Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/MAP2K4exin4/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120913_1000_2ndset_pl30_01.txt                                                    
5 Target name: MAP2K4ex4in4                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120913_1000_2ndset_pl30_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/13/12 3:22:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 10                                                    
26 - 2 Copies: 5                                                    
27                                                      
28 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
29 - Negative control sample well: 2                                                    
30                                                      
31 Delta Ct variance: 0.4249                                                    
32                                                      
33                                                      
34 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
35 10-835 4 34.0735 30.9738 3.0997     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 0.50 1 0.99 1.79 2 2 32.4482 30.1407 2.3074 1.12 1.99 0.25 0.29 0.87 0.58
36 10-835 16 30.8228 29.3076 1.5152         30                                
37 10-838 28 29.0710 27.9044 1.1666     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.44 1 0.55 0.07 2 2 28.2396 27.4465 0.7930 0.53 0.47 0.72 1.11 1.87 0.75
38 10-838 40 27.4082 26.9887 0.4195         30                                
39 10-839a 52 27.9354 26.8198 1.1156     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.18 1 0.75 0.03 2 2 27.9860 26.9115 1.0745 0.06 0.76 0.59 1.15 1.22 0.07
40 10-839a 64 28.0367 27.0033 1.0334         30                                
41 10-840 76 27.8555 26.9314 0.9240     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.43 1 0.64 0.08 2 2 27.5657 26.7614 0.8043 0.17 0.49 0.71 1.32 1.55 0.24
42 10-840 88 27.2759 26.5913 0.6845         30                                
43 10-841a 100 29.5738 29.4729 0.1009     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 2.45 2 0.54 0.04 2 2 29.4326 29.4046 0.0280 0.10 -0.29 1.22 2.33 2.57 0.25
44 10-841a 112 29.2914 29.3362 -0.0448         30                                
45 10-851 124 28.3263 27.5588 0.7675     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.47 1 0.54 0.21 2 2 28.4437 27.6759 0.7678 0.00 0.45 0.73 1.47 1.47 0.00
46 10-851 136 28.5610 27.7930 0.7681         30                                
47 10-852 148 30.2858 28.7397 1.5461     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 0.95 1 0.88 0.10 2 2 30.2402 28.8478 1.3923 0.22 1.07 0.48 0.85 1.06 0.20
48 10-852 160 30.1945 28.9560 1.2385         30                                
49 10-853 172 28.1041 26.9046 1.1996     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.24 1 0.67 0.07 2 2 28.1004 27.0935 1.0069 0.27 0.69 0.62 1.09 1.42 0.33
50 10-853 184 28.0966 27.2824 0.8141         30                                
51 10-855 196 28.5320 27.6260 0.9059     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.41 1 0.54 0.14 2 2 28.2425 27.4197 0.8228 0.12 0.50 0.71 1.33 1.49 0.16
52 10-855 208 27.9531 27.2134 0.7397         30                                
53 10-856 220 30.8922 29.9638 0.9285     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.39 1 0.56 0.14 2 2 30.7272 29.8794 0.8478 0.11 0.53 0.69 1.31 1.47 0.16
54 10-856 232 30.5622 29.7950 0.7672         30                                
55 10-857 244 28.0393 27.7658 0.2735     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.70 2 < 0.50 0.21 2 2 28.5126 27.9583 0.5543 0.40 0.24 0.85 1.40 2.06 0.67
56 10-857 256 28.9860 28.1508 0.8352         30                                
57 10-861 268 28.4795 27.4950 0.9844     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.23 1 0.71 0.05 2 2 27.9007 26.8827 1.0181 0.05 0.70 0.62 1.20 1.26 0.06
58 10-861 280 27.3220 26.2703 1.0517         30                                
59 10-865 292 29.0294 28.4032 0.6263     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.51 2 < 0.50 0.52 2 2 29.2855 28.5585 0.7271 0.14 0.41 0.75 1.41 1.62 0.21
60 10-865 304 29.5416 28.7138 0.8279         30                                
61 10-867 316 27.1564 26.3966 0.7597     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 1.51 2 < 0.50 0.62 2 2 26.9597 26.2318 0.7279 0.05 0.41 0.75 1.47 1.54 0.07
62 10-867 328 26.7630 26.0670 0.6960         30                                
63 DNActrl 364 24.1089 23.7190 0.3899     MAP2K4ex4in4 RNase P 30 2.00 2 < 0.50 0.08 2 2 24.0244 23.7051 0.3193 0.10 0.00 1.00 1.90 2.10 0.20
64 DNActrl 376 23.9398 23.6912 0.2486         30                                
65 NTC 340 undetermined undetermined undetermined x NTC MAP2K4ex4in4 RNase P 30         2                    
66 NTC 352 undetermined undetermined undetermined x NTC     30