                
55 10-146 243 28.4982 28.8366 -0.3384     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 29.88 30     2 2 28.7328 29.0415 -0.3087 0.04 -3.90 14.94 29.27 30.50 1.23
56 10-146 255 28.9675 29.2465 -0.2790         6                                
57 10-147 267 26.5779 27.1414 -0.5636     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 32.32 32     2 2 26.5917 27.0136 -0.4219 0.20 -4.01 16.16 29.30 35.65 6.36
58 10-147 279 26.6056 26.8858 -0.2802         6                                
59 10-149 291 30.7702 31.0134 -0.2432     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 26.85 27     2 2 30.8080 30.9624 -0.1544 0.13 -3.75 13.43 25.25 28.55 3.31
60 10-149 303 30.8458 30.9115 -0.0657         6                                
61 10-150 315 30.7001 29.9033 0.7969     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 11.83 12     2 2 30.6094 29.5811 1.0283 0.33 -2.56 5.91 10.08 13.89 3.81
62 10-150 327 30.5187 29.2590 1.2597         6                                
63 DNActrl 363 28.4874 24.9387 3.5487     MAP2K4ex1in1 RNase P 6 2.00 2     2 2 28.3043 24.7119 3.5924 0.06 0.00 1.00 1.94 2.06 0.12
64 DNActrl 375 28.1212 24.4851 3.6362         6                                
65 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex1in1 RNase P 6         2                    
66 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC     6