Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin1/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120904_1000_2ndset_pl9_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex1in1                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120904_1000_2ndset_pl9_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/4/12 4:00:46 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 3                                                    
28 - 2 Copies: 1                                                    
29 - 10 Copies: 2                                                    
30 > 10 Copies: 9                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 9                                                    
33 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 6                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-211 3 26.1447 25.7323 0.4125     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 19.56 20     2 2 26.5276 26.0267 0.5009 0.13 -3.29 9.78 18.39 20.80 2.40
40 10-211 15 26.9105 26.3211 0.5894         9                                
41 10-215 27 30.2509 28.6851 1.5658     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 9.59 10     2 2 30.2468 28.7176 1.5291 0.05 -2.26 4.79 9.35 9.84 0.49
42 10-215 39 30.2426 28.7502 1.4925         9                                
43 10-216 51 31.4784 29.9291 1.5493     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 10.14 10     2 2 31.3294 29.8808 1.4486 0.14 -2.34 5.07 9.46 10.87 1.42
44 10-216 63 31.1803 29.8325 1.3479         9                                
45 10-221a 75 28.9933 28.1007 0.8926     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 14.32 14     2 2 28.8693 27.9184 0.9509 0.08 -2.84 7.16 13.75 14.91 1.16
46 10-221a 87 28.7454 27.7362 1.0092         9                                
47 10-222 99 26.4059 26.9843 -0.5784     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 36.39 36     2 2 26.7071 27.1020 -0.3949 0.26 -4.19 18.20 32.04 41.33 9.28
48 10-222 111 27.0083 27.2196 -0.2113         9                                
49 10-223c 123 25.3395 25.9937 -0.6542     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 37.48 37     2 2 25.2528 25.6900 -0.4372 0.31 -4.23 18.74 32.24 43.56 11.31
50 10-223c 135 25.1660 25.3863 -0.2203         9                                
51 10-226 147 29.4262 29.8051 -0.3789     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 44.13 44     2 2 29.4032 30.0763 -0.6731 0.42 -4.46 22.07 35.99 54.11 18.12
52 10-226 159 29.3803 30.3475 -0.9672         9                                
53 10-228 171 32.7664 32.6012 0.1651     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 24.68 25     2 1 32.7664 32.6012 0.1651 0.00 -3.63 12.34 24.68 24.68 0.00
54 10-228 183 32.5082 33.3467 -0.8385 x VICET     9                                
55 10-230T 195 29.3683 30.5759 -1.2076     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 69.68 70     2 2 29.0746 30.4066 -1.3319 0.18 -5.12 34.84 63.92 75.95 12.02
56 10-230T 207 28.7810 30.2372 -1.4563         9                                
57 10-233 219 undetermined 35.8528 undetermined x VICET MAP2K4ex1in1 RNase P 9         2                    
58 10-233 231 38.3807 undetermined undetermined x NOVIC     9                                
59 10-234 243 34.0010 35.2308 -1.2298 x VICET MAP2K4ex1in1 RNase P 9         2                    
60 10-234 255 34.6143 35.1699 -0.5557 x VICET     9                                
61 10-235 267 32.6659 35.4582 -2.7923 x VICET MAP2K4ex1in1 RNase P 9         2                    
62 10-235 279 33.0923 37.8015 -4.7092 x VICET     9                                
63 10-237b 291 27.8213 28.2635 -0.4421     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 29.94 30     2 2 27.8128 27.9264 -0.1136 0.46 -3.90 14.97 23.85 37.60 13.76
64 10-237b 303 27.8043 27.5893 0.2150         9                                
65 10-238 315 26.8711 27.3081 -0.4370     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 37.13 37     2 2 26.7635 27.1874 -0.4239 0.02 -4.21 18.57 36.80 37.47 0.67
66 10-238 327 26.6558 27.0667 -0.4109         9                                
67 DNActrl 363 28.3280 24.6323 3.6957     MAP2K4ex1in1 RNase P 9 2.00 2     2 2 28.2200 24.4293 3.7906 0.13 0.00 1.00 1.87 2.14 0.26
68 DNActrl 375 28.1119 24.2264 3.8855         9                                
69 NTC 339 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex1in1 RNase P 9         2                    
70 NTC 351 undetermined undetermined undetermined x NTC